home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ ftptest.leeds.ac.uk / 2015.02.ftptest.leeds.ac.uk.tar / ftptest.leeds.ac.uk / bionet / mol_biol / lacop.tbk (.txt) < prev    next >
Asymetrix ToolBook File  |  1993-12-14  |  395KB  |  6,394 lines
  1. "quest13" 
  2. "quest14" 
  3. leavePage
  4. leavePage
  5. quest13
  6. quest14
  7. NextPage
  8. 4questscore13
  9. 4questscore14
  10. B"i2" 
  11. B"j2" 
  12. B"k2" 
  13. B"l2" 
  14. B"m2" 
  15. B"n2" 
  16. B"o2" 
  17. B"p2" 
  18. B"q2" 
  19. B"r2" 
  20. default
  21. buttonUp
  22. buttonUp
  23. default
  24. questscore14
  25. questscore13
  26. quest13
  27. quest14
  28. 13. Which of the following are inducers? ::
  29. Allolactose
  30. Lactose
  31. Glucose
  32. Galactose
  33. Cyclic AMP
  34. 14. Dissociation constant of the repressor-operator complex is about :
  35. 24 of  30
  36. "quest15" 
  37. "quest16" 
  38. leavePage
  39. leavePage
  40. quest15
  41. quest16
  42. NextPage
  43. 4questscore15
  44. 4questscore16
  45. B"s2" 
  46. B"t2" 
  47. B"u2" 
  48. B"v2" 
  49. B"w2" 
  50. B"x2" 
  51. B"y2" 
  52. B"z2" 
  53. B"a3" 
  54. B"b3" 
  55. default
  56. buttonUp
  57. buttonUp
  58. default
  59. questscore16
  60. questscore15
  61. quest15
  62. quest16
  63. 15. The repressor molecule is a  ::::::::::
  64. Monomer
  65. Dimer
  66. Trimer
  67. Tetramer
  68. Pentamer
  69. 16. Function of b-galactosidase ::
  70. To allow entry of lactose into cell
  71. Breakdown of lactose into glucose + mannose
  72. To allow lactose to be used as a carbon source
  73. Breakdown of lactose into glucose + galactose
  74. To allow lactose to be used as an energy sourceM
  75. 25 of  30
  76. "quest17" 
  77. "quest18" 
  78. leavePage
  79. leavePage
  80. quest17
  81. quest18
  82. NextPage
  83. 4questscore17
  84. 4questscore18
  85. B"c3" 
  86. B"d3" 
  87. B"e3" 
  88. B"f3" 
  89. B"g3" 
  90. B"h3" 
  91. B"i3" 
  92. B"j3" 
  93. B"k3" 
  94. B"l3" 
  95. default
  96. buttonUp
  97. buttonUp
  98. default
  99. questscore18
  100. questscore17
  101. quest17
  102. quest18
  103. 17. The Catabolite Activator Protein is a  :
  104. Monomer
  105. Dimer
  106. Trimer
  107. Tetramer
  108. Pentamer
  109. 18 Maximum number of molecules of allolactose repressor can bind is  :
  110. 26 of  30
  111. "quest9" 
  112. "quest10" 
  113. leavePage
  114. leavePage
  115. quest9
  116. quest10
  117. 9. The repressor :::::::::::::::7
  118. Increases affinity of RNA polymerase for promoter
  119. Decreases affinity of RNA polymerase for promoter
  120. Blocks transcription
  121. Increases rate of transcription
  122. Binds when glucose is present as a substrate
  123. 10. The binding of the CAP-cAMP complex to the CAP site ::
  124. Decreases the probability of RNA polymerase binding to the promoter
  125. Stops the repressor from binding to the operator
  126. Decreases the rate of transcription by causing a bend in the DNA
  127. Increases the rate of transcription by interacting with RNA polymerase
  128. Occurs when the glucose level is low
  129. s are low
  130. d as substrate
  131. quest9
  132. quest10
  133. NextPage
  134. 4questscore9
  135. 4questscore10
  136. B"o1" 
  137. B"p1" 
  138. B"q1" 
  139. B"r1" 
  140. B"s1" 
  141. B"t1" 
  142. B"u1" 
  143. B"v1" 
  144. B"w1" 
  145. B"x1" 
  146. default
  147. buttonUp
  148. buttonUp
  149. default
  150. questscore10
  151. questscore9
  152. 22 of  30
  153. "textgo"
  154. "text1"
  155. --Repressor already present on DNA
  156. --RNA polymerase moves 
  157. "RNApol" 
  158. )-1095, 510
  159. -1080, 420
  160. -1005, 435
  161. -945, 435
  162. -900, 480
  163. -825, 510
  164. -765, 525
  165. -675, 630
  166. -585, 705
  167. -465, 780
  168. -315, 855
  169. -150, 1020
  170. 0, 1230
  171. 240, 1485
  172. 615, 1485
  173. 990, 1485
  174. 1485, 1485
  175. "text2"
  176. --2 allolactose molecules (al1,al4) 
  177. holes 
  178. repressor
  179. )4326, 510
  180. 3906, 675
  181. 3471, 825
  182. 2886, 990
  183. 2436, 1275
  184. )4540, 421
  185. 4030, 676
  186. 3505, 931
  187. 3250, 
  188. "al4" 
  189. 2796, 1485
  190. , al1 
  191. ! hidden 
  192. replaced 
  193. Hrep2
  194. --Rep2 
  195. square 
  196. es bound (al5,al8) 
  197. same 
  198. --positions 
  199. C= rep1b (
  200. $empty) + 
  201. )2265, 1095
  202. off DNA
  203. 2340, 1050
  204. 2415, 1005
  205. 2475, 945
  206. --Remaining 2 
  207. es (al6,al7) join 
  208. )3831, -84
  209. 3801, 81
  210. 3696, 321
  211. 3576, 576
  212. 3306, 786
  213. 2991, 1056
  214. )3366, -84
  215. 3156, 306
  216. 3006, 471
  217. 2736, 771
  218. 2646, 1281
  219. es grouped together so can 
  220. %1 unit
  221. + al6 + al7 = rep3
  222. Group
  223. --Rep3 moved 
  224. screen
  225. 2340, 1050
  226. 2415, 1005
  227. 2475, 945
  228. 2580, 885
  229. 2700, 810
  230. 2790, 750
  231. 2865, 675
  232. 2955, 585
  233. 3015, 495
  234. 3195, 405
  235. 3390, 315
  236. "text3"
  237. "text4"
  238. --Open complex (
  239. trans) shown, 
  240. Shalf 
  241. )1935, 1615
  242. "leftrans"
  243. 240, 75.125, 100
  244. 240, 75.125, 100
  245. "rightrans"
  246. 0, 75.3125, 0
  247. 0, 75.6875, 0
  248. "text5"
  249. --Abortive initiation strans 
  250. ungrouped 
  251. s (sigma 
  252. rna-s
  253. --(core enzyme). Sigma 
  254.  dissociates 
  255. leaves.
  256. !"ab1" 
  257. )1785, 2070
  258. 795, 2480
  259. !"ab2" 
  260. )1785, 2070
  261. 950, 2750
  262. !"ab3" 
  263. )1785, 2070
  264. 585, 2655
  265. Ungroup
  266. 1275, 1305
  267. 1185, 1215
  268. 1125, 1155
  269. 1065, 1065
  270. 1005, 1035
  271. 930, 945
  272. 885, 870
  273. 840, 795
  274. 780, 705
  275. 630, 480
  276. 525, 405
  277. 330, 285
  278. 105, 165
  279. -105, 75
  280. -315, -15
  281. 630, 480
  282. !"pa"
  283. "text6"
  284. --Elongation starts-
  285. mRNA strand (
  286. pa-po) 
  287. --Core 
  288. nalong 1 
  289. --Each 
  290. Qcolour
  291. !"pa"
  292. 2235, 1455
  293. 0, 75.3125, 0
  294. 0, 75.3125, 0
  295. 120, 75.125, 100
  296. 120, 75.125, 100
  297. 2295, 1645
  298. 2610, 1455
  299. 120, 75.125, 100
  300. 120, 75.125, 100
  301. 60, 87.625, 100
  302. 60, 87.625, 100
  303. 2670, 1645
  304. "pc" 
  305. 2985, 1455
  306. 60, 87.625, 100
  307. 60, 87.625, 100
  308. 0, 87.625, 100
  309. 0, 87.625, 100
  310. 3060, 1645
  311. "pd" 
  312. 3345, 1455
  313. 0, 87.625, 100
  314. 0, 87.625, 100
  315. 0, 87.625, 100
  316. 0, 87.625, 100
  317. 3420, 1645
  318. "pe" 
  319. 3720, 1455
  320. 0, 87.625, 100
  321. 0, 87.625, 100
  322. 0, 87.625, 100
  323. 0, 87.625, 100
  324. 3810, 1645
  325. "pf" 
  326. 4080, 1455
  327. 0, 87.625, 100
  328. 0, 87.625, 100
  329. 60, 87.625, 100
  330. 60, 87.625,100
  331. 4185, 1645
  332. "pg" 
  333. 4500, 1455
  334. 60, 87.625, 100
  335. 60, 87.625, 100
  336. 180, 87.625, 100 
  337. 180, 87.625, 100
  338. 4575, 1645
  339. "ph" 
  340. 4845, 1455
  341. 180, 87.625, 100 
  342. 180, 87.625, 100
  343. 180, 87.625, 100 
  344. 180, 87.625, 100
  345. 4965, 1645
  346. 5280, 1455
  347. 180, 87.625, 100 
  348. 180, 87.625, 100
  349. 60, 87.625, 100 
  350. 60, 87.625, 100
  351. 5325, 1645
  352. "pj" 
  353. 5610, 1455
  354. 60, 87.625, 100 
  355. 60, 87.625, 100
  356. 0, 75.125, 100 
  357. 0, 75.125, 100
  358. 5700, 1645
  359. "pk" 
  360. 6015, 1455
  361. 0, 75.125, 100 
  362. 0, 75.125, 100
  363. 0, 75.125, 100 
  364. 0, 75.125, 100
  365. 6090, 1645
  366. "pl" 
  367. 6360, 1455
  368. 0, 75.125, 100 
  369. 0, 75.125, 100
  370. 60, 87.625, 100 
  371. 60, 87.625, 100
  372. 6450, 1645
  373. "pm" 
  374. "text7"
  375. 6750, 1455
  376. 60, 87.625, 100
  377. 60, 87.625, 100
  378. 60, 87.625, 100 
  379. 60, 87.625, 100
  380. 6840, 1645
  381. "pn" 
  382. --Last 
  383. Hlinear 
  384. "po" 
  385. renamed
  386. loses 
  387. ). This 
  388. xseen on 
  389. 990, 120
  390. "text8"
  391. "text9"
  392. leaving 
  393. es al5-al6.
