home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ NetNews Usenet Archive 1992 #19 / NN_1992_19.iso / spool / comp / ai / 3322 < prev    next >
Encoding:
Internet Message Format  |  1992-09-03  |  10.9 KB
  1. Xref: sparky comp.ai:3322 comp.ai.neural-nets:3383
  2. Newsgroups: comp.ai,comp.ai.neural-nets
  3. Path: sparky!uunet!convex!darwin.sura.net!zaphod.mps.ohio-state.edu!rpi!sarah!cook!hipparchus.albany.edu!berg
  4. From: berg@cs.albany.edu (George Berg)
  5. Subject: Computational Biology Conference
  6. Message-ID: <BERG.92Sep3114855@hipparchus.albany.edu>
  7. Originator: berg@hipparchus.albany.edu
  8. Sender: berg@cs.albany.edu (George Berg)
  9. Organization: Computer Science Department, SUNY at Albany, Albany, NY 12222
  10. Distribution: comp
  11. Date: Thu, 3 Sep 1992 16:48:55 GMT
  12. Lines: 260
  13.  
  14.  
  15.   * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * *
  16.   *                 FINAL CALL FOR PARTICIPANTS                   *
  17.   *                                                               *
  18.   *       SECOND ALBANY CONFERENCE ON COMPUTATIONAL BIOLOGY       *
  19.   *                                                               *
  20.   *            "PATTERNS OF BIOLOGICAL ORGANIZATION"              *
  21.   *                                                               *
  22.   * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * *
  23.            *                                             *
  24.            *  YOUNG INVESTIGATOR AND DISCUSSANT AWARDS   *
  25.            *                                             *
  26.            * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * *
  27.  
  28.  
  29. GENERAL CONFERENCE DESCRIPTION
  30.  
  31. The Second Albany Conference on Computational Biology will be held
  32. October 8-11, 1992 in Rensselaerville near Albany, New York.  The aim of
  33. this conference (like that of the 1990 Albany Conference) is to explore
  34. the computational tools and approaches being developed in diverse fields
  35. within biology, with emphasis this year on topics related to organization
  36. and self-assembly.  The conference will be designed to provide an
  37. environment for a frank and informal exchange among scientists and
  38. mathematicians that is not normally possible within the constraints of
  39. topical, single-discipline meetings.  The theme of the Conference,
  40. "Patterns of Biological Organization", will be developed in five sessions
  41. on topics ranging from the level of sequence to the level of embryo
  42. development.  Leading specialists in the various disciplines are being
  43. invited, with the degree of involvement in novel computational approaches
  44. as one of the most important criteria for selection.
  45.  
  46.  
  47. MEETING AWARDS FOR MATHEMATICIANS AND YOUNG SCIENTISTS
  48.  
  49. We are seeking an interdisciplinary audience: mathematicians and
  50. computer scientists as well as biologists.  To encourage participation
  51. of mathematics and computer science specialists outside the area of
  52. biology, we will award waivers of meeting fees ($475 each) to three who
  53. are willing to serve as discussants at the meeting.  Also, fees will be
  54. waived for ten "young investigators" (graduate students, postdocs,
  55. junior faculty), to be selected from among the specialties represented
  56. at the conference.  Individuals seeking either type of award should
  57. submit an application (see below) and include a CV and a short letter
  58. explaining their interest in attending the meeting.  "Young
  59. Investigator" awardees will be expected to submit a poster and so
  60. applicants should include an abstract with their application.
  61.  
  62.  
  63. CONFERENCE FORMAT
  64.  
  65. The conference will consist of three morning and two evening sessions
  66. over a period of three nights and days (Thursday afternoon through Sunday
  67. morning).  Each session will be comprised of three or four 30-minute talks
  68. interspersed by question-and-answer periods of 15-20 minutes.
  69. Afternoons are free for discussion, viewing posters (which all
  70. participants are invited to bring), and workshops (some planned, others
  71. impromptu). Workshop titles include "structure data bases" and
  72. "mechanisms of morphogenesis".  In addition, a workshop is planned for
  73. Thursday afternoon that will introduce non-biologists to the main issues
  74. of macromolecular and cellular structure to be addressed at the meeting.
