home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ NetNews Usenet Archive 1993 #3 / NN_1993_3.iso / spool / rec / equestri / 6956 < prev    next >
Encoding:
Internet Message Format  |  1993-01-23  |  15.3 KB

  1. Path: sparky!uunet!paladin.american.edu!howland.reston.ans.net!usc!cs.utexas.edu!asuvax!ncar!noao!amethyst!organpipe.uug.arizona.edu!news
  2. From: tracy@scoraz.resp-sci.arizona.edu (Tracy Scheinkman)
  3. Newsgroups: rec.equestrian
  4. Subject: re: horse color genetics program
  5. Message-ID: <1993Jan22.203543.18131@organpipe.uug.arizona.edu>
  6. Date: 22 Jan 93 20:35:43 GMT
  7. Sender: news@organpipe.uug.arizona.edu
  8. Organization: University of Arizona, Tucson, AZ
  9. Lines: 259
  10.  
  11.  
  12.     Since this subject has come up again I thought I'd post the info
  13. that I have.
  14.     First, color inheritance in horses is NOT governed by a single gene.
  15. Hair color of horses like hair color of humans and other mammals is governed
  16. by many genes interacting with each other.  
  17.     To a certain extent it can be thought of as a series of transparent 
  18. overlays with a figure of a horse underneath, what color the horse is 
  19. depends on which overlay is uppermost and how much of the underlying colors 
  20. it allows to show through.  For example in the case of a horse which has
  21. both a gene for roan R and a gene for grey G, both of which are dominant
  22. genes, you will not be able to tell that the horse has a roan gene because
  23. the greying covers it up.  The only hint you would have would be when the
  24. foal is just born if their coat is about half white hairs mixed evenly with
  25. the backround color, except at the head where roans do not have as many
  26. white hairs as greys, then you would know that the foal carried roan coloring
  27. but shortly thereafter the foal's coat would begin to grey out as the grey
  28. gene is a progressive whitener of the coat.  Thus as an adult the horse could
  29. conceivably carry a roan gene and yet look perfectly white.
  30.     Now on to the next lesson.  Genes always come in pairs.  Geneticists
  31. label them with a capital letter if the gene is dominant or a small letter
  32. if recessive thus G represents grey color and is dominant, g represents non-
  33. grey and is recessive.  In order to see a recessive color both genes in a
  34. pair must be recessive thus a bay horse would have gg at the grey gene 
  35. location (called a locus) and a grey horse would either be GG or Gg.  Got it?
  36.     Next, not all books use the same lettering system for different
  37. genes a gene called A in one book might be B in another.  Just look for
  38. consistency within the book or article itself.  The book I will be referring
  39. to is called Horse Color and was written by D. Phillip Sponenberg,Phd.,DVM and
  40. Bonnie V. Beaver, DVM.  Sponenberg is a researcher with a university in 
  41. Virginia, I believe, and is still doing research into horse color.  This is a 
  42. wonderfully complete book which includes over a hundred color photographs 
  43. of the various coat colors and patterns they discuss.  The appaloosa 
  44. information which is in the book is incorrect and Sponenberg has recently
  45. published new information on appaloosa inheritance which I have tried to 
  46. include here (see Equus, April 1990 issue).
  47.  
  48.     Horses have the possibility of two different color pigments, eumelanin,
  49. which is responsible for black and chocolate brown horses and the black in a
  50. bay's mane and tail, and phaeomelanin, which is responsible for the red or
  51. yellow color of sorrels, chestnuts, palominos, and the red body on clear
  52. bays.  Now we're ready for the genes themselves.