  394. --Allolactose 
  395. "al7"
  396. 3441, 591
  397. 3396, 471
  398. 3381, 351
  399. 3351, 246
  400. 3321, 126
  401. 3306, 66
  402. 3291, -9
  403. 3276, -84
  404. "al6"
  405. 3921, 381
  406. 3921, 336
  407. 3921, 291
  408. 3951, 276
  409. 3951, 246
  410. 3966, 216
  411. 3981, 156
  412. 3981, 111
  413. 4011, 81
  414. 4011, 36
  415. 4011, -9
  416. 4011, -24
  417. 4011, -84
  418.  al5 
  419. --Rep1b 
  420. Hrep 
  421. al4 which 
  422. form rep4
  423. 3591, 366
  424. )3408, 321
  425. --Rep4 
  426. where 
  427. "al5" 
  428. 3606, 306
  429. 3636, 231
  430. 3636, 186
  431. 3636, 111
  432. 3636, 66
  433. 3636, 36
  434. 3636, -24
  435. 3636, -69
  436. 3348, 426
  437. 3258, 516
  438. 3108, 591
  439. 3033, 636
  440. 2898, 696
  441. 2763, 771
  442. 2673, 831
  443. 2538, 921
  444. 2463, 981
  445. 2373, 1086
  446. 2313, 1146
  447. 2283, 1161
  448. 2916, 1476
  449. 3066, 1401
  450. 3186, 1296
  451. 3381, 1131
  452. 3546, 876
  453. 3636, 666
  454. 3741, 456
  455. 3831, 261
  456. 3921, 126
  457. 3951, -69
  458. --re1b, 
  459. reform 
  460. )3390, 315
  461. "al8"
  462. 3561, 426
  463. 3891, 651
  464. --Text fields 
  465. default 
  466. buttonUp
  467. 7buttonUp
  468. textgo
  469. text1
  470. RNApol
  471. RNApol
  472. text2
  473. Group
  474. text3
  475. text4
  476. leftrans
  477. leftrans
  478. leftrans
  479. rightrans
  480. rightrans
  481. rightrans
  482. text5
  483. RNApol
  484. WUngroup
  485. text6
  486. rna-s
  487. leftrans
  488. leftrans
  489. rightrans
  490. rightrans
  491. trans
  492. rna-s
  493. leftrans
  494. leftrans
  495. rightrans
  496. rightrans
  497. trans
  498. rna-s
  499. leftrans
  500. leftrans
  501. rightrans
  502. rightrans
  503. trans
  504. rna-s
  505. leftrans
  506. leftrans
  507. rightrans
  508. rightrans
  509. trans
  510. rna-s
  511. leftrans
  512. leftrans
  513. rightrans
  514. rightrans
  515. trans
  516. rna-s
  517. leftrans
  518. leftrans
  519. rightrans
  520. rightrans
  521. trans
  522. rna-s
  523. leftrans
  524. leftrans
  525. rightrans
  526. rightrans
  527. trans
  528. rna-s
  529. leftrans
  530. leftrans
  531. rightrans
  532. rightrans
  533. trans
  534. rna-s
  535. leftrans
  536. leftrans
  537. rightrans
  538. rightrans
  539. trans
  540. rna-s
  541. leftrans
  542. leftrans
  543. rightrans
  544. rightrans
  545. trans
  546. rna-s
  547. leftrans
  548. leftrans
  549. rightrans
  550. rightrans
  551. trans
  552. rna-s
  553. leftrans
  554. leftrans
  555. rightrans
  556. rightrans
  557. trans
  558. text7
  559. rna-s
  560. leftrans
  561. leftrans
  562. rightrans
  563. rightrans
  564. trans
  565. trans
  566. rna-s
  567. Group
  568. RNApol
  569. RNApol
  570. text8
  571. text9
  572. WUngroup
  573. WUngroup
  574. rep1b
  575. Group
  576. WUngroup
  577. rep1b
  578. rep1b
  579. Group
  580. text1
  581. text2
  582. text3
  583. text4
  584. text5
  585. text6
  586. text7
  587. text8
  588. text9
  589. textgo
  590. default
  591. trans
  592. rep1b
  593. Group
  594. WUngroup
  595. rep1b
  596. rep1b
  597. Group
  598. text1
  599. text2
  600. text3
  601. text4
  602. text5
  603. text6
  604. text7
  605. text8
  606. text9
  607. textgo
  608. trans
  609. ZhorizPos
  610. "textgo"
  611. "text0.5"
  612. "rep" 
  613. )4953, -429
  614. nthe 
  615. 4923, -279
  616. 4863, -69
  617. 4803, 21
  618. 4698, 141
  619. 4548, 261
  620. 4383, 351
  621. 4203, 471
  622. 4023, 576
  623. 3858, 711
  624. 3678, 831
  625. 3438, 951
  626. 3258, 1056
  627. 3003, 1131
  628. "text1"
  629. "cap" 
  630. )-585, 2715
  631. -540, 2685
  632. -465, 2640
  633. -375, 2565
  634. -255, 2505
  635. -150, 2445
  636. -45, 2370
  637. 90, 2265
  638. 150, 2220
  639. 225, 2160
  640. 255, 2145
  641. "camp1" 
  642. )-75, 3159
  643. 15, 3084
  644. 135, 2949
  645. 195, 2904
  646. 225, 2874
  647. 285, 2829
  648. 345, 2769
  649. 390, 2709
  650. 420, 2664
  651. 420, 2589
  652. "camp2" 
  653. )-75, 3459
  654. -15, 3429
  655. 45, 3369
  656. 105, 3309
  657. 180, 3249
  658. 240, 3144
  659. 285, 3099
  660. 345, 3009
  661. 405, 2979
  662. 450, 2919
  663. 510, 2889
  664. 555, 2844
  665. 600, 2814
  666. 630, 2754
  667. 645, 2709
  668. 645, 2679
  669. 660, 2649
  670. 660, 2589
  671. "cap-
  672. )249, 2157
  673. 354, 2127
  674. 519, 2112
  675. 654, 2097
  676. 789, 2067
  677. 909, 2052
  678. 999, 2037
  679. 1089, 2007
  680. 1179, 1977
  681. 1254, 1962
  682. 1344, 1947
  683. 1389, 1902
  684. 1434, 1902
  685. 1464, 1857
  686. 1509, 1797
  687. "RNApol" 
  688. )8430, 165
  689. 8295, 255
  690. 8130, 345
  691. 7890, 495
  692. 7785, 540
  693. 7665, 585
  694. 7500, 645
  695. 7380, 690
  696. 7170, 795
  697. 7005, 915
  698. 6840, 1035
  699. 6630, 1230
  700. 6510, 1320
  701. 6450, 1350
  702. 6360, 1440
  703. 6360 
  704. 3735 
  705. H-375
  706. , 1440
  707. 3735 
  708. 6735 
  709. , 1440
  710. 6735, 1365
  711. 6855, 1320
  712. 7035, 1305
  713. 7095, 1245
  714. 7245, 1155
  715. 7365, 1125
  716. 7470, 1095
  717. 7545, 975
  718. 7740, 855
  719. 7845, 840
  720. 7995, 810
  721. 8055, 795
  722. 8160, 780
  723. 8370, 765
  724. "text2"
  725. )-1095, 1410
  726. -975, 1410
  727. -765, 1410
  728. -555, 1410
  729. -375, 1410
  730. -240, 1410
  731. -120, 1410
  732. -15, 1410
  733. 105, 1410
  734. 240, 1410
  735. 315, 1305
  736. 465, 1155
  737. 570, 1095
  738. 615, 1005
  739. 660, 885
  740. 885, 780
  741. 990, 720
  742. 1110, 720
  743. 1260, 765
  744. 1365, 780
  745. 1545, 870
  746. 1695, 900
  747. 1860, 975
  748. 2175, 1095
  749. 2265, 1305
  750. 2265, 1455
  751. "text3"
  752. U    .5"
  753. buttonUp
  754. buttonUp
  755. textgo
  756. text0.5
  757. text1
  758. camp1
  759. camp1
  760. camp2
  761. camp2
  762. camp1
  763. camp2
  764. cap-camp
  765. cap-camp
  766. text1.5
  767. RNApol
  768. RNApol
  769. RNApol
  770. RNApol
  771. RNApol
  772. RNApol
  773. text2
  774. RNApol
  775. RNApol
  776. text3
  777. cap-camp
  778. RNApol
  779. text0.5
  780. text1
  781. text1.5
  782. text2
  783. text3
  784. textgo
  785. horizPos:by
  786. horizPos:to
  787. horizPos
  788. buttonUp
  789. buttonUp
  790. 1st Page
  791. Animate2
  792. Animate
  793. "al6" 
  794. buttonUp
  795. buttonUp
  796. Button
  797. rep1b
  798. repal
  799. #t%~)6-H/
  800. "Really quit?"\
  801. f"Yes" 
  802. "image"
  803. Ungroup
  804. "pol" 
  805. 240, 62.5625, 100
  806. "rep" 
  807. 120, 37.625, 100
  808. 240, 75.125, 100
  809. 120, 75.125, 100
  810. 240, 87.625, 100
  811. 120, 87.625, 100
  812. 60, 87.625, 100
  813. 60, 87.625, 100
  814. "dna" 
  815. 240, 50, 100
  816. 120, 25.125, 100
  817. Group
  818. SysSuspendMessages 
  819. buttonUp
  820.     buttonUp
  821. Really quit?
  822. image
  823. WUngroup
  824. Group
  825. image
  826. image
  827. backPage
  828. Transcription of Lac Operon under different physiological conditions.
  829. a) Events when lactose is absent::
  830. NextPage
  831. ckPage
  832. Previous
  833. buttonUp
  834. buttonUp
  835. Previous
  836. A small amount of lac repressor protein is continually made by the cell.
  837. The repressor binds to the operator with a dissociation constant of 10     M, so  binding is virtually irreversible. The binding of the repressor increases the affinity of the RNA polymerase for the promoter 100 fold. This occurs so that when lactose does become available the initiation of transcription is very rapid because the enzyme is already bound.
  838. The RNA polymerase cannot initiate transcription due to the presence of the repressor so none of the proteins are synthesised..
  839. repressor protein
  840. -- Script that opens a simple dialog box 
  841. "The lac repressor protein 
  842. a tetramer 
  843. four 38,000 dalton polypeptide chains. Each 
  844. the subunits has two recognition sites - one 
  845. ,operator 
  846. 9other 
  847. Cinducer molecule allolactose. However, only 
  848. `molecules 
  849. % need 
  850. bind 
  851. repression 
  852. transcription 
  853. be lifted."
  854. buttonDown
  855. buttonDown
  856. The lac repressor protein is a tetramer of four 38,000 dalton polypeptide chains. Each of the subunits has two recognition sites - one for the operator and the other for the inducer molecule allolactose. However, only two molecules of allolactose need to bind to the repressor for repression of transcription to be lifted.
  857. d    <    a    
  858.     xtPage
  859. buttonUp
  860. buttonUp
  861. 6 of  30
  862. ExitProgram
  863. "Really quit?"\
  864. f"Yes" 
  865. SysSuspendMessages 
  866. buttonUp
  867. buttonUp
  868. Really quit?
  869. FirstPage
  870. buttonUp
  871. buttonUp
  872. 1st Page
  873. Previous
  874. default
  875. buttonUp
  876. buttonUp
  877. Previous
  878. default
  879. default
  880. buttonUp
  881. buttonUp
  882. default
  883. backPage
  884. ckPage
  885. Previous
  886. buttonUp
  887. buttonUp
  888. Previous
  889. xtPage
  890. buttonUp
  891. buttonUp
  892. ExitProgram
  893. "Really quit?"\
  894. f"Yes" 
  895. SysSuspendMessages 
  896. buttonUp
  897. buttonUp
  898. Really quit?
  899. FirstPage
  900. buttonUp
  901. buttonUp
  902. 1st Page
  903. c) Lactose present, glucose present:
  904. Lactose taken up at slow rate by small amount of permease present in the cell.
  905. Some lactose turned into allolactose.
  906. Allolactose binds to repressor which loses its affinity for the operator.
  907. Glucose high, cAMP low 
  908.  CAP cannot bind to CAP site
  909. RNA polymerase binds  and a modest level of transcription takes place.
  910. d) Lactose present, glucose absent:
  911. Lactose taken up at slow rate by small amount of permease present in the cell.
  912. Some lactose turned into allolactose.
  913. Allolactose binds to repressor which loses its affinity for the operator.
  914. Glucose low, cAMP high 
  915.  CAP-cAMP complex binds to CAP site.
  916. RNA polymerase binds readily to the promoter and a high level of transcription takes place. 
  917. 16 of  30
  918. Previous
  919. default
  920. buttonUp
  921. buttonUp
  922. Previous
  923. default
  924. NextPage
  925. default
  926. buttonUp
  927. buttonUp
  928. default
  929. ng the  
  930.   button below: 
  931. "Really quit?"\
  932. f"Yes" 
