home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ The Pier Shareware 6 / The_Pier_Shareware_Number_6_(The_Pier_Exchange)_(1995).iso / 026 / med9408e.zip / M9480880.TXT < prev   
Text File  |  1994-09-05  |  3KB  |  44 lines
  1.        Document 0880
  2.  DOCN  M9480880
  3.  TI    Conserved sequence homology of cysteine rich regions in genes encoding
  4.        glycoprotein A in Pneumocystis carinii derived from different host
  5.        species.
  6.  DT    9410
  7.  AU    Wright T; Haidaris P; Gigliotti F; Harmsen A; Haidaris C; University of
  8.        Rochester, NY.
  9.  SO    Abstr Gen Meet Am Soc Microbiol. 1994;94:141 (abstract no. D-253).
  10.        Unique Identifier : AIDSLINE ASM94/94313065
  11.  AB    Pneumocystis carinii (Pc) surface glycoprotein A (gpA) exhibits
  12.        host-species specific phenotypic and genotypic variation. Despite this
  13.        heterogeneity, the gpAs of Pc isolated from different host species
  14.        appear to be homologous molecules sharing certain biochemical and
  15.        antigenic characteristics. Using two degenerate oligodeoxyribonucleotide
  16.        primers corresponding to conserved Cys regions from ferret and rat Pc
  17.        gpA, a polymerase chain reaction (PCR) product of approximately 300 bp
  18.        was amplified from ferret, rat, and SCID mouse Pc-infected lung genomic
  19.        DNA. Northern hybridization revealed a transcript of 3450 nucleotides in
  20.        Pc-infected SCID mouse lung mRNA, which is similar in size to the
  21.        transcripts for ferret and rat Pc gpA. Nucleotide sequence analysis of
  22.        SCID mouse P. carinii gpA subclones derived from the PCR products
  23.        identified two isoforms, which were 89% identical to each other in the
  24.        amplified region, and 73% and 54% identical to the rat and ferret
  25.        derived Pc gpA genes, respectively. Comparison of the deduced amino acid
  26.        sequences of mouse, ferret and rat Pc gpAs revealed striking similarity
  27.        in residues adjacent to and including the conserved Cys. Furthermore,
  28.        the spacing of two Pro residues is invariant, and a potential N-linked
  29.        glycosylation site is found at a similar position in all of the gpAs.
  30.        Despite the heterogeneity observed in Pc gpA, the conservation of Cys
  31.        residues and adjacent sequences implies similar secondary structure and,
  32.        therefore, function for the gpAs of Pc isolated from different host
  33.        species.
  34.  DE    Animal  Base Sequence  Blotting, Northern  Comparative Study  *Conserved
  35.        Sequence  Cysteine  Ferrets  Fungal Proteins/BIOSYNTHESIS/*GENETICS
  36.        *Genes, Fungal  Lung/MICROBIOLOGY  Membrane
  37.        Glycoproteins/BIOSYNTHESIS/*GENETICS  Mice  Mice, SCID  Pneumocystis
  38.        carinii/*GENETICS/ISOLATION & PURIF  Polymerase Chain Reaction/METHODS
  39.        Proline  Rats  RNA, Messenger/BIOSYNTHESIS  MEETING ABSTRACT
  40.  
  41.        SOURCE: National Library of Medicine.  NOTICE: This material may be
  42.        protected by Copyright Law (Title 17, U.S.Code).
  43.  
  44.