  53.     A    a dominant gene is responsible for bay horses by restricting
  54.         eumelanin to the points meaning the mane, tail, and legs of the
  55.         horse, the rest of the horse has red, phaeomelanin, pigment
  56.         (note the exception: dark mahogany bays and seal browns
  57.         have other genetic elements at work, mahogany bays have an
  58.         additional gene allowing some eumelanin, seal browns are
  59.         actually genetically black with another gene P causing 
  60.         light areas on muzzle and flanks)
  61.     a    this recessive gene is responsible for black and uniform
  62.         chocolate brown horses, a common color for Morgans and
  63.         some Quarter Horses, this gene allows eumelanin over the
  64.         whole horse uniformly (as compared with A which restricts
  65.         eumelanin to the points)
  66.     B    this gene is for the black variety of eumelanin
  67.     b    this recessive gene is for the brown variety of eumelanin, the
  68.         difference apparently is in the microscopic arrangement
  69.         of pigment molecules, these horses also tend to have
  70.         amber or light brown eyes and pinkish brown skin, in order
  71.         to have a uniform chocolate brown horse then the horse must
  72.         be aabb, if it is A-bb then it is a bay with brown points
  73.         instead of black points(red body, brown mane tail and legs)
  74.         this gene is only a factor in a few breeds most notably
  75.         Morgan and Quarter Horse
  76.     C    this gene means that the horse's color is fully expressed,
  77.          non-dilute
  78.      cr
  79.     c      this recessive gene is the cremello gene it dilutes phaeo-
  80.         melanin markedly, eumelanin a little, it is responsible
  81.         for blue-eyed light cream or white horses that some
  82.         call Albinos (true name is cremello if chestnut is diluted,
  83.         perlino if bay is diluted), however there is no true Albino 
  84.         gene for horses, this gene is also incompletely recessive so 
  85.         when big C and little c-cr are present in one gene pair a horse
  86.         that would otherwise have been chestnut or bay would be
  87.         instead palomino or buckskin respectively.  Fascinating, huh!
  88.     D    a dominant dilution gene is responsible for all dun horses 
  89.         except claybank duns which are mostly c-cr horses, this gene
  90.         dilutes body color but not point color, duns have 
  91.         dorsal stripes, some also have leg striping, black becomes
  92.         grullo when D is present, chestnut becomes red dun, bays
  93.         become line-backed buckskins, other examples of dun colors are 
  94.         lilac dun, olive grullo, line-backed palomino, zebra dun, 
  95.         yellow dun, etc. the dun gene D can act in concert with 
  96.         other dilution genes, for example with Cc-cr in the case of 
  97.         a chestnut D- would produce a line-backed palomino
  98.     d    non-dun
  99.     E    this dominant gene allows eumelanin at the points meaning
  100.         it allows bay and black this allowance of black color
  101.         becomes important because of the next gene
  102.     e    this recessive gene causes phaeomelanin red or yellow
  103.         over the WHOLE body and points of the horse in other words 
  104.         chestnut, sorrel, or palomino, this gene is said to be 
  105.         epistatic to the A locus this means that if two e genes are 
  106.         present they cover up the effects of A or a, think of it as 
  107.         opaque plastic overlays the horse might have been black, bay, 
  108.         or chocolate brown according to its other genes but because of 
  109.         ee it's red (note: sorrel and chestnut both generally refer to 
  110.         the same color genetically, red, however different breed 
  111.         associations refer to the lighter phases of the color 
  112.         differently than the darker phases of the color, to further 
  113.         complicate things different breed associations do not agree as 
  114.         to what term shall cover what shade of color)
  115.      d
  116.     E     the proof for this gene is incomplete, this is a dominant
  117.         gene at the E locus that causes the color called jet black
  118.         which is a non-sun-fading black color mostly seen on
  119.         Clydesdales and a very few other large breeds it is not
  120.         present for example in Arabians whose black color when
  121.         present comes solely from the normal recessive mechanism
  122.     F    normal red mane and tail on ee, chestnut or sorrel horses
  123.     f    flaxen mane and tail on chestnut or sorrel horses
  124.     G    grey, this dominant gene is like a transparent plastic
  125.         overlay, when the foal is born whatever color it would
  126.         have been without the G shows through, thus it is black,
  127.         or chestnut or bay or whatever, then as it grows older
  128.         it progressively whitens as each new coat gets more and
  129.         more white hairs mixed into it
  130.     g    non-grey
  131.     P    pangare (pronounced pan-gar-ray), this causes light areas
  132.         on muzzle, over eyes, on flanks, stomach, it causes
  133.         black to become seal brown and chestnut with flaxen mane
  134.         to become blond    sorrel
  135.     p    non-pangare
  136.     Sty    smutty, causes some black to become mixed into body coat
  137.         clear sorrel becomes chestnut or liver chestnut, clear bay
  138.         becomes mahogany bay, palomino becomes smutty palomino, etc.