  933. SysSuspendMessages 
  934. buttonUp
  935. buttonUp
  936. Really quit?
  937. 1st Page
  938. Go onto the next page by clicking the  
  939.   button below: 
  940. barchart
  941. Basic
  942. "textgo"
  943. "text0.5"
  944. --RNA polymerase goes 
  945. moves 
  946. forth 
  947. Zpromoter
  948. --region 
  949. reached
  950. "RNApol" 
  951. )-1150, 480
  952. ZhorizPos
  953. nthe 
  954. -1080, 420
  955. -1005, 435
  956. -945, 435
  957. -900, 480
  958. -825, 510
  959. -765, 525
  960. -675, 630
  961. -585, 705
  962. -465, 780
  963. -315, 855
  964. -150, 1020
  965. 0, 1230
  966. 240, 1485
  967. 6615 
  968. , 1485
  969. 6615 
  970. -135 
  971. H-750
  972. , 1485 
  973. -135 
  974. 6615 
  975. , 1485
  976. 6615 
  977. -135 
  978. H-375
  979. , 1485 
  980. 240, 1485
  981. 615, 1485
  982. 990, 1485
  983. 1485, 1485
  984. "text1"
  985. --Open complex (
  986. trans) appears 
  987. half coloured 
  988. )1890, 1645
  989. "leftrans"
  990. 240, 75.125, 100
  991. 240, 75.125, 100
  992. "rightrans"
  993. 0, 75.3125, 0
  994. 0, 75.6875, 0
  995. --Abortive initiation takes place, releasing strands 
  996. (ab1-ab3)
  997. --Sigma unit
  998. s) dissociates
  999. )1785, 2070
  1000. 795, 2480
  1001. !"ab2" 
  1002. )1785, 2070
  1003. 1055, 2655
  1004. )1785, 2070
  1005. 585, 2655
  1006. Ungroup
  1007. 1275, 1305
  1008. 1185, 1215
  1009. 1125, 1155
  1010. 1065, 1065
  1011. 1005, 1035
  1012. 930, 945
  1013. 885, 870
  1014. 840, 795
  1015. 780, 705
  1016. 630, 480
  1017. 525, 405
  1018. 330, 285
  1019. 105, 165
  1020. -105, 75
  1021. -315, -15
  1022. 630, 480
  1023. !"pa"
  1024. "text3"
  1025. --Elongation starts - 
  1026. mRNA 
  1027.  (pa-po)hidden
  1028. --Core enzyme (
  1029. rna-s) 
  1030. along DNA
  1031. hanging 
  1032. !"pa"
  1033. 2235, 1455
  1034. 0, 75.3125, 0
  1035. 0, 75.3125, 0
  1036. 120, 75.125, 100
  1037. 120, 75.125, 100
  1038. 2280, 1645
  1039. !"ab1"
  1040. !"ab3"
  1041. 2610, 1455
  1042. 120, 75.125, 100
  1043. 120, 75.125, 100
  1044. 60, 87.625, 100
  1045. 60, 87.625, 100
  1046. 2655, 1645
  1047. "pc" 
  1048. 2985, 1455
  1049. 60, 87.625, 100
  1050. 60, 87.625, 100
  1051. 0, 87.625, 100
  1052. 0, 87.625, 100
  1053. 3030, 1645
  1054. "pd" 
  1055. 3345, 1455
  1056. 0, 87.625, 100
  1057. 0, 87.625, 100
  1058. 0, 87.625, 100
  1059. 0, 87.625, 100
  1060. 3420, 1645
  1061. "pe" 
  1062. 3720, 1455
  1063. 0, 87.625, 100
  1064. 0, 87.625, 100
  1065. 0, 87.625, 100
  1066. 0, 87.625, 100
  1067. 3780, 1645
  1068. "pf" 
  1069. 4080, 1455
  1070. 0, 87.625, 100
  1071. 0, 87.625, 100
  1072. 60, 87.625, 100
  1073. 60, 87.625,100
  1074. 4155, 1645
  1075. "pg" 
  1076. 4500, 1455
  1077. 60, 87.625, 100
  1078. 60, 87.625, 100
  1079. 180, 87.625, 100 
  1080. 180, 87.625, 100
  1081. 4560, 1645
  1082. "ph" 
  1083. 4845, 1455
  1084. 180, 87.625, 100 
  1085. 180, 87.625, 100
  1086. 180, 87.625, 100 
  1087. 180, 87.625, 100
  1088. 4920, 1645
  1089. 5280, 1455
  1090. 180, 87.625, 100 
  1091. 180, 87.625, 100
  1092. 60, 87.625, 100 
  1093. 60, 87.625, 100
  1094. 5325, 1645
  1095. "pj" 
  1096. 5610, 1455
  1097. 60, 87.625, 100 
  1098. 60, 87.625, 100
  1099. 0, 75.125, 100 
  1100. 0, 75.125, 100
  1101. 5685, 1645
  1102. "pk" 
  1103. 6015, 1455
  1104. 0, 75.125, 100 
  1105. 0, 75.125, 100
  1106. 0, 75.125, 100 
  1107. 0, 75.125, 100
  1108. 6060, 1645
  1109. "pl" 
  1110. 6360, 1455
  1111. 0, 75.125, 100 
  1112. 0, 75.125, 100
  1113. 60, 87.625, 100 
  1114. 60, 87.625, 100
  1115. 6420, 1645
  1116. "pm" 
  1117. "text4"
  1118. 6750, 1455
  1119. 60, 87.625, 100
  1120. 60, 87.625, 100
  1121. 60, 87.625, 100 
  1122. 60, 87.625, 100
  1123. 6810, 1645
  1124. "pn" 
  1125. --Straight piece 
  1126. po) shown
  1127. moved 
  1128. sigma 
  1129. grouped together
  1130. "po" 
  1131. 990, 120
  1132. Group
  1133. --Text fields 
  1134. "text5"
  1135. "text2"
  1136. sysLockscreen 
  1137. default
  1138. buttonUp
  1139. #buttonUp
  1140. textgo
  1141. text0.5
  1142. RNApol
  1143. RNApol
  1144. RNApol
  1145. RNApol
  1146. RNApol
  1147. RNApol
  1148. RNApol
  1149. RNApol
  1150. RNApol
  1151. RNApol
  1152. text1
  1153. leftrans
  1154. leftrans
  1155. leftrans
  1156. rightrans
  1157. rightrans
  1158. rightrans
  1159. RNApol
  1160. WUngroup
  1161. text3
  1162. rna-s
  1163. leftrans
  1164. leftrans
  1165. rightrans
  1166. rightrans
  1167. trans
  1168. rna-s
  1169. leftrans
  1170. leftrans
  1171. rightrans
  1172. rightrans
  1173. trans
  1174. rna-s
  1175. leftrans
  1176. leftrans
  1177. rightrans
  1178. rightrans
  1179. trans
  1180. rna-s
  1181. leftrans
  1182. leftrans
  1183. rightrans
  1184. rightrans
  1185. trans
  1186. rna-s
  1187. leftrans
  1188. leftrans
  1189. rightrans
  1190. rightrans
  1191. trans
  1192. rna-s
  1193. leftrans
  1194. leftrans
  1195. rightrans
  1196. rightrans
  1197. trans
  1198. rna-s
  1199. leftrans
  1200. leftrans
  1201. rightrans
  1202. rightrans
  1203. trans
  1204. rna-s
  1205. leftrans
  1206. leftrans
  1207. rightrans
  1208. rightrans
  1209. trans
  1210. rna-s
  1211. leftrans
  1212. leftrans
  1213. rightrans
  1214. rightrans
  1215. trans
  1216. rna-s
  1217. leftrans
  1218. leftrans
  1219. rightrans
  1220. rightrans
  1221. trans
  1222. rna-s
  1223. leftrans
  1224. leftrans
  1225. rightrans
  1226. rightrans
  1227. trans
  1228. rna-s
  1229. leftrans
  1230. leftrans
  1231. rightrans
  1232. rightrans
  1233. trans
  1234. text4
  1235. rna-s
  1236. leftrans
  1237. leftrans
  1238. rightrans
  1239. rightrans
  1240. trans
  1241. trans
  1242. rna-s
  1243. Group
  1244. RNApol
  1245. RNApol
  1246. text5
  1247. textgo
  1248. text0.5
  1249. text1
  1250. text2
  1251. text3
  1252. text4
  1253. text5
  1254. default
  1255. trans
  1256. horizPos:by
  1257. horizPos:to
  1258. horizPos
  1259. sendToBack
  1260. RNApol
  1261. text5
  1262. textgo
  1263. text0.5
  1264. text1
  1265. text2
  1266. text3
  1267. text4
  1268. text5
  1269. trans
  1270. horizPos:by
  1271. horizPos:to
  1272. horizPos
  1273. qDKnAPfD
  1274. System
  1275. Wingdings
  1276. mes New Roman
  1277. mes New Roman
  1278. Times New Roman
  1279. Times New Roman
  1280. The Lac Operon
  1281. Times New Roman
  1282. Times New Roman
  1283. Times New Roman
  1284. Times New Roman
  1285. Times New Roman
  1286. Times New Roman
  1287. Times New Roman
  1288. Times New Roman
  1289. Times New Roman
  1290. Arial
  1291. Times New Roman
  1292. Symbol
  1293. Times New Roman
  1294. Times New Roman
  1295. p    ial
  1296. Times New Roman
  1297. :PRINTLAYOUT
  1298. p    ial
  1299. Times New Roman
  1300. Times New Roman
  1301. mes New Roman
  1302. Times New Roman
  1303. Symbol
  1304. Times New Roman
  1305. Arial
  1306. Wingdings
  1307. EnterBook
  1308. Reader
  1309. sysRuntime 
  1310. c"Edit" 
  1311. c"Text" 
  1312. c"File" 
  1313. sysScreenLock 
  1314. LeaveBook 
  1315. EnterBook
  1316. LeaveBook
  1317. EnterBook
  1318. sysScreenLock
  1319. LeaveBook
  1320. Wingdings
  1321. Times New Roman
  1322. Times New Roman
  1323. Times New Roman
  1324. Times New Roman
  1325. -- Puts the 
  1326. mode 
  1327. hides 
  1328. menus 
  1329. file 
  1330. EnterBook
  1331. Reader
  1332. sysRuntime 
  1333. c"Edit" 
  1334. c"Text" 
  1335. c"File" 
  1336. sysScreenLock 
  1337. LeaveBook 
  1338. EnterBook
  1339. LeaveBook
  1340. EnterBook
  1341. sysScreenLock
  1342. LeaveBook
  1343. ckPage
  1344. Previous
  1345. buttonUp
  1346. buttonUp
  1347. Previous
  1348. xtPage
  1349. buttonUp
  1350. buttonUp
  1351. ExitProgram
  1352. "Really quit?"\
  1353. f"Yes" 
  1354. SysSuspendMessages 
  1355. buttonUp
  1356. buttonUp
  1357. Really quit?
  1358. FirstPage
  1359. buttonUp
  1360. buttonUp
  1361. 1st Page
  1362. Summary of events under different conditions
  1363. 15 of  30
  1364. backPage
  1365. Previous
  1366. default
  1367. buttonUp
  1368. buttonUp
  1369. Previous
  1370. default
  1371. a) Lactose absent, glucose absent:
  1372. Repressor binds to operator. 
  1373. Glucose low, cAMP high 
  1374.  CAP-cAMP complex binds to CAP site.
  1375. RNA polymerase binds readily but no transcription due to presence of repressor
  1376. b) Lactose absent, glucose present:
  1377. Repressor binds to operator.
  1378. Glucose high, cAMP low 
  1379.  CAP cannot bind to CAP site
  1380. RNA polymerase binds but no transcription due to presence of repressor.
  1381.                                 Continued overleaf.
  1382. NextPage
  1383. default
  1384. buttonUp
  1385. buttonUp
  1386. default
  1387. ExitProgram
  1388. "Really quit?"\
  1389. f"Yes" 