  75.  
  76.  
  77. CONFERENCE SESSIONS AND SPEAKERS
  78.  
  79. Keynote Address  Thursday PM
  80. ----------------------------
  81.               Prof. Hermann Haken, Univ. Stuttgart
  82.               Concepts of Bio-synergetics
  83.  
  84.  
  85. Session 1  Friday AM  Sequence analysis and secondary structure
  86. ---------------------------------------------------------------
  87. Discussion leader: George Berg
  88.                    The University at Albany (SUNY)
  89.                    518-442-4267
  90.                    BERG@CS.ALBANY.EDU
  91.  
  92. Speakers: David L. Waltz, Thinking Machines, Inc.
  93.           Protein secondary structure prediction using hybrid
  94.           representation
  95.  
  96.           Jean Michel Claverie, NCBI, NIH
  97.           Gene identification
  98.  
  99.           Michael Zuker, National Research Council of Canada
  100.           Structural analysis by energy dot plot of a large mRNA
  101.  
  102.           Stephen Altschul, NCBI, NIH
  103.           Scoring systems for macromolecular sequence comparison
  104.  
  105.  
  106. Session 2  Friday PM  Macromolecular function
  107. ---------------------------------------------
  108. Discussion leader: Jacquelyn Fetrow
  109.                    The University at Albany (SUNY)
  110.                    518-442-4389
  111.                    JACQUE@ISADORA.ALBANY.EDU
  112.  
  113. Speakers: Judith Hempel, Biosym Technologies, Inc.
  114.           Conformational analysis of peptides and protein loop regions
  115.  
  116.           Fred E. Cohen, UCSF
  117.           Pharmaceutical design from protein structure
  118.  
  119.           Chris Lee, Stanford University
  120.           Steric fit in protein stability and substrate specificity
  121.  
  122.           Francois Michel, Centre de Genetique Moleculaire, CNRS (France)
  123.           Three-dimensional architecture of a catalytic RNA, as revealed
  124.           by comparative sequence analysis
  125.  
  126.  
  127. Session 3  Saturday AM  Development
  128. -----------------------------------
  129. Discussion leader: John Reinitz
  130.                    Yale Univ., New Haven, CT
  131.                    203-785-7049
  132.                    REINITZ-JOHN@CS.YALE.EDU
  133.  
  134. Speakers: Michael Levine, UC-San Diego
  135.           The transcriptional control of stripes in the Drosophila
  136.           embryo
  137.  
  138.           John Reinitz, Yale University
  139.           Circuitry from gene expression
  140.  
  141.           George Oster, UC-Berkeley
  142.           Brownian machines
  143.  
  144.           Stuart A. Newman, New York Medical College
  145.           Generic physical mechanisms as templates for development
  146.           and evolution.
  147.  
  148.  
  149. Session 4  Saturday PM  Recognition and assembly
  150. ------------------------------------------------
  151. Discussion leader: Joachim Frank
  152.                    Wadsworth Center and State Univ. of New York, Albany
  153.                    518-474-7002
  154.                    JOACHIM@TETHYS.PH.ALBANY.EDU
  155.  
  156. Speakers: David DeRosier, Brandeis University
  157.           Structure and assembly of the bacterial flagellum: protein
  158.           folding linked to flagellin polymerization
  159.  
  160.           Phoebe L. Stewart, The Wistar Institute
  161.           Bridging the resolution gap between x-ray crystallography
  162.           and electron microscopy
  163.  
  164.           John Sedat, UCSF
  165.           Visualization and analysis of multidimensional cellular
  166.           structures
  167.  
  168.  
  169. Session 5  Sunday AM  Tertiary structure prediction
  170. ---------------------------------------------------
  171. Discussion leader: Charles Lawrence
  172.                    Wadsworth Center, and State Univ. of New York, Albany
  173.                    518-473-3382
  174.                    CEL@BIOMETRICS.PH.ALBANY.EDU
  175.  
  176. Speakers: Rick Fine, Biosym Technologies, Inc.
  177.           Towards reliable modeling of antibody combining sites:
  178.           insights from canonical structures, conformational search,
  179.           and solvation analysis
  180.  
