home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ NetNews Usenet Archive 1992 #20 / NN_1992_20.iso / spool / comp / archives / 3308 < prev    next >
Encoding:
Internet Message Format  |  1992-09-08  |  3.0 KB
  1. Path: sparky!uunet!olivea!spool.mu.edu!agate!agate!usenet
  2. From: excoffie@sc2a.unige.ch
  3. Newsgroups: comp.archives
  4. Subject: [bionet.molbio.evolution] Analysis of Molecular Variance : A Windows 3.0 program
  5. Message-ID: <18kbijINNovc@agate.berkeley.edu>
  6. Date: 9 Sep 92 08:10:59 GMT
  7. References: <1992Sep8.151500.1@sc2a.unige.ch>
  8. Followup-To: bionet.molbio.evolution
  9. Organization: University of Geneva, Switzerland
  10. Lines: 69
  11. Approved: adam@soda.berkeley.edu
  12. NNTP-Posting-Host: soda.berkeley.edu
  13. X-Original-Newsgroups: bionet.molbio.evolution
  14. X-Original-Date: Tue, 8 Sep 1992 13:15:00 GMT
  15.  
  16. Archive-name: auto/bionet.molbio.evolution/Analysis-of-Molecular-Variance-A-Windows-3-0-program
  17.  
  18.  
  19.   This is an annoucement for the public release of a WINDOWS 3.x based program
  20.  
  21. to analyze the GENETIC STRUCTURE OF POPULATIONS using MOLECULAR INFORMATION.
  22.  
  23.  
  24.   This program (WINAMOVA ver 1.04) is based on a paper by Excoffier, Smouse and 
  25.  
  26. Quattro (1992), and computes variance components for 2 levels of population 
  27.  
  28. structure as well as their associated modified F-statistics (called here Phi-
  29.  
  30. statistics).
  31.  
  32.  
  33.   This version can handle a maximum of 255 molecular haplotypes, 100 populations
  34.  
  35. and 100 groups of populations. It requires haplotype frequency information for
  36.  
  37. each population, as well as a matrix of inter-haplotypic squared (euclidian) 
  38.  
  39. distances. 
  40.  
  41.  
  42.   Conventional multi-allelic F-statistics may also be computed.
  43.  
  44.  
  45.   The program includes a non-parametrical (permutational) test for the 
  46.  
  47. significance of both variance components and Phi-statistics.
  48.  
  49.  
  50.   It can be uploaded by anonymous FTP from    : ACASUN1.UNIGE.CH
  51.  
  52. (username : anonymous) in the directory       :  pub/amova
  53.  
  54. under the form of an archived file called WINAMOVA.ZIP, including 
  55.  
  56. executable versions for Windows 3.0 and Windows 3.1, plus example files.
  57.  
  58.  
  59.            The program is FREEWARE and can be distributed freely in its 
  60.            original form, but I would appreciate receiving an E-mail from
  61.            interested users, as well as comments, suggestions, and bug
  62.            reports.
  63.  
  64. (Windows 3.x is a product from Microsoft Corporation)
  65.  
  66.  
  67.   Reference cited :
  68.   =================
  69.  
  70. Excoffier, L, Smouse, PE, and Quattro, JM (1992) Analysis of molecular variance
  71.       inferred from metric distances among DNA haplotypes: Application to human
  72.       mitochondrial DNA restriction data. Genetics 131:479-491.
  73.  
  74.  
  75. *******************************************************************************
  76. *                                                                             *
  77. *  Laurent Excoffier                                          *    
  78. *  Genetics and Biometry Laboratory           Tel    : 41-22-343.69.30        *
  79. *  Dept. of Anthropology and Ecology                           *    
  80. *  University of Geneva                       Fax    : 41-22-300.03.51        *
  81. *  12, rue Gustave Revilliod                                        *    
  82. *  1227 Carouge-Geneva, Switzerland           E-mail : excoffie@sc2a.unige.ch *
  83. *                                          *    
  84. *******************************************************************************
  85.