  1390. SysSuspendMessages 
  1391. buttonUp
  1392. buttonUp
  1393. Really quit?
  1394. FirstPage
  1395. buttonUp
  1396. buttonUp
  1397. 1st Page
  1398. "image"
  1399. enterPage
  1400. enterPage
  1401. image
  1402. THE END
  1403. ExitProgram
  1404. FirstPage
  1405. 1st Page
  1406. 30 of  30
  1407. image
  1408. "quest11" 
  1409. "quest12" 
  1410. leavePage
  1411. leavePage
  1412. quest11
  1413. quest12
  1414. NextPage
  1415. 4questscore11
  1416. 4questscore12
  1417. B"y1" 
  1418. B"z1" 
  1419. B"a2" 
  1420. B"b2" 
  1421. B"c2" 
  1422. B"d2" 
  1423. B"e2" 
  1424. B"f2" 
  1425. B"g2" 
  1426. B"h2" 
  1427. default
  1428. buttonUp
  1429. buttonUp
  1430. default
  1431. questscore12
  1432. questscore11
  1433. 11. The CAP site binds :::::::::
  1434. CAP-cAMP complex
  1435. Catabolite Activator Protein
  1436. RNA polymerase
  1437. Lactose-repressor complex
  1438. Allolactose-repressor complex
  1439. quest11
  1440. quest12
  1441. 12. Lactose has which conformation :
  1442. Gluc b(1
  1443. 4) Gal
  1444. Gal b(1
  1445. 4) Gluc
  1446. Gluc a(1
  1447. 4) Gal
  1448. Gal  b(1
  1449. 6) Gluc
  1450. Gluc  b(1
  1451. 6) Gal
  1452. 23 of  30
  1453. --removes cross 
  1454. the answer boxes
  1455. "quest1" 
  1456. "quest2" 
  1457. leavePage
  1458. leavePage
  1459. quest1
  1460. quest2
  1461. quest1
  1462. 2. RNA polymerase binds to ::::
  1463. The operator
  1464. The repressor
  1465. The promoter
  1466. The CAP site
  1467. Allolactose
  1468. quest2
  1469. NextPage
  1470. --see 
  1471. --questscore1 
  1472. question 1. It 
  1473. zero 
  1474. Fincreases
  1475. decreases depending on which answer boxes are 
  1476. --same applies 
  1477. questscores 2-20
  1478. --checkboxes 
  1479. 6labelled a-z 
  1480. Fa1-z1 
  1481. Fa2-z2 etc (could have been 
  1482. /better)
  1483. --All forthcoming 
  1484. fquestions on 
  1485. layout except 
  1486. 4questscore2
  1487. B"a" 
  1488. B"b" 
  1489. B"c" 
  1490. B"d" 
  1491. B"e" 
  1492. B"f" 
  1493. B"g" 
  1494. B"h" 
  1495. B"i" 
  1496. B"j" 
  1497. default
  1498. buttonUp
  1499. buttonUp
  1500. default
  1501. questscore2
  1502. questscore1
  1503. 1. Which genes are controlled by the Lac Operon ::
  1504. b-galactosidase
  1505. Lactate dehydrogenase
  1506. Lactose Transacetylase
  1507. Lactose Permease
  1508. Lac repressor
  1509. 18 of  30
  1510. J    "    G    
  1511. 27 of  30
  1512. B"NextPage"
  1513. "quest19" 
  1514. "quest20" 
  1515. enterPage
  1516. leavePage
  1517. enterPage
  1518. NextPage
  1519. leavePage
  1520. quest19
  1521. quest20
  1522. "textgo"
  1523. leavePage
  1524. leavePage
  1525. textgo
  1526. RNApol
  1527. rna-s
  1528. text0.5
  1529. "text0.5"
  1530. buttonUp
  1531. buttonUp
  1532. text0.5
  1533. No lactose is present so the lac repressor binds to the operator...he probability that the RNA polymerase will bind to the promoter. The repressor also increases this probability.he RNA polymerase for the promoter
  1534. text1
  1535. "text1"
  1536. buttonUp
  1537. buttonUp
  1538. text1
  1539. Cyclic AMP binds to the CAP to form the CAP-cAMP complex. This then binds to the CAP siteeeeore readily.
  1540. text1.5
  1541. "text1.5"
  1542. buttonUp
  1543. buttonUp
  1544. text1.5
  1545. The RNA polymerase binds to the DNA and moves along the DNA strand until it reaches the promoter..reg##
  1546. text2
  1547. "text2"
  1548. buttonUp
  1549. buttonUp
  1550. text2
  1551. The CAP-cAMP complex interacts with the RNA polymerase increasing the probability that the RNA polymerase will bind to the promoter. The repressor also increases this probability...he RNA polymerase for the promoter
  1552. text3
  1553. "text3"
  1554. buttonUp
  1555. buttonUp
  1556. text3
  1557. The repressor stops the RNA polymerase from carrying out transcription so no mRNA is synthesised. This condition is observed until lactose is present in the cell. ell.   
  1558. textgo
  1559. "textgo"
  1560. buttonUp
  1561. buttonUp
  1562. textgo
  1563. REPEAT OR MOVE ON TO THE NEXT PAGE
  1564. ExitProgram
  1565. "Really quit?"\
  1566. f"Yes" 
  1567. SysSuspendMessages 
  1568. buttonUp
  1569. buttonUp
  1570. Really quit?
  1571. FirstPage
  1572. buttonUp
  1573. buttonUp
  1574. 1st Page
  1575. Press the "Animate" button
  1576. c) Events when Lactose & Glucose are absentttt.   concentration low
  1577. Cyclic AMP
  1578. RNA polymerase
  1579. Repressor
  1580. 13 of  30
  1581. Animation 4
  1582. Animate
  1583. camp1
  1584. "camp1"
  1585. buttonUp
  1586. buttonUp
  1587. camp1
  1588. "cap"
  1589. buttonUp
  1590. buttonUp
  1591. camp2
  1592. buttonUp
  1593. buttonUp
  1594. cap-camp
  1595. backPage
  1596. Previous
  1597. default
  1598. buttonUp
  1599. buttonUp
  1600. Previous
  1601. default
  1602. NextPage
  1603. default
  1604. buttonUp
  1605. buttonUp
  1606. default
  1607. :PHYSSIZE
  1608. Teaching and Learning Technology Programme
  1609. produced by the
  1610. The Lac Operon
  1611. Dr. John M. Basford & Andrew N. MacLennan
  1612. image
  1613. buttonUp
  1614. buttonUp
  1615. Start
  1616. default
  1617. buttonUp
  1618. buttonUp
  1619. default
  1620. "textgo"
  1621. "text1"
  1622. "RNApol" 
  1623. )-1095, 510
  1624. -1080, 420
  1625. -1005, 435
  1626. -945, 435
  1627. -900, 480
  1628. -825, 510
  1629. -765, 525
  1630. -675, 630
  1631. -585, 705
  1632. -465, 780
  1633. -315, 855
  1634. -150, 1020
  1635. 0, 1230
  1636. 240, 1485
  1637. 615, 1485
  1638. 990, 1485
  1639. 1485, 1485
  1640. "text2"
  1641. "al1" 
  1642. )4326, 510
  1643. 3906, 675
  1644. 3471, 825
  1645. 2886, 990
  1646. 2436, 1275
  1647. "al4" 
  1648. )4540, 421
  1649. 4030, 676
  1650. 3505, 931
  1651. 3250, 
  1652. 2796, 1485
  1653. "rep"
  1654. "rep2" 
  1655. )2265, 1095
  1656. 2340, 1050
  1657. 2415, 1005
  1658. 2475, 945
  1659. "al6" 
  1660. )3831, -84
  1661. 3801, 81
  1662. 3696, 321
  1663. 3576, 576
  1664. 3306, 786
  1665. 2991, 1056
  1666. "al7" 
  1667. )3366, -84
  1668. 3156, 306
  1669. 3006, 471
  1670. 2736, 771
  1671. 2646, 1281
  1672. Group
  1673. "rep3"
  1674. 2340, 1050
  1675. 2415, 1005
  1676. 2475, 945
  1677. 2580, 885
  1678. 2700, 810
  1679. 2790, 750
  1680. 2865, 675
  1681. 2955, 585
  1682. 3015, 495
  1683. 3195, 405
  1684. 3390, 315
  1685. "text3"
  1686. "text4"
  1687. trans 
  1688. )1935, 1615
  1689. "leftrans"
  1690. 240, 75.125, 100
  1691. 240, 75.125, 100
  1692. "rightrans"
  1693. 0, 75.3125, 0
  1694. 0, 75.6875, 0
  1695. "text5"
  1696. !"ab1" 
  1697. )1785, 2070
  1698. 795, 2480
  1699. !"ab2" 
  1700. )1785, 2070
  1701. 950, 2750
  1702. !"ab3" 
  1703. )1785, 2070
  1704. 585, 2655
  1705. Ungroup
  1706. 1275, 1305
  1707. 1185, 1215
  1708. 1125, 1155
  1709. 1065, 1065
  1710. 1005, 1035
  1711. 930, 945
  1712. 885, 870
  1713. 840, 795
  1714. 780, 705
  1715. 630, 480
  1716. 525, 405
  1717. 330, 285
  1718. 105, 165
  1719. -105, 75
  1720. -315, -15
  1721. 630, 480
  1722. !"pa"
  1723. "text6"
  1724. !"pa"
  1725. "rna-s" 
  1726. 2235, 1455
  1727. 0, 75.3125, 0
  1728. 0, 75.3125, 0
  1729. 120, 75.125, 100
  1730. 120, 75.125, 100
  1731. 2295, 1645
  1732. 2610, 1455
  1733. 120, 75.125, 100
  1734. 120, 75.125, 100
  1735. 60, 87.625, 100
  1736. 60, 87.625, 100
  1737. 2670, 1645
  1738. "pc" 
  1739. 2985, 1455
  1740. 60, 87.625, 100
  1741. 60, 87.625, 100
  1742. 0, 87.625, 100
  1743. 0, 87.625, 100
  1744. 3060, 1645
  1745. "pd" 
  1746. 3345, 1455
  1747. 0, 87.625, 100
  1748. 0, 87.625, 100
  1749. 0, 87.625, 100
  1750. 0, 87.625, 100
  1751. 3420, 1645
  1752. "pe" 
  1753. 3720, 1455
  1754. 0, 87.625, 100
  1755. 0, 87.625, 100
  1756. 0, 87.625, 100
  1757. 0, 87.625, 100
  1758. 3810, 1645
  1759. "pf" 
  1760. 4080, 1455
  1761. 0, 87.625, 100
  1762. 0, 87.625, 100
  1763. 60, 87.625, 100
  1764. 60, 87.625,100
  1765. 4185, 1645
  1766. "pg" 
  1767. 4500, 1455
  1768. 60, 87.625, 100
  1769. 60, 87.625, 100
  1770. 180, 87.625, 100 
  1771. 180, 87.625, 100
  1772. 4575, 1645
  1773. "ph" 
  1774. 4845, 1455
  1775. 180, 87.625, 100 
  1776. 180, 87.625, 100
  1777. 180, 87.625, 100 
  1778. 180, 87.625, 100
  1779. 4965, 1645
  1780. 5280, 1455
  1781. 180, 87.625, 100 
  1782. 180, 87.625, 100
  1783. 60, 87.625, 100 
  1784. 60, 87.625, 100
  1785. 5325, 1645
  1786. "pj" 
  1787. 5610, 1455
  1788. 60, 87.625, 100 
  1789. 60, 87.625, 100
  1790. 0, 75.125, 100 
  1791. 0, 75.125, 100
  1792. 5700, 1645
  1793. "pk" 
  1794. 6015, 1455
  1795. 0, 75.125, 100 
  1796. 0, 75.125, 100
  1797. 0, 75.125, 100 
  1798. 0, 75.125, 100
  1799. 6090, 1645
  1800. "pl" 
  1801. 6360, 1455
  1802. 0, 75.125, 100 
  1803. 0, 75.125, 100
  1804. 60, 87.625, 100 
  1805. 60, 87.625, 100
  1806. 6450, 1645
  1807. "pm" 
  1808. "text7"
  1809. 6750, 1455
  1810. 60, 87.625, 100
  1811. 60, 87.625, 100
  1812. 60, 87.625, 100 
  1813. 60, 87.625, 100
  1814. 6840, 1645
  1815. "pn" 
  1816. "po" 
  1817. 990, 120
  1818. "text8"
  1819. "text9"
  1820. 3441, 591
  1821. 3396, 471
  1822. 3381, 351
  1823. 3351, 246
  1824. 3321, 126
  1825. 3306, 66
  1826. 3291, -9
  1827. 3276, -84
  1828. 3921, 381
  1829. 3921, 336
  1830. 3921, 291
  1831. 3951, 276
  1832. 3951, 246
  1833. 3966, 216
  1834. 3981, 156
  1835. 3981, 111
  1836. 4011, 81
  1837. 4011, 36
  1838. 4011, -9
  1839. 4011, -24
  1840. 4011, -84
  1841. "al5"
  1842. 3591, 366
  1843. "rep1b"
  1844. "al8"
  1845. "rep4"
  1846. )3408, 321
  1847. 3606, 306
  1848. 3636, 231
  1849. 3636, 186
  1850. 3636, 111
  1851. 3636, 66
  1852. 3636, 36
  1853. 3636, -24
  1854. 3636, -69
  1855. 3348, 426
  1856. 3258, 516
  1857. 3108, 591
  1858. 3033, 636
  1859. 2898, 696
  1860. 2763, 771
  1861. 2673, 831
  1862. 2538, 921
  1863. 2463, 981
  1864. 2373, 1086
  1865. 2313, 1146
  1866. 2283, 1161
  1867. 2916, 1476
  1868. 3066, 1401
  1869. 3186, 1296
  1870. 3381, 1131
  1871. 3546, 876
  1872. 3636, 666
  1873. 3741, 456
  1874. 3831, 261
  1875. 3921, 126
  1876. 3951, -69
  1877. )3390, 315
  1878. 3561, 426
  1879. 3891, 651
  1880. default 
  1881. buttonUp
  1882. O4buttonUp
  1883. textgo
  1884. text1
  1885. RNApol
  1886. RNApol
