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/ NetNews Usenet Archive 1993 #3 / NN_1993_3.iso / spool / rec / equestri / 6955 < prev    next >
Encoding:
Internet Message Format  |  1993-01-23  |  3.6 KB
  1. Path: sparky!uunet!cs.utexas.edu!asuvax!ncar!noao!amethyst!organpipe.uug.arizona.edu!news
  2. From: tracy@scoraz.resp-sci.arizona.edu (Tracy Scheinkman)
  3. Newsgroups: rec.equestrian
  4. Subject: re: Horse color genetics program
  5. Message-ID: <1993Jan22.202609.17973@organpipe.uug.arizona.edu>
  6. Date: 22 Jan 93 20:26:09 GMT
  7. Sender: news@organpipe.uug.arizona.edu
  8. Distribution: usa
  9. Organization: University of Arizona, Tucson, AZ
  10. Lines: 76
  11.  
  12. In Article 11154 (10 more) in rec.equestrian:
  13. From: sbishop@desire.wright.edu
  14.  
  15. >Not that hard if you use the 'square' method.  Just make a big square,
  16. >list possible variations of the mare vertically, possible variations
  17. >of the sire horizontally.  Works great, takes a few minutes and the
  18. >margin of error is small.
  19. >
  20. >    Bay stallion x Grey mare
  21. >
  22. >Stallion out of bay mare and chestnut stallion so genotype is almost
  23. >certainly Bc.
  24. >Grey mare out of chestnut mare and grey stallion, known to have produced
  25. >greys, chestnuts and bays, depending on what she is bred to.  Genotype
  26. >almost certainly Ggcc
  27. >
  28. >    Stallion               Bc     bc
  29. >                            _____________
  30. >    M        Gc |  GBcc  |  Gbcc |
  31. >    a                  _______________
  32. >    r               gc |  cBcc  |  gbcc |
  33. >    e                  _________________
  34. >
  35. >I think that's right, with this  combination you get 50% grey, 25% Bay,
  36. >25% chestnut.
  37. >
  38. >Tracy, do I have it right?
  39.  
  40.     You sure do.  The square method is the method I use when trying
  41. to figure out genetic possibilities.  Just a few corrections though --
  42. make sure you do not run gene locuses together.  For example in the
  43. case given above -- the Grey locus (G,g) the Bay locus (B,b) and the 
  44. chestnut locus (C,c) are separate locuses (I'm using Sue's symbols, the
  45. Sponenberg book uses G for grey, A for bay, and e for chestnut).
  46. The horse examples given here have B?ccgg in the stallion's case for
  47. genotype and ???cGg for the mare.  If the mare was chestnut when she
  48. was born before turning grey then her genotype would be ??ccGg, if she was 
  49. bay before turning grey then her genotype would be B?c?Gg because the color 
  50. you see on a baby when born is the color it would have been as an adult if
  51. the greying gene was not present.  Grey is a gradual progressive color
  52. change.  The above genotypes obviously require the use of an 8x8 square 
  53. in order to predict the percentages correctly as all possibilities must 
  54. be equally represented.  The need for this is easily seen in the case of 
  55. two horses who are totally heterozygous (meaning they have one of each
  56. gene possible at each locus):
  57.  
  58.     Stallion BbCcGg   x  Mare BbCcGg
  59.  
  60.     Genotype headers for columns and rows would be:
  61.  
  62.         BCG BCg BcG Bcg bCG bCg bcG bcg
  63.     BCG
  64.     BCg
  65.     BcG
  66.     Bcg
  67.     bCG
  68.     bCg
  69.     bcG
  70.     bcg
  71.  
  72.     Keep in mind that the letter symbols I am using here are Sue's
  73. symbols, not the common ones used in the Sponenberg book.  There 
  74. would be 64 squares and while many of them would have duplicate
  75. genotypes figuring out which genotypes represent which color and adding
  76. up the number of squares with each color will give you a good estimate
  77. of the chances for each color.  When one or more gene is unknown things
  78. become more complicated still.
  79.     The difficulty in physically drawing out the squares and filling
  80. each block is mountainous when dealing with more than 3 locuses and in
  81. those cases a computer program would be useful.  Fortunately most questions
  82. involve no more than 3 locuses, and some of those involve horses that are
  83. known to be homozygous in one or more locuses, for example a chestnut
  84. is homozygous for chestnut and for non-grey, though we could tell nothing
  85. about the bay locus from just looking at the horse.
  86.  
  87.                 Tracy and everybody
  88.