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/ The Datafile PD-CD 5 / DATAFILE_PDCD5.iso / rasmol / scipts / mhc / !MHC / MHCCONT2_S < prev    next >
Text File  |  1995-10-31  |  631b  |  25 lines
  1. script clrleg.scr
  2. echo This is from a theoretical model which (unlike real X-ray
  3. echo diffraction structures) includes hydrogens.  The atoms of
  4. echo the green peptide which contact the groove are spacefilled.
  5. echo The contacting groove atoms are shown as smaller spheres.
  6. select :a
  7. backbone 0.3
  8. color structure
  9. pause
  10.  
  11. backbone off
  12. color cpk
  13.  
  14. set fontsize 12
  15. select atomno=1945
  16. label Terminal COOH
  17. select atomno=1856
  18. label Terminal NH3+
  19. color label yellow
  20. echo
  21. echo Notice that nearly all contacts are hydrogen bonds
  22. echo The ends of peptide and the anchor residues are the major
  23. echo bonding points.
  24. pause
  25.