  1887. text2
  1888. Group
  1889. text3
  1890. text4
  1891. leftrans
  1892. leftrans
  1893. leftrans
  1894. rightrans
  1895. rightrans
  1896. rightrans
  1897. text5
  1898. RNApol
  1899. WUngroup
  1900. text6
  1901. rna-s
  1902. leftrans
  1903. leftrans
  1904. leftrans
  1905. rightrans
  1906. rightrans
  1907. rightrans
  1908. trans
  1909. rna-s
  1910. leftrans
  1911. leftrans
  1912. leftrans
  1913. rightrans
  1914. rightrans
  1915. rightrans
  1916. trans
  1917. rna-s
  1918. leftrans
  1919. leftrans
  1920. leftrans
  1921. rightrans
  1922. rightrans
  1923. rightrans
  1924. trans
  1925. rna-s
  1926. leftrans
  1927. leftrans
  1928. leftrans
  1929. rightrans
  1930. rightrans
  1931. rightrans
  1932. trans
  1933. rna-s
  1934. leftrans
  1935. leftrans
  1936. leftrans
  1937. rightrans
  1938. rightrans
  1939. rightrans
  1940. trans
  1941. rna-s
  1942. leftrans
  1943. leftrans
  1944. leftrans
  1945. rightrans
  1946. rightrans
  1947. rightrans
  1948. trans
  1949. rna-s
  1950. leftrans
  1951. leftrans
  1952. leftrans
  1953. rightrans
  1954. rightrans
  1955. rightrans
  1956. trans
  1957. rna-s
  1958. leftrans
  1959. leftrans
  1960. leftrans
  1961. rightrans
  1962. rightrans
  1963. rightrans
  1964. trans
  1965. rna-s
  1966. leftrans
  1967. leftrans
  1968. leftrans
  1969. rightrans
  1970. rightrans
  1971. rightrans
  1972. trans
  1973. rna-s
  1974. leftrans
  1975. leftrans
  1976. leftrans
  1977. rightrans
  1978. rightrans
  1979. rightrans
  1980. trans
  1981. rna-s
  1982. leftrans
  1983. leftrans
  1984. leftrans
  1985. rightrans
  1986. rightrans
  1987. rightrans
  1988. trans
  1989. rna-s
  1990. leftrans
  1991. leftrans
  1992. leftrans
  1993. rightrans
  1994. rightrans
  1995. rightrans
  1996. trans
  1997. text7
  1998. rna-s
  1999. leftrans
  2000. leftrans
  2001. leftrans
  2002. rightrans
  2003. rightrans
  2004. rightrans
  2005. trans
  2006. trans
  2007. rna-s
  2008. Group
  2009. RNApol
  2010. RNApol
  2011. sendToBack
  2012. RNApol
  2013. text8
  2014. text9
  2015. WUngroup
  2016. WUngroup
  2017. rep1b
  2018. Group
  2019. WUngroup
  2020. rep1b
  2021. rep1b
  2022. Group
  2023. text1
  2024. text2
  2025. text3
  2026. text4
  2027. text5
  2028. text6
  2029. text7
  2030. text8
  2031. text9
  2032. textgo
  2033. default
  2034. trans
  2035. rightrans
  2036. rightrans
  2037. trans
  2038. trans
  2039. rna-s
  2040. Group
  2041. RNApol
  2042. RNApol
  2043. sendToBack
  2044. RNApol
  2045. text8
  2046. text9
  2047. WUngroup
  2048. WUngroup
  2049. rep1b
  2050. Group
  2051. WUngroup
  2052. rep1b
  2053. rep1b
  2054. Group
  2055. text1
  2056. text1b
  2057. text2
  2058. text3
  2059. text4
  2060. text5
  2061. text6
  2062. text7
  2063. text8
  2064. text9
  2065. textgo
  2066. trans
  2067. horizPos:by
  2068. horizPos:to
  2069. horizPos
  2070. "quest5" 
  2071. "quest6" 
  2072. leavePage
  2073. leavePage
  2074. quest5
  2075. quest6
  2076. 5. Allolactose binds to ::::or:
  2077. Promoter
  2078. Operator
  2079. Repressor
  2080. CAP site
  2081. Lactose permease
  2082. 6. The Catabolite Activator Protein binds to ::
  2083. Allolactose
  2084. CAP site
  2085. Cyclic AMP
  2086. Promoter
  2087. Operator
  2088. quest5
  2089. quest6
  2090. NextPage
  2091. 4questscore5
  2092. 4questscore6
  2093. B"u" 
  2094. B"v" 
  2095. B"w" 
  2096. B"x" 
  2097. B"y" 
  2098. B"z" 
  2099. B"a1" 
  2100. B"b1" 
  2101. B"c1" 
  2102. B"d1" 
  2103. default
  2104. buttonUp
  2105. buttonUp
  2106. default
  2107. questscore6
  2108. questscore5
  2109. 20 of  30
  2110. [Allolactose] 
  2111. There is a small amount of permease always present in the cell membrane of the E.coli so lactose is able to enter the cell, but the rate of uptake is slow.
  2112. Some of the lactose is converted to allolactose which binds to the repressor, causing the affinity of the repressor for the operator to be lost             
  2113. NextPage
  2114. buttonUp
  2115. buttonUp
  2116. BIBLIOGRAPHY
  2117. D. Voet &  J.G Voet- BIOCHEMISTRY-  published  1990   Pages 868-870
  2118. L. Styrer - BIOCHEMISTRY - 3rd Edition, published 1988, Pages 799 - 805
  2119. B. Lewin - GENES IV - published 1990, Pages 240 - 261 
  2120. W.A. Rees et al. - Evidence of DNA Bending in Transcription Complexes                                                           Imaged by Scanning Force Microscopy -SCIENCE, Vol 260, 11th June 1993333333333333333 11th June 1993
  2121. 29 of  30
  2122. ExitProgram
  2123. "Really quit?"\
  2124. f"Yes" 
  2125. SysSuspendMessages 
  2126. buttonUp
  2127. buttonUp
  2128. Really quit?
  2129. FirstPage
  2130. buttonUp
  2131. buttonUp
  2132. 1st Page
  2133. default
  2134. buttonUp
  2135. buttonUp
  2136. default
  2137. 1st Page
  2138. "image"
  2139. Ungroup
  2140. "pol" 
  2141. 240, 62.5625, 100
  2142. "rep" 
  2143. 120, 37.625, 100
  2144. 240, 75.125, 100
  2145. 120, 75.125, 100
  2146. 240, 87.625, 100
  2147. 120, 87.625, 100
  2148. 60, 87.625, 100
  2149. 60, 87.625, 100
  2150. "dna" 
  2151. 240, 50, 100
  2152. 120, 25.125, 100
  2153. Group
  2154. buttonUp
  2155. buttonUp
  2156. image
  2157. WUngroup
  2158. Group
  2159. image
  2160. image
  2161. "quest1" 
  2162. "quest2" 
  2163. leavePage
  2164. leavePage
  2165. quest1
  2166. quest2
  2167. quest1
  2168. 2. RNA polymerase binds to ::::
  2169. The operator
  2170. The repressor
  2171. The promoter
  2172. The CAP site
  2173. Allolactose
  2174. quest2
  2175. NextPage
  2176. 4questscore1
  2177. 4questscore2
  2178. B"a" 
  2179. B"b" 
  2180. B"c" 
  2181. B"d" 
  2182. B"e" 
  2183. B"f" 
  2184. B"g" 
  2185. B"h" 
  2186. B"i" 
  2187. B"j" 
  2188. default
  2189. buttonUp
  2190. buttonUp
  2191. default
  2192. questscore2
  2193. questscore1
  2194. 1. Which genes are controlled by the Lac Operon ::
  2195. b-galactosidase
  2196. Lactate dehydrogenase
  2197. Lactose Transacetylase
  2198. Lactose Permease
  2199. Lac repressor
  2200. 18 of  30
  2201. buttonUp
  2202. buttonUp
  2203. 1st Page
  2204. text3
  2205. text0.5
  2206. text1
  2207. text2
  2208. text3
  2209. textgo
  2210. backPage
  2211. Previous
  2212. buttonUp
  2213. buttonUp
  2214. Previous
  2215. NextPage
  2216. buttonUp
  2217. buttonUp
  2218. ExitProgram
  2219. "Really quit?"\
  2220. f"Yes" 
  2221. SysSuspendMessages 
  2222. buttonUp
  2223. buttonUp
  2224. Really quit?
  2225. FirstPage
  2226. buttonUp
  2227. buttonUp
  2228. 1st Page
  2229. c) Lactose present, glucose present:
  2230. Lactose taken up at slow rate by small amount of permease present in the cell.
  2231. Some lactose turned into allolactose.
  2232. Allolactose binds to repressor which loses its affinity for the operator.
  2233. Glucose high, cAMP low 
  2234.  CAP cannot bind to CAP site
  2235. RNA polymerase binds  and a modest level of transcription takes place.
  2236. d) Lactose present, glucose absent:
  2237. Lactose taken up at slow rate by small amount of permease present in the cell.
  2238. Some lactose turned into allolactose.
  2239. Allolactose binds to repressor which loses its affinity for the operator.
  2240. Glucose low, cAMP high 
  2241.  CAP-cAMP complex binds to CAP site.
  2242. RNA polymerase binds readily to the promoter and a high level of transcription takes place. 
  2243. 16 of  30
  2244. The lac operon has an inefficient promoter, meaning that the RNA polymerase  has a low probability of binding to the promoter. This means that the normal rate of transcription of the  lac operon is low. 
  2245. The 'Catabolite Activator Protein' (CAP), when bound to cyclic AMP, causes an increase in the rate of transcription by two possible methods:
  2246. 1. CAP  may induce a bend in the DNA of approximately 90
  2247.  which is usually induced by the RNA polymerase. DNA bending may encourage RNA polymerase - promoter association, or produce elastic energy which may be used later on in transcription.   
  2248.  2. CAP may increase the rate of formation of the closed complex by directly interacting with the RNA polymerase, decreasing the probability of dissociation of the RNA polymerase from the promoter. However this seems less likely from evidence gained from the study of other operons where the promoter and CAP site are further apart.     nsidered.    
  2249. "The CAP 
  2250. a dimer 
  2251. two 22,500 dalton polypeptide chains. 
  2252. 5can only bind 
  2253. Fsite 
  2254. complexed 
  2255. fcyclic AMP, due 
  2256. a change 
  2257. shape 
  2258. ;protein. Binding 
  2259. -cAMP 
  2260. [results 
  2261. a increased rate 
  2262. transcription."
  2263. buttonUp
  2264. buttonUp
  2265. The CAP is a dimer of two 22,500 dalton polypeptide chains. The CAP can only bind to the CAP site when it is complexed with cyclic AMP, due to a change in shape of the protein. Binding of the CAP-cAMP complex to the CAP site results in a increased rate of transcription.
  2266. ckPage
  2267. Previous
  2268. buttonUp
  2269. buttonUp
  2270. Previous
  2271. xtPage
  2272. buttonUp
  2273. buttonUp
  2274. R    *    O    
  2275. 12 of  30
  2276. ExitProgram
  2277. "Really quit?"\
  2278. f"Yes" 
  2279. SysSuspendMessages 
  2280. buttonUp
  2281. buttonUp
  2282. Really quit?
  2283. FirstPage
  2284. buttonUp
  2285. buttonUp
  2286. 1st Page
  2287. backPage
  2288. Previous
  2289. default
  2290. buttonUp
  2291. buttonUp
  2292. Previous
  2293. default
  2294. NextPage
  2295. default
  2296. buttonUp
  2297. buttonUp
  2298. default
  2299. )b(O)
  2300. You can distribute the unmodified material freely and modify it to your own requirements. However, we ask the following:
  2301. 1. By all means give yourself credit for your work in your books but please leave this page unaltered in this book.
  2302. 2. It is important that teaching material of this kind is disseminated as widely as possible, so please ensure that your material is also freely available.
  2303. 3. Please send a copy of any modified or expanded versions of this program to Dr J.M Basford, Department of Biochemistry, University of Wales, Cardiff, CF1 1ST , Tel 44 222-874119 Fax 44 222-874116. 
