home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ OS/2 Shareware BBS: 10 Tools / 10-Tools.zip / octa21eb.zip / octave / SCRIPTS.ZIP / scripts / statistics / tests / chisquare_test_homogeneity.m < prev    next >
Text File  |  1997-02-26  |  2KB  |  64 lines
  1. ## Copyright (C) 1995, 1996, 1997  Kurt Hornik
  2. ## 
  3. ## This program is free software; you can redistribute it and/or modify
  4. ## it under the terms of the GNU General Public License as published by
  5. ## the Free Software Foundation; either version 2, or (at your option)
  6. ## any later version.
  7. ## 
  8. ## This program is distributed in the hope that it will be useful, but
  9. ## WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  10. ## MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
  11. ## General Public License for more details. 
  12. ## 
  13. ## You should have received a copy of the GNU General Public License
  14. ## along with this file.  If not, write to the Free Software Foundation,
  15. ## 59 Temple Place - Suite 330, Boston, MA 02111-1307, USA.
  16.  
  17. ## usage:  [pval, chisq, df] = chisquare_test_homogeneity (x, y, c)
  18. ##
  19. ## Given two samples x and y, perform a chisquare test for homogeneity
  20. ## of the null hypothesis that x and y come from the same distribution,
  21. ## based on the partition induced by the (strictly increasing) entries
  22. ## of c.
  23. ##
  24. ## For large samples, the test statistic chisq approximately follows a
  25. ## chisquare distribution with df = length(c) degrees pf freedom. pval
  26. ## is the p-value (1 minus the CDF of this distribution at chisq) of the
  27. ## test.
  28. ##
  29. ## If no output argument is given, the p-value is displayed.
  30.  
  31. ## Author:  KH <Kurt.Hornik@ci.tuwien.ac.at>
  32. ## Description:  Chi-square test for homogeneity
  33.  
  34. function [pval, chisq, df] = chisquare_test_homogeneity (x, y, c)
  35.   
  36.   if (nargin != 3)
  37.     usage ("[pval, chisq, df] = chisquare_test_homogeneity (x, y, c)");
  38.   endif
  39.   
  40.   if (! (is_vector(x) && is_vector(y) && is_vector(c)))
  41.     error ("chisquare_test_homogeneity: x, y and c must be vectors");
  42.   endif
  43.   ## Now test c for strictly increasing entries
  44.   df = length (c);
  45.   if (any ( (c(2 : df) - c(1 : (df - 1))) <= 0))
  46.     error ("chisquare_test_homogeneity:  c must be increasing");
  47.   endif
  48.   
  49.   c     = [reshape (c, 1, df), Inf];
  50.   l_x   = length (x);
  51.   x     = reshape (x, l_x, 1);
  52.   n_x   = sum (x * ones (1, df+1) < ones (l_x, 1) * c);
  53.   l_y   = length (y);
  54.   y     = reshape (y, l_y, 1);
  55.   n_y   = sum(y * ones (1, df+1) < ones (l_y, 1) * c);
  56.   chisq = l_x * l_y * sum ((n_x/l_x - n_y/l_y).^2 ./ (n_x + n_y));
  57.   pval  = 1 - chisquare_cdf (chisq, df);
  58.   
  59.   if (nargout == 0)
  60.     printf("  pval:  %g\n", pval);
  61.   endif
  62.  
  63. endfunction
  64.