  139.     sty    recessive causes clear pure color, a clear pure red is 
  140.         often called sorrel among Thoroughbreds and Quarter Horses
  141.         other breeds call this chestnut
  142.     Z    silver dapple, causes eumelanin to be diluted to flaxen usually
  143.         a little eumelanin remains in the coat, silver dapple bays are
  144.         possible when the eumelanin in the mane and tail are diluted
  145.         causing the mane and tail to have a silvery color to them
  146.         because of some of the remaining black hairs, this gene is 
  147.         really only a factor for breeds such as Shetlands, Icelandics, 
  148.         Dutch Warmbloods, and Norwegian Fjords, Norwegian Fjords may 
  149.         have a combination of silver dapple and dun genes
  150.     z    non-silver-dapple 
  151.     R    roan, causes white hairs to be mixed with base coat color,
  152.         this color is non-progressive as opposed to grey which
  153.         is a progressive whitener, though it does change a little
  154.         with the seasons, roans often have fewer white hairs mixed in
  155.         to the base coat on the face and legs than on the body, also 
  156.         this gene is thought to be a dominant lethal meaning that RR 
  157.         horses die during development, most roans are Rr and throw 
  158.         solid colored foals as well as roans, Dutch and Brabant draft 
  159.         horses may be an exception to this rule and if so roans in 
  160.         those breeds are probably due to some other mechanism
  161.     r    non-roan
  162.     T    tobiano paint spotting, this paint color has bold sharp edges
  163.         and has white in a vertical pattern that often crosses the spine
  164.         the face and legs are usually dark the amount of white is 
  165.         governed by independent modifiers and can be selected for, 
  166.         thus a tobiano with a lot of white will tend to have foals with
  167.         a lot of white, homozygous tobianos, meaning TT horses, will 
  168.         throw 100% tobiano color
  169.     t    non-tobiano
  170.     O    non-overo
  171.     o    overo paint spotting, also called frame overo, there is some 
  172.         argument over whether this gene is recessive or dominant, the
  173.         color tends to splash in a horizontal pattern with sharp edges
  174.         that rarely crosses the spine, the legs and face are often 
  175.         white, blue eyes are common, overos that are mostly or all 
  176.         white die within a few days of birth because of a malfunction 
  177.         of the colon, there may be another gene at this locus that is 
  178.         responsible for these lethal white overos, the amount of white 
  179.         caused by this recessive gene is governed by an unknown 
  180.         mechanism possibly womb temperature maybe independent genes 
  181.         but cannot be selected for, overos often throw solid or nearly 
  182.         solid foals 
  183.     Sb     sabino paint spotting, often confused with overo, this may be 
  184.         an example of incomplete dominance such that homozygous horses 
  185.         SbSb have more extreme patterning and markings than 
  186.         heterozygous horses Sbsb, this pattern is typified by extremely
  187.         ragged margins rarely crosses the spine and blue eyes are 
  188.         common, the minimum expression seems to be high white 
  189.         stockings and extreme facial white, this gene is common amongst
  190.         Clydesdales where the color is sometimes erroneously called 
  191.         roan, many sabino horses exhibit the Medicine Hat pattern 
  192.         popular among some breeds such as the North American Spanish, 
  193.         pure white foals develop normally in contrast with overos
  194.     sb    non-sabino
  195.     Note: the term tovero refers to a horse which exhibits a combination
  196.         of overo and tobiano patterning, such horses would be 
  197.         genetically T-oo, a horse that is genetically T-ooSb is 
  198.         theoretically possible, either tovero or sabino horses may
  199.         exhibit the Medicine Hat pattern
  200.     Rb     rabicano, which is a white hairs starting at the dock of the
  201.         horse's tail and sometimes white hairs mixed in the flank area
  202.     rb    non-rabicano
  203.     W    dominant white, neither this gene nor the c-cr genes are true 
  204.         albino genes as some pigment is still present, the skin of
  205.         dominant white horses is pink, the eyes of such horses are 