  2304. Internet Basford @Cardiff.ac.uk
  2305. buttonUp
  2306. buttonUp
  2307. Continue
  2308. default
  2309. buttonUp
  2310. buttonUp
  2311. default
  2312. "image"
  2313. Ungroup
  2314. "pol" 
  2315. 240, 62.5625, 100
  2316. "rep" 
  2317. 120, 37.625, 100
  2318. 240, 75.125, 100
  2319. 120, 75.125, 100
  2320. 240, 87.625, 100
  2321. 120, 87.625, 100
  2322. 60, 87.625, 100
  2323. 60, 87.625, 100
  2324. "dna" 
  2325. 240, 50, 100
  2326. 120, 25.125, 100
  2327. Group
  2328. default
  2329. buttonUp
  2330. buttonUp
  2331. image
  2332. WUngroup
  2333. Group
  2334. image
  2335. image
  2336. default
  2337. Continue
  2338. barchart
  2339. backPage
  2340. Previous
  2341. default
  2342. buttonUp
  2343. buttonUp
  2344. Previous
  2345. default
  2346. NextPage
  2347. default
  2348. buttonUp
  2349. buttonUp
  2350. default
  2351. Glucose
  2352. Cyclic AMP
  2353. Cyclic AMP (cAMP) is a secondary messenger molecule in many cells. The level of cyclic AMP is controlled by the amount of glucose present in a cell. When the glucose concentration is high, the cyclic AMP concentration is low. As the glucose concentration decreases the cyclic AMP concentration increases. Cyclic AMP is therefore known as the 'starvation signal'.
  2354.     % 1_
  2355. "Adenosine-3',5'-cyclic monophosphate (cAMP) 
  2356. formed 
  2357. Hthe action 
  2358. adenylate cyclase. The 5' 
  2359. )3' hydroxy 
  2360. 9ribose are linked together 
  2361. d a ring."
  2362. buttonUp
  2363. buttonUp
  2364. Adenosine-3',5'-cyclic monophosphate (cAMP) is formed from AMP by the action of adenylate cyclase. The 5' phosphate group and the 3' hydroxy group of the ribose are linked together to form a ring.
  2365. ckPage
  2366. Previous
  2367. buttonUp
  2368. buttonUp
  2369. Previous
  2370. xtPage
  2371. buttonUp
  2372. buttonUp
  2373. Glucose 
  2374. Concentration 
  2375. (mM)%)
  2376. 4y1, y2, speed
  2377. y1 > 2280
  2378. y1 < 2280
  2379. y2 < 4080
  2380. y2> 4080
  2381. buttonUp
  2382. buttonUp
  2383. speed
  2384. "Really quit?"\
  2385. f"Yes" 
  2386. SysSuspendMessages 
  2387. buttonUp
  2388. buttonUp
  2389. Really quit?
  2390. Increase
  2391. [Glucose]   
  2392. 4y1, y2, speed
  2393. y1 < 4080
  2394. y1 > 4080
  2395. y2 > 2280
  2396. y2 < 2280
  2397. buttonUp
  2398. buttonUp
  2399. speed
  2400. "Really quit?"\
  2401. f"Yes" 
  2402. SysSuspendMessages 
  2403. buttonUp
  2404. buttonUp
  2405. Really quit?
  2406. Decrease
  2407. [Glucose]   
  2408. height
  2409. Cyclic AMP 
  2410. Concentration 
  2411. (x 10   M)
  2412. 11 of  30
  2413. ExitProgram
  2414. "Really quit?"\
  2415. f"Yes" 
  2416. SysSuspendMessages 
  2417. buttonUp
  2418. buttonUp
  2419. Really quit?
  2420. FirstPage
  2421. buttonUp
  2422. buttonUp
  2423. 1st Page
  2424. -- y1 
  2425. the height 
  2426. bar, y2 
  2427. -- speed 
  2428. how much 
  2429. 3bars increase 
  2430. decrease 
  2431. -- On entering 
  2432. 7are returned 
  2433. their 
  2434. positions
  2435. 4y1, y2
  2436. "barchart" 
  2437. 2670, 3210, 3360, 4080
  2438. 3735, 3210, 4425, 4080
  2439. enterPage
  2440. enterPage
  2441. barchart
  2442. barchart
  2443. speed
  2444. "dna" 
  2445. buttonUp
  2446. buttonUp
  2447. image
  2448. WUngroup
  2449. trans
  2450. Buttons Used In The Following Pagess
  2451. ExitProgram
  2452. backPage
  2453. NextPage
  2454. FirstPage
  2455. 1st Page
  2456. Move to the next page
  2457. Return to previous page
  2458. Return to the first page of 
  2459. Exit to Windows
  2460. Animate
  2461. Animate
  2462. Animates the sequence of events on that page
  2463. Hotwords -     These are words that are scattered round the text and are shown in italic,             bold,  underlined  type  and are  larger  than the  surrounding  text. They             become  active when  the mouse  operated cursor  is placed  over them. 
  2464.         Try pressing this Hotword now! 
  2465. ExitProgram
  2466. buttonUp
  2467. buttonUp
  2468. buttonUp
  2469. buttonUp
  2470. Really quit?
  2471. NextPage
  2472. buttonUp
  2473. buttonUp
  2474. FirstPage
  2475. buttonUp
  2476. 1st Page
  2477. Go on to the next page by clicking the  
  2478.   button below: 
  2479. "Really quit?"\
  2480. f"Yes" 
  2481. SysSuspendMessages 
  2482. buttonUp
  2483. buttonUp
  2484. Really quit?
  2485. -- Puts the sentence 
  2486. quotation marks 
  2487. a dialog box which can be removed 
  2488. Hclicking 
  2489. "Activating a HOTWORD will present you 
  2490. dthat may contain definitions, references, hints 
  2491. tips, prompts 
  2492. other forms 
  2493. encouragement. Press OK 
  2494. buttonDown
  2495. buttonDown
  2496. Activating a HOTWORD will present you with a dialog box that may contain definitions, references, hints and tips, prompts or other forms of encouragement. Press OK to continue
  2497. default
  2498. buttonUp
  2499. buttonUp
  2500. default
  2501. Times New Roman
  2502. Times New Roman
  2503. Times New Roman
  2504. Times New Roman
  2505. Basic
  2506. b -Galactosidasee
  2507. Lactose
  2508. Lactose
  2509. Glucose + Galactose
  2510. TCA cycle
  2511. Glycolysis
  2512. Permease
  2513. Glucose
  2514. The situation is more complex than this because glucose is the preferred substrate of the E.coli. Therefore, if glucose is present then the bacterium will metabolise the glucose in preference to the lactose- no additional enzymes are needed.  eded.  etabolized.tabolized. be metabolized.metabolized.abolized.tabolized.tabolized.e metabolized.
  2515. However -
  2516. ckPage
  2517. Previous
  2518. buttonUp
  2519. buttonUp
  2520. Previous
  2521. xtPage
  2522. buttonUp
  2523. buttonUp
  2524. 10 of  30
  2525. ExitProgram
  2526. "Really quit?"\
  2527. f"Yes" 
  2528. SysSuspendMessages 
  2529. buttonUp
  2530. buttonUp
  2531. Really quit?
  2532. FirstPage
  2533. buttonUp
  2534. buttonUp
  2535. 1st Page
  2536. backPage
  2537. Previous
  2538. default
  2539. buttonUp
  2540. buttonUp
  2541. Previous
  2542. default
  2543. NextPage
  2544. default
  2545. buttonUp
  2546. buttonUp
  2547. default
  2548. 7 of  27
  2549. Press the "Animate" button
  2550. Basic
  2551. "textgo"
  2552. "text1"
  2553. --Repressor protein (
  2554. rep) moves 
  2555. screen 
  2556. )4668, -384 
  2557. 4608, -324
  2558. 4533, -279
  2559. 4428, -189
  2560. 4278, -54
  2561. 4143, 96
  2562. 4008, 201
  2563. 3783, 351
  2564. 3573, 471
  2565. 3363, 606
  2566. 3183, 696
  2567. 3003, 816
  2568. 2718, 996
  2569. 2298, 1191
  2570. "text2"
  2571. --RNA polymerase 
  2572. squashes up against 
  2573. repressor 3 times
  2574. "RNApol" 
  2575. )-1095, 510
  2576. -1080, 420
  2577. -1005, 435
  2578. -945, 435
  2579. -900, 480
  2580. -825, 510
  2581. -765, 525
  2582. -675, 630
  2583. -585, 705
  2584. -465, 780
  2585. -315, 855
  2586. -150, 1020
  2587. 0, 1230
  2588. 240, 1485
  2589. 615, 1485
  2590. 1065, 1485
  2591. 1125, 1470, 2298, 2185
  2592. 1185, 1470, 2298, 2185
  2593. 1260, 1470, 2298, 2185
  2594. 1335, 1470, 2298, 2185
  2595. 1395, 1470, 2298, 2185
  2596. 1425, 1470, 2298, 2185
  2597. 1395, 1470, 2298, 2185
  2598. 1365, 1470, 2298, 2185
  2599. 1305, 1470, 2298, 2185
  2600. 1215, 1470, 2298, 2185
  2601. 1155, 1470, 2298, 2185
  2602. 1125, 1470, 2298, 2185
  2603. 1185, 1470, 2298, 2185
  2604. 1260, 1470, 2298, 2185
  2605. 1335, 1470, 2298, 2185
  2606. 1395, 1470, 2298, 2185
  2607. 1425, 1470, 2298, 2185
  2608. 1395, 1470, 2298, 2185
  2609. 1365, 1470, 2298, 2185
  2610. 1305, 1485, 2298, 2185
  2611. 1215, 1500, 2298, 2185
  2612. 1155, 1515, 2298, 2185
  2613. 1125, 1470, 2298, 2185
  2614. 1185, 1470, 2298, 2185
  2615. 1260, 1470, 2298, 2185
  2616. 1335, 1470, 2298, 2185
  2617. 1395, 1470, 2298, 2185
  2618. 1425, 1470, 2298, 2185
  2619. 1395, 1470, 2298, 2185
  2620. 1335, 1470, 2298, 2185
  2621. 1260, 1500, 2298, 2185
  2622. 1185, 1515, 2298, 2185
  2623. 1125, 1515, 2298, 2185
  2624. "rep"
  2625. default 
  2626. buttonUp
  2627. buttonUp
  2628. textgo
  2629. text1
  2630. text2
  2631. RNApol
  2632. RNApol
  2633. text1
  2634. text2
  2635. RNApol
  2636. textgo
  2637. default
  2638. 4questscore19
  2639. 4questscore20
  2640. B"m3" 
  2641. B"n3" 
  2642. B"o3" 
  2643. B"p3" 
  2644. B"q3" 
  2645. B"r3" 
  2646. B"s3" 
  2647. B"t3" 
  2648. B"u3" 
  2649. B"v3" 
  2650. 4questscore18
  2651. 4questscore17
  2652. 4questscore16
  2653. 4questscore15
  2654. 4questscore14
  2655. 4questscore13
  2656. 4questscore12
  2657. 4questscore11
  2658. 4questscore10
  2659. 4questscore9
  2660. 4questscore8
  2661. 4questscore7
  2662. 4questscore6
  2663. 4questscore5
  2664. 4questscore4
  2665. 4questscore3
  2666. --System count 
  2667. questscores
  2668. --Obtain dialog box showing total no 
  2669. points    
  2670. "You scored" && 
  2671.  out 
  2672. a possible 100"
  2673. --shows nextpage 
  2674. B- avoids 
  2675. Bbeing pressed without 
  2676. --obtaining 
  2677. B"NextPage"
  2678. default
  2679. buttonUp
  2680. buttonUp
  2681. You scored
  2682. points out of a possible 100
  2683. NextPage
  2684. default
  2685. count
  2686. questscore1
  2687. questscore2
  2688. questscore3
  2689. questscore4
  2690. questscore5
  2691. questscore6
  2692. questscore7
  2693. questscore8
  2694. questscore9
  2695. questscore10
  2696. questscore11
  2697. questscore12
  2698. questscore13
  2699. questscore14
  2700. questscore15
  2701. questscore16
  2702. questscore17
  2703. questscore18
  2704. questscore20
  2705. questscore19
  2706. Press the "Anima
  2707. b) Lactose present as substrate::::::
  2708. Lactose
  2709. Permease
  2710. Lactose
  2711. [Allolactose] 
  2712. backPage
  2713. There is a small amount of permease always present in the cell membrane of the E.coli so lactose is able to enter the cell, but the rate of uptake is slow.
  2714. Some of the lactose is converted to allolactose which binds to the repressor, causing the affinity of the repressor for the operator to be lost             
  2715. Some of the lactose is converted to allolactose which binds to the repressor, reducing the affinity of the repressor for the operator.                slow.
