home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ OS/2 Shareware BBS: 10 Tools / 10-Tools.zip / octa21fb.zip / octave / SCRIPTS.ZIP / scripts / statistics / tests / wilcoxon_test.m < prev    next >
Encoding:
Text File  |  1998-10-29  |  2.6 KB  |  86 lines
  1. ## Copyright (C) 1995, 1996, 1997  Kurt Hornik
  2. ## 
  3. ## This program is free software; you can redistribute it and/or modify
  4. ## it under the terms of the GNU General Public License as published by
  5. ## the Free Software Foundation; either version 2, or (at your option)
  6. ## any later version.
  7. ## 
  8. ## This program is distributed in the hope that it will be useful, but
  9. ## WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  10. ## MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
  11. ## General Public License for more details. 
  12. ## 
  13. ## You should have received a copy of the GNU General Public License
  14. ## along with this file.  If not, write to the Free Software Foundation,
  15. ## 59 Temple Place - Suite 330, Boston, MA 02111-1307, USA.
  16.  
  17. ## usage:  [pval, z] = wilcoxon_test (x, y [, alt])
  18. ##
  19. ## For two matched-pair sample vectors x and y, perform a Wilcoxon
  20. ## signed-rank test of the null hypothesis PROB(x > y) == 1/2.
  21. ## Under the null, the test statistic z approximately follows a
  22. ## standard normal distribution. 
  23. ##
  24. ## With the optional argument string alt, the alternative of interest
  25. ## can be selected.  
  26. ## If alt is "!=" or "<>", the null is tested against the two-sided
  27. ## alternative PROB(x > y) != 1/2.
  28. ## If alt is ">", the one-sided alternative PROB(x > y) > 1/2 is
  29. ## considered, similarly for "<".
  30. ## The default is the two-sided case.
  31. ##
  32. ## pval is the p-value of the test.
  33. ##  
  34. ## If no output argument is given, the p-value of the test is displayed.
  35.  
  36. ## Author:  KH <Kurt.Hornik@ci.tuwien.ac.at>
  37. ## Description:  Wilcoxon signed-rank test
  38.   
  39. function [pval, z] = wilcoxon_test (x, y, alt)
  40.   
  41.   if ((nargin < 2) || (nargin > 3))
  42.     usage ("[pval, z] = wilcoxon_test (x, y [, alt])");
  43.   endif
  44.     
  45.   if (! (is_vector (x) && is_vector (y) && (length (x) == length (y))))
  46.     error ("wilcoxon_test:  x and y must be vectors of the same length");
  47.   endif
  48.  
  49.   n = length (x);
  50.   x = reshape (x, 1, n);
  51.   y = reshape (y, 1, n);
  52.   d = x - y;
  53.   d = d (find (d != 0));
  54.   n = length (d);
  55.   if (n > 0)
  56.     r = ranks (abs (d));
  57.     z = sum (r (find (d > 0)));
  58.     z = ((z - n * (n + 1) / 4) / sqrt (n * (n + 1) * (2 * n + 1) / 24));
  59.   else
  60.     z = 0;
  61.   endif
  62.  
  63.   cdf = stdnormal_cdf (z);
  64.   
  65.   if (nargin == 2)
  66.     alt = "!=";
  67.   endif
  68.  
  69.   if (! isstr (alt))
  70.     error("wilcoxon_test:  alt must be a string");
  71.   elseif (strcmp (alt, "!=") || strcmp (alt, "<>"))
  72.     pval = 2 * min (cdf, 1 - cdf);
  73.   elseif (strcmp (alt, ">"))
  74.     pval = 1 - cdf;
  75.   elseif (strcmp (alt, "<"))
  76.     pval = cdf;
  77.   else
  78.     error (sprintf ("wilcoxon_test:  option %s not recognized", alt));
  79.   endif
  80.  
  81.   if (nargout == 0)
  82.     printf ("  pval:  %g\n", pval);
  83.   endif
  84.   
  85. endfunction
  86.