  206.         usually brown, this is a dominant lethal gene meaning that all 
  207.         dominant white horses are Ww, the WW form apparently dies in
  208.         development there are no exceptions
  209.     w    non-white
  210.     Apl    non-appaloosa, to be a non-appaloosa the horse must be
  211.         Apl Apl
  212.     apl    this is another incompletely recessive gene, apl apl horses
  213.         are the few spot appaloosas that produce 100% appaloosa
  214.         babies no matter who they are mated to, Apl apl horses are
  215.         the brightly patterned appaloosas we are most familiar with,
  216.         other modifier genes cause the different patterns -- leopard,
  217.         blanket, varnish roan, etc. -- combination patterns are 
  218.         common, for example I once saw a black varnish roan with a 
  219.         white blanket over the rump and leaopard spots over the 
  220.         whole horse, there may be other appaloosa mechanisms that 
  221.         are unknown currently (note: the grey gene has the same affect 
  222.         on appaloosa pattern spots and splashes that it has on solid 
  223.         colored horses and eventually such appaloosas that carry the 
  224.         G grey gene will become completely white just as solid grey 
  225.         horses do, in those cases the skin under the white hairs is 
  226.         often visible and is pink in the blanket areas and dark where 
  227.         the spots or solid areas were, thus an all white horse with 
  228.         pink skin and a few oval spots of dark skin may actually be a 
  229.         few spot appaloosa that has turned grey) currently there are
  230.         about eight different known appaloosa patterns, there may be
  231.         a form of Appaloosa roaning (or greying) which only affects
  232.         the backround color and does not affect the spots however
  233.         evidence for this is not available
  234.  
  235.     Now how it works, let's take the case of a black horse, which is one
  236. of the most difficult colors to achieve in most breeds.  Remember that
  237. chestnut ee covers up black aa and bay A-.  So a chestnut horse with a black
  238. ancestor is bred to a bay horse with a black ancestor, the chestnut's gene
  239. pattern looks something like a?ee the bay's gene pattern looks something
  240. like AaE?, now there are 16 different combinations possible of which 4 are
  241. definitely bay, 4 are bay or chestnut depending on what genes the ? are,
  242. 4 are chestnut or black, 2 are bay or black, and only 2 are definitely black.
  243. If we make the first ?=A and the second ?=e then, the possible offspring
  244. are 8 chestnuts, 6 bays, and 2 blacks in other words a ratio of 4:3:1.   When
  245. you add more color genes it becomes more complicated.
  246.     As to the grey question, grey covers up the base color, let us say
  247. that color is bay, well bay can hide a black gene or a chestnut gene, so
  248. depending on what the grey is bred to you could have a chestnut, a bay, a
  249. black, or another grey, or numerous other colors.  Remember to look at
  250. your horse's breed and parentage, certain breeds don't have some color genes
  251. available to them.  For example Arabians don't have Z silver dapple or E-d
  252. jet black, or b chocolate brown so those genes are unnecessary to consider.  
  253. My mare's line has had nothing but greys, bays, and chestnuts for many 
  254. generations, black may have been known many generations ago but hasn't shown 
  255. up since then so I won't need to bother checking for other colors such as 
  256. overo genes or cremello genes when I breed her to another of her line.  Since 
  257. I am interested in black I would want to see if the sire had a line that 
  258. included black genes.  One more thing, the likelihood of a recessive gene 
  259. showing up in subsequent generations decreases with each new generation that 
  260. does not show it, but, as in the case of black coloring, it never completely 
  261. goes away.  If on the other hand you selectively breed away from a dominant
  262. color it can be completely lost in one generation (that actually happened
  263. with the Crabbet Arabians in the early 1900's, it wasn't until Skowronek
  264. was found and purchased that the grey color reappeared in the Crabbet herd.)
  265.  
  266.                 Tracy and Bruce (beautiful man) and
  267.                 Cachet (7 year old Arabian mare) and
  268.                 Mithril (2 year old Arabian filly,
  269.                 daughter of Cachet) and The Cats
  270.