  2716. Some of the lactose is converted to allolactose which binds to the repressor, causing the affinity of the repressor for the operator to be lost.            
  2717. NextPage
  2718. allolactose
  2719. that opens a simple dialog box
  2720. "Allolactose 
  2721. isomer 
  2722. whose structure 
  2723. [Beta Gal (1-6) 
  2724. luc].It 
  2725. known 
  2726. inducer molecule because 
  2727. brings about the initiation 
  2728. transcription"
  2729. buttonDown
  2730. buttonDown
  2731. Allolactose is an isomer of lactose whose structure is [Beta Gal (1-6) Beta Gluc].It is known as an inducer molecule because it brings about the initiation of transcription
  2732. The repressor dissociates from the operator allowing transcription to proceed. The three proteins are synthesised in large quantites.The elevated permease level allows  lactose to  enter the cell at a much higher rate than before.  e. rate than before. 
  2733. ckPage
  2734. Previous
  2735. buttonUp
  2736. buttonUp
  2737. Previous
  2738. xtPage
  2739. buttonUp
  2740. buttonUp
  2741. 8 of  30
  2742. ExitProgram
  2743. "Really quit?"\
  2744. f"Yes" 
  2745. SysSuspendMessages 
  2746. buttonUp
  2747. buttonUp
  2748. Really quit?
  2749. FirstPage
  2750. buttonUp
  2751. buttonUp
  2752. 1st Page
  2753. Previous
  2754. default
  2755. buttonUp
  2756. buttonUp
  2757. Previous
  2758. default
  2759. default
  2760. buttonUp
  2761. buttonUp
  2762. default
  2763. rna-s
  2764. "textgo"
  2765. "text1"
  2766. "rep" 
  2767. )4668, -384 
  2768. 4608, -324
  2769. 4533, -279
  2770. 4428, -189
  2771. 4278, -54
  2772. 4143, 96
  2773. 4008, 201
  2774. 3783, 351
  2775. 3573, 471
  2776. 3363, 606
  2777. 3183, 696
  2778. 3003, 816
  2779. 2718, 996
  2780. 2298, 1191
  2781. "text2"
  2782. "RNApol" 
  2783. )-1095, 510
  2784. -1080, 420
  2785. -1005, 435
  2786. -945, 435
  2787. -900, 480
  2788. -825, 510
  2789. -765, 525
  2790. -675, 630
  2791. -585, 705
  2792. -465, 780
  2793. -315, 855
  2794. -150, 1020
  2795. 0, 1230
  2796. 240, 1485
  2797. 615, 1485
  2798. 1065, 1485
  2799. 1125, 1470, 2298, 2185
  2800. 1185, 1470, 2298, 2185
  2801. 1260, 1470, 2298, 2185
  2802. 1335, 1470, 2298, 2185
  2803. 1395, 1470, 2298, 2185
  2804. 1425, 1470, 2298, 2185
  2805. 1395, 1470, 2298, 2185
  2806. 1365, 1470, 2298, 2185
  2807. 1305, 1470, 2298, 2185
  2808. 1215, 1470, 2298, 2185
  2809. 1155, 1470, 2298, 2185
  2810. 1125, 1470, 2298, 2185
  2811. 1185, 1470, 2298, 2185
  2812. 1260, 1470, 2298, 2185
  2813. 1335, 1470, 2298, 2185
  2814. 1395, 1470, 2298, 2185
  2815. 1425, 1470, 2298, 2185
  2816. 1395, 1470, 2298, 2185
  2817. 1365, 1470, 2298, 2185
  2818. 1305, 1485, 2298, 2185
  2819. 1215, 1500, 2298, 2185
  2820. 1155, 1515, 2298, 2185
  2821. 1125, 1470, 2298, 2185
  2822. 1185, 1470, 2298, 2185
  2823. 1260, 1470, 2298, 2185
  2824. 1335, 1470, 2298, 2185
  2825. 1395, 1470, 2298, 2185
  2826. 1425, 1470, 2298, 2185
  2827. 1395, 1470, 2298, 2185
  2828. 1335, 1470, 2298, 2185
  2829. 1260, 1500, 2298, 2185
  2830. 1185, 1515, 2298, 2185
  2831. 1125, 1515, 2298, 2185
  2832. buttonUp
  2833. buttonUp
  2834. textgo
  2835. text1
  2836. text2
  2837. RNApol
  2838. RNApol
  2839. text1
  2840. text2
  2841. RNApol
  2842. textgo
  2843. Lactose
  2844. Lactose
  2845. b - Galactosidase
  2846. Glucose + Galactose
  2847. TCA cycle
  2848. Glycolysis
  2849. Permease
  2850. ckPage
  2851. Previous
  2852. buttonUp
  2853. buttonUp
  2854. Previous
  2855.     xtPage
  2856. buttonUp
  2857. buttonUp
  2858. 2 of  30
  2859. ExitProgram
  2860. "Really quit?"\
  2861. f"Yes" 
  2862. SysSuspendMessages 
  2863. buttonUp
  2864. buttonUp
  2865. Really quit?
  2866. FirstPage
  2867. buttonUp
  2868. buttonUp
  2869. 1st Page
  2870. backPage
  2871. Previous
  2872. default
  2873. buttonUp
  2874. buttonUp
  2875. Previous
  2876. default
  2877. NextPage
  2878. default
  2879. buttonUp
  2880. buttonUp
  2881. default
  2882. Structure of the Lac Operon
  2883. Move the mouse into each of the coloured boxes.
  2884. Dialog
  2885. "Dialog"
  2886. mouseEnter
  2887. mouseEnter
  2888. Dialog
  2889. siteeeeee
  2890. --Promoter--
  2891. Operator
  2892. Lac Z
  2893. Lac Y
  2894. Lac A
  2895. backPage
  2896. NextPage
  2897. Dialog
  2898. CAP site
  2899. Put "CAP site - binds Catabolite Activator Protein 
  2900. attached 
  2901. cyclic AMP, i.e. only 
  2902. the glucose concentration 
  2903. low. The 
  2904. qattachment enhances 
  2905. 7efficiency 
  2906. fwhich 
  2907. LRNA polymerase 
  2908. apromoter, 
  2909. hence 
  2910. urate 
  2911. transcription. Like 
  2912. operator 
  2913. has a two-fold axis 
  2914. symmetry 
  2915. binding 
  2916. CAP-cAMP complex." 
  2917. "Dialog"
  2918. mouseEnter
  2919. mouseEnter
  2920. CAP site - binds Catabolite Activator Protein when attached to cyclic AMP, i.e. only when the glucose concentration is low. The CAP attachment enhances the efficiency with which the RNA polymerase binds with the promoter, and hence the rate of transcription. Like the operator it has a two-fold axis of symmetry for the binding of the CAP-cAMP complex.
  2921. Dialog
  2922. Promotor
  2923. MouseEnter
  2924. "Promoter region - site 
  2925. which RNA polymerase binds 
  2926. order 
  2927. initiate transcription. It occupies approximately 70 bp, starting 
  2928. -50 upstream 
  2929. finishing 
  2930. +20 downstream 
  2931. "Dialog"
  2932. MouseEnter
  2933. MouseEnter
  2934. Promoter region - site to which RNA polymerase binds in order to initiate transcription. It occupies approximately 70 bp, starting at position -50 upstream of the transcription start site and finishing at position +20 downstream of the transcription start site.
  2935. Dialog
  2936. Operator
  2937. "Operator 
  2938. repressor binding site - 
  2939. stopping transcription 
  2940. being initiated. It 
  2941. approximately 26 bp 
  2942. \, starting 
  2943. -5 upstream 
  2944. ending 
  2945. +21 downstream 
  2946. . The operator has a two-fold axis 
  2947. symmetry which plays a part 
  2948. "Dialog"
  2949. mouseEnter
  2950. mouseEnter
  2951. Operator or repressor binding site - repressor binds to this site stopping transcription from being initiated. It is approximately 26 bp long, starting at position -5 upstream from the transcription start site and ending at position +21 downstream from transcription start site. The operator has a two-fold axis of symmetry which plays a part in the binding of the repressor.
  2952. Dialog
  2953. Lac Z
  2954. Put "LacZ: gene that codes 
  2955. Beta-galactosidase - breaks the glycosidic bond 
  2956. lactose 
  2957. yield glucose 
  2958. galactose. 
  2959. a tetramer 
  2960. four 125,000 dalton polypeptide chains." 
  2961. "Dialog"
  2962. mouseEnter
  2963. mouseEnter
  2964. LacZ: gene that codes for Beta-galactosidase - breaks the glycosidic bond in the lactose to yield glucose and galactose. Beta-galactosidase is a tetramer of four 125,000 dalton polypeptide chains.
  2965. Dialog
  2966. Lac Y
  2967. Put "LacY: gene that codes 
  2968. lactose permease - a membrane bound protein 
  2969. 6allows the transport 
  2970. Athrough 
  2971. cell. The 
  2972. 8has a molecular weight 
  2973. 30,000 daltons." 
  2974. Sext 
  2975. "Dialog"
  2976. mouseEnter
  2977. mouseEnter
  2978. LacY: gene that codes for lactose permease - a membrane bound protein that allows the transport of lactose through the membrane into the cell. The protein has a molecular weight of 30,000 daltons.
  2979. Dialog
  2980. Lac A
  2981. "LacA: gene that codes 
  2982. lactose transacetylase - transfers 
  2983. -CoA 
  2984. .. The reason 
  2985. xfully understood but may give 
  2986. advantage 
  2987. bacteria are grown 
  2988. a medium containing analogs 
  2989. 7cannot metabolise, because acetylation results 
  2990. detoxification 
  2991. excretion." 
  2992. "Dialog"
  2993. mouseEnter
  2994. mouseEnter
  2995. LacA: gene that codes for lactose transacetylase - transfers acetyl group from acetyl-CoA to lactose. The reason for this is not fully understood but may give an advantage when bacteria are grown in a medium containing analogs of lactose that the bacteria cannot metabolise, because acetylation results in detoxification and excretion.
  2996. Dialog
  2997. Overlap
  2998. "There 
  2999. overlap between the promoter region 
  3000. operator. However, 
  3001. (RNA polymerase 
  3002. ;repressor can bind 
  3003. Qoperon 
  3004. \same 
  3005. I- they are 
  3006. xmutually exclusive." 
  3007. "Dialog"
  3008. mouseEnter
  3009. mouseEnter
  3010. There is an overlap between the promoter region and the operator. However, the RNA polymerase and the repressor can bind to the operon at the same time - they are not mutually exclusive.
  3011. Dialog
  3012. ckPage
  3013. Previous
  3014. buttonUp
  3015. buttonUp
  3016. Previous
  3017.  xtPage
  3018. buttonUp
  3019. buttonUp
  3020. f!>!c!
  3021. 3 of  30
  3022. ExitProgram
  3023. "Really quit?"\
  3024. f"Yes" 
  3025. SysSuspendMessages 
  3026. buttonUp
  3027. buttonUp
  3028. Really quit?
  3029. FirstPage
  3030. buttonUp
  3031. buttonUp
  3032. 1st Page
  3033. -- Text 
  3034. removed 
  3035. cursor leaves the coloured areas
  3036. "Dialog"
  3037. mouseLeave
  3038. mouseLeave
  3039. Dialog
  3040. Previous
  3041. default
  3042. buttonUp
  3043. buttonUp
  3044. Previous
  3045. default
  3046. default
  3047. buttonUp
  3048. buttonUp
  3049. default
  3050. Questions
  3051. ckPage
  3052. Previous
  3053. buttonUp
  3054. buttonUp
  3055. Previous
  3056. xtPage
  3057. buttonUp
  3058. buttonUp
  3059. This section contains 20 questions based on the information in the previous pages which will take about 10 minutes to complete. Once in the quiz it is only possible to go forwards - it is not possible to exit or return to previous pages.us pages
  3060. GOOD LUCK!
  3061. 17 of  30
  3062. ExitProgram
  3063. "Really quit?"\
  3064. f"Yes" 
  3065. SysSuspendMessages 
  3066. buttonUp
  3067. buttonUp
  3068. Really quit?
  3069. FirstPage
  3070. buttonUp
  3071. buttonUp
  3072. 1st Page
  3073. backPage
  3074. Previous
  3075. default
  3076. buttonUp
  3077. buttonUp
  3078. Previous
  3079. default
  3080. NextPage
  3081. default
  3082. buttonUp
  3083. buttonUp
  3084. default
  3085. "textgo"
  3086. "text1"
  3087. "rep" 
  3088. )4668, -384 
  3089. 4608, -324
  3090. 4533, -279
  3091. 4428, -189
  3092. 4278, -54
  3093. 4143, 96
  3094. 4008, 201
  3095. 3783, 351
  3096. 3573, 471
  3097. 3363, 606
  3098. 3183, 696
  3099. 3003, 816
  3100. 2718, 996
  3101. 2298, 1191
  3102. "text2"
  3103. "RNApol" 
  3104. )-1095, 510
  3105. -1080, 420
  3106. -1005, 435
  3107. -945, 435
  3108. -900, 480
  3109. -825, 510
  3110. -765, 525
  3111. -675, 630
  3112. -585, 705
  3113. -465, 780
  3114. -315, 855
  3115. -150, 1020
  3116. 0, 1230
  3117. 240, 1485
  3118. 615, 1485
  3119. 1065, 1485
  3120. 1125, 1470, 2298, 2185
  3121. 1185, 1470, 2298, 2185
  3122. 1260, 1470, 2298, 2185
  3123. 1335, 1470, 2298, 2185
  3124. 1395, 1470, 2298, 2185
  3125. 1425, 1470, 2298, 2185
  3126. 1395, 1470, 2298, 2185
  3127. 1365, 1470, 2298, 2185
  3128. 1305, 1470, 2298, 2185
  3129. 1215, 1470, 2298, 2185
  3130. 1155, 1470, 2298, 2185
  3131. 1125, 1470, 2298, 2185
  3132. 1185, 1470, 2298, 2185
  3133. 1260, 1470, 2298, 2185
  3134. 1335, 1470, 2298, 2185
  3135. 1395, 1470, 2298, 2185
  3136. 1425, 1470, 2298, 2185
  3137. 1395, 1470, 2298, 2185
  3138. 1365, 1470, 2298, 2185
  3139. 1305, 1485, 2298, 2185
  3140. 1215, 1500, 2298, 2185
  3141. 1155, 1515, 2298, 2185
  3142. 1125, 1470, 2298, 2185
  3143. 1185, 1470, 2298, 2185
  3144. 1260, 1470, 2298, 2185
  3145. 1335, 1470, 2298, 2185
  3146. 1395, 1470, 2298, 2185
  3147. 1425, 1470, 2298, 2185
  3148. 1395, 1470, 2298, 2185
  3149. 1335, 1470, 2298, 2185
  3150. 1260, 1500, 2298, 2185
  3151. 1185, 1515, 2298, 2185
  3152. 1125, 1515, 2298, 2185
  3153. default 
  3154. buttonUp
  3155. buttonUp
  3156. textgo
  3157. text1
  3158. text2
  3159. RNApol
  3160. RNApol
  3161. text1
  3162. text2
  3163. RNApol
  3164. textgo
  3165. default
  3166. buttonUp
  3167. buttonUp
  3168. Start
  3169. buttonUp
  3170. buttonUp
  3171. "textgo"
  3172. leavePage
  3173. leavePage
  3174. textgo
  3175. )<,f/
  3176. ;$?6A
  3177. G|H|H
  3178. RNApol
  3179. rna-s
  3180. textall
  3181. text0.5
  3182. "text0.5"
  3183. buttonUp
  3184. buttonUp
  3185. text0.5
  3186. RNA polymerase binds to the DNA then moves up and down the DNA strand until the promoter is reached. The interaction between the promoter and RNA polymerase is weak so the enzyme has a low probability of binding to the promoter........................................
  3187. text1
  3188. "text1"
  3189. buttonUp
  3190. buttonUp
  3191. text1
  3192. When RNA polymerase does bind to the DNA, it melts a section into single strands to form open complex. Abortive initiation occurs until sigma unit dissociates and the core enzyme can move along the DNA.
  3193. text2
  3194. "text2"
  3195. buttonUp
  3196. buttonUp
  3197. text2
  3198. Abortive initiation occurs until sigma unit dissociates and the core enzyme can move along the DNA.
  3199. text3
  3200. "text3"
  3201. buttonUp
  3202. buttonUp
  3203. text3
  3204. Elongation e binds to DNA, melts a section into single strands to form open complex.
  3205. text4
  3206. "text4"
  3207. buttonUp
  3208. buttonUp
  3209. text4
  3210. Termination
  3211. binds to DNA, melts a section into single strands to form open complex.
  3212. text5
  3213. "text5"
  3214. buttonUp
  3215. buttonUp
  3216. text5
  3217. Strand of mRNA formed
  3218. !"ab3"
  3219. buttonUp
  3220. buttonUp
  3221. !"ab2"
  3222. buttonUp
  3223. buttonUp
  3224. !"ab1"
  3225. buttonUp
  3226. buttonUp
  3227. Animate2
  3228. Animate
  3229. ckPage
  3230. Previous
  3231. buttonUp
  3232. buttonUp
  3233. Previous
  3234. xtPage
  3235. buttonUp
  3236. buttonUp
  3237. Press the "Animate" button
  3238. Repressor
  3239. RNA polymerase
  3240. Allolactose binding site
  3241. buttonUp
  3242. buttonUp
  3243. trans
  3244.     3    ( 
  3245. intrans
  3246. "trans"
  3247. buttonUp
  3248. buttonUp
  3249. trans
  3250. rightrans
  3251.     3    v 
  3252. leftrans
  3253. outrans
  3254. buttonUp
  3255. buttonUp
  3256. !"pa"
  3257. buttonUp
  3258. buttonUp
  3259. buttonUp
  3260. buttonUp
  3261. buttonUp
  3262. buttonUp
  3263. buttonUp
  3264. buttonUp
  3265. buttonUp
  3266. buttonUp
  3267. buttonUp
  3268. buttonUp
  3269. buttonUp
  3270. buttonUp
  3271. buttonUp
  3272. buttonUp
  3273. buttonUp
  3274. buttonUp
  3275. buttonUp
  3276. buttonUp
  3277. buttonUp
  3278. buttonUp
  3279. buttonUp
  3280. buttonUp
  3281. buttonUp
  3282. buttonUp
  3283. textgo
  3284. "textgo"
  3285. buttonUp
  3286. buttonUp
  3287. textgo
  3288. pDHDmD
  3289. REPEAT OR GO ON TO NEXT PAGE
  3290. 5 of  30
  3291. bE:E_E
  3292. Events in Transcription:
  3293. ExitProgram
  3294. "Really quit?"\
  3295. f"Yes" 
  3296. SysSuspendMessages 
  3297. buttonUp
  3298. buttonUp
  3299. Really quit?
  3300. FirstPage
  3301. buttonUp
  3302. buttonUp
  3303. 1st Page
  3304. backPage
  3305. Previous
  3306. default
  3307. buttonUp
  3308. buttonUp
  3309. Previous
  3310. default
  3311. NextPage
  3312. default
  3313. buttonUp
  3314. buttonUp
  3315. default
  3316. "quest3" 
  3317. "quest4" 
  3318. leavePage
  3319. leavePage
  3320. quest3
  3321. quest4
  3322. 3.  The repressor binds to:sor:
  3323. Promoter
  3324. Operator
  3325. Lactose
  3326. Allolactose
  3327. CAP siteee
  3328. 4. Lactose binds to :::::::::::::::::::
  3329. quest3
  3330. Repressor
  3331. Operator
  3332. Catabolite Activator Protein
  3333. Permease
  3334. B-galactosidase
  3335. quest4
  3336. NextPage
  3337. 4questscore3
  3338. 4questscore4
  3339. B"k" 
  3340. B"l" 
  3341. B"m" 
  3342. B"n" 
  3343. B"o" 
  3344. B"p" 
  3345. B"q" 
  3346. B"r" 
  3347. B"s" 
  3348. B"t" 
  3349. default
  3350. buttonUp
  3351. buttonUp
  3352. default
  3353. questscore4
  3354. questscore3
  3355. 19 of  30
  3356. "quest19" 
  3357. "quest20" 
  3358. leavePage
  3359. leavePage
  3360. quest19
  3361. quest20
  3362. NextPage
  3363. 4questscore19
  3364. 4questscore20
  3365. buttonUp
  3366. buttonUp
  3367. questscore20
  3368. questscore19
  3369. quest19
  3370. quest20
  3371. 19. Maximum number of molecules of cyclic AMP CAP can bind is  :is  ::
  3372. 20. Which of the following DNA sequences exhibit a two fold axis of symmetry  :
  3373. Promoter
  3374. Operator
  3375. CAP site
  3376. B-galactosidase gene
  3377. Permease geneeeeeeeeeeeeeeee
  3378. Score
  3379. Press the 'Score' button after finshing the questions to obtain your final score.  
  3380. J    "    G    
  3381. 27 of  30
  3382. B"NextPage"
  3383. "quest19" 
  3384. "quest20" 
  3385. enterPage
  3386. leavePage
  3387. enterPage
  3388. NextPage
  3389. leavePage
  3390. quest19
  3391. quest20
  3392. quit?
  3393. FirstPage
  3394. buttonUp
  3395. buttonUp
  3396. 1st Page
  3397. 3~0U3
  3398. Answers to Lac Operon Questions
  3399. The answers to the problems that you got wrong can be seen below. Once you have read the correct answer click the mouse in the white box to move onto the next answer.
  3400. NextPage
  3401. buttonUp
  3402. buttonUp
  3403. answer20
  3404. "answer20"
  3405. buttonUp
  3406. buttonUp
  3407. answer20
  3408.  Question 20:
  3409. The DNA sequences that exhibit  two-fold axes of symmetry are the operator and the CAP site. These symmetrical sites are involved in the binding of the repressor and CAP-cAMP complex to the repressor site and CAP site respectively.to the DNA.
  3410. answer19
  3411. "answer19"
  3412. buttonUp
  3413. buttonUp
  3414. answer19
  3415.  Question 19:
  3416. The maximum number of molecules of cyclic AMP the Catabolite Activator Protein can bind is 2 - one in each subunit of the CAP. inding of the appropriate molecule to the DNA strand.
  3417. answer18
  3418. "answer18"
  3419. buttonUp
  3420. buttonUp
  3421. answer18
  3422.  Question 18:
  3423.  The maximum number of allolactose molecules that the repressor can bind is four. However, only two must bind before the repressor can dissociate from the operator. the DNA strand.
  3424. answer17
  3425. "answer17"
  3426. buttonUp
  3427. buttonUp
  3428. answer17
  3429.  Question 17:
  3430.  The catabolite activator protein is a dimer consisting of two 210 residue subunits. Each subunit is able to bind one molecule of cyclic AMP.iate from the operator. the DNA strand.
  3431. answer16
  3432. "answer16"
  3433. buttonUp
  3434. buttonUp
  3435. answer16
  3436.  Question 16:
  3437.  The function of b-galactosidase is hydrolyse the glycosidic bond of the lactose to produce glucose and galactose. Both these molecules can be used for energy and as a carbon source.
  3438. answer15
  3439. "answer15"
  3440. buttonUp
  3441. buttonUp
  3442. answer15
  3443.  Question 15:
  3444.  The repressor molecule is a tetramer although the repressor binds to the operator using only two of the possible four binding sites.es can be used for energy and as a carbon source.
  3445. answer14
  3446. "answer14"
  3447. buttonUp
  3448. buttonUp
  3449. answer14
  3450. answer14
  3451. "answer14"
  3452. "answer14a"
  3453. buttonUp
  3454. buttonUp
  3455. answer14
  3456. answer14a
  3457.  Question 14:
  3458.  The dissociation constant of the repressor-operator complex is 10  M, meaning that the binding is practically irreversible without the inducer.    for energy and as a carbon source.
  3459. answer14a
  3460. -13 M
  3461. answer13
  3462. "answer13"
  3463. buttonUp
  3464. buttonUp
  3465. answer13
  3466.  Question 13:
  3467.  Allolactose is the inducer because its presence brings about the process of transcription and the production of the proteins. None of the others can directly induce transcription.
  3468. answer12
  3469. "answer12"
  3470. buttonUp
  3471. buttonUp
  3472. answer12
  3473.  Question 12:
  3474.   Lactose has the configuration Galactose b(1
  3475. 4) Glucose ut the process of transcription and the production of the proteins. None of the others can directly induce transcription.
  3476. answer11
  3477. "answer11"
  3478. buttonUp
  3479. buttonUp
  3480. answer11
  3481.  Question 11:
  3482.  The CAP site binds only the catabolite activator protein-cyclic AMP complex. It will not bind the CAP on its own.he proteins. None of the others can directly induce transcription.
  3483. answer10
  3484. