home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ The Pier Shareware 6 / The_Pier_Shareware_Number_6_(The_Pier_Exchange)_(1995).iso / 026 / med9408e.zip / M9480879.TXT < prev    next >
Text File  |  1994-09-05  |  2KB  |  39 lines
  1.        Document 0879
  2.  DOCN  M9480879
  3.  TI    Sequence variations in the internal transcribed spacers of the ribosomal
  4.        RNA genes of Pneumocystis carinii strains that infect humans.
  5.  DT    9410
  6.  AU    Lu J; Lee C; Bartlett M; Smith J; Indiana Univ. Sch. of Med.,
  7.        Indianapolis.
  8.  SO    Abstr Gen Meet Am Soc Microbiol. 1994;94:141 (abstract no. D-255).
  9.        Unique Identifier : AIDSLINE ASM94/94313066
  10.  AB    Pneumocystis carinii is a major cause of life-threatening pneumonia in
  11.        immunocompromised patients. It is unknown at present whether the P.
  12.        carinii infecting humans represents a single type of organism or a group
  13.        of organisms. To answer this question, we have examined the nucleotide
  14.        sequences of the internal transcribed spacers ITS1 and ITS2 of the
  15.        ribosomal RNA genes of P. carinii in bronchoalveolar lavage specimens
  16.        from 10 different patients. Oligonucleotide primers were designed to
  17.        amplify the ITS1 and ITS2 regions separately or together by polymerase
  18.        chain reaction and the nucleotide sequences of the amplified fragments
  19.        were determined. Analysis of the nucleotide sequences revealed that
  20.        sequence variations exist in both the ITS1 and ITS2 regions of P.
  21.        carinii. We found 4 types of ITS1 (designated A, B, C, and D) and 4
  22.        types of ITS2 (designated a, b, c, d) sequences. Based on this
  23.        information, we classified the P. carinii strains from the 10 patients
  24.        into 5 types: Ab, Bd, Ca, Cb and Db. We also found that two patients
  25.        were infected by two different types of P. carinii concurrently. The
  26.        results of this study suggest that sequence variation in the ITS regions
  27.        of rRNA genes of P. carinii can be used to subtype human P. carinii
  28.        strains and that coinfection with more than one strain of P. carinii in
  29.        the same patient is possible.
  30.  DE    Base Sequence  Comparative Study  DNA, Ribosomal/CHEMISTRY/*GENETICS
  31.        *Genes, Fungal  Human  Pneumocystis
  32.        carinii/CLASSIFICATION/*GENETICS/ISOLATION & PURIF  Pneumonia,
  33.        Pneumocystis carinii/*MICROBIOLOGY  RNA, Ribosomal/GENETICS
  34.        Transcription, Genetic  *Variation (Genetics)  MEETING ABSTRACT
  35.  
  36.        SOURCE: National Library of Medicine.  NOTICE: This material may be
  37.        protected by Copyright Law (Title 17, U.S.Code).
  38.  
  39.