  181.           Stephen Bryant, NCBI, NIH
  182.           A residue contact potential for threading sequence through
  183.           folding motif
  184.  
  185.           James U. Bowie, UCLA
  186.           Assessing the compatibility of a protein sequence with a
  187.           three-dimensional structure
  188.  
  189.  
  190. CONFERENCE ORGANIZERS
  191.  
  192. Joachim Frank (Co-chair), Carmen Mannella (Co-chair), Charles Lawrence,
  193. Patrick Van Roey; Wadsworth Center for Laboratories and Research (New York
  194. State Department of Health) and School of Public Health (SUNY)
  195.  
  196. Jacquelyn Fetrow, George Berg; The University at Albany (SUNY)
  197.  
  198. Jeffrey Bell; Rennselaer Polytechnic Institute: 
  199.  
  200. John Reinitz; Yale University
  201.  
  202. Steven Bryant; National Center for Biotechnology Information (NIH): 
  203.  
  204.  
  205. CONFERENCE SITE
  206.  
  207. The conference, one of the Albany Conference series held annually since
  208. 1984, will take place at the Rensselaerville Conference Center, located 30
  209. miles southwest of Albany, NY in the Helderberg Mountains.  The Institute
  210. offers on-campus facilities including a large auditorium with
  211. audio-visual equipment and smaller conference halls for informal workshops
  212. and poster sessions.  The Weathervane Restaurant, located on-campus and
  213. formerly the carriage house of the Huyck estate, provides meals and
  214. refreshments, while overnight lodging is available in the modern & classic
  215. estate houses. Rooms are assigned in advance to registrants, and
  216. transportation to and from Rensselaerville is provided from the airport,
  217. train and bus stations.  The rural, secluded setting of the conference,
  218. the limited number of participants and the scheduling of sessions in the
  219. morning and the evening -- leaving the afternoons free -- are intended
  220. to facilitate informal discussions among conference participants.
  221.  
  222.  
  223. REGISTRATION INFORMATION
  224.  
  225. CONFERENCE FEE: $475 includes registration, accomodations (double occ.),
  226. meals and transportation between the conference center and Albany airport.
  227. Payment of the full fee will be required by SEPT. 31, 1992.  Please note
  228. that neither the Albany Conferences nor the Rensselaerville Conference
  229. Center accepts credit cards.
  230.  
  231. APPLICATION DEADLINE: SEPTEMBER 10, 1992
  232.  
  233. For further registration information contact:
  234. Conference coordinator, Carole Keith, 518-442-4327, FAX 518-442-4767,
  235. carole@uacsc2.albany.edu - or send your application & abstract (unfolded)
  236. to The Albany Conference, P.O. Box 8836, Albany, NY 12208-0836.
  237.  
  238. MEETING AWARDS
  239.  
  240. Graduate students, postdocs, and junior faculty who would like to be
  241. considered for a Young Investigator award should submit with the
  242. registration form - a CV, a brief letter explaining research interests
  243. and a poster abstract.  Graduate students should also include a letter of
  244. recommendation from a faculty advisor.
  245.  
  246. Mathematicians and computer scientists who would like to apply for a
  247. Discussant award should include a CV and a brief statement explaining
  248. how their expertise relates to the theme of the meeting.
  249.  
  250. Applications from members of groups that are underrepresented in this
  251. field (women and racial minorities) are strongly encouraged. 
  252.  
  253. -  -  -  -  -  -  -  -  -  -  -  -  -  -  -  -  -  -  -  -  -  -  -  -
  254.  
  255. You may use the following "E-Mail application form" to register:
  256.  
  257. Name:
  258.  
  259. Organization:
  260.  
  261. Business Address:
  262.  
  263. City:                               State:        Zip:
  264.  
  265. Business Phone:                     Fax:
  266.  
  267.  
  268. If you plan to submit a poster, please include its title and (if
  269. ready) a short abstract.  (You will be asked to provide by Sept. 16 a
  270. one-page, camera-ready version of the poster abstract, using 1.5 inch
  271. borders, for the meeting workbook.)  Indicate if you wish to be 
  272. considered for a Young Scientist or Discussant Award.
  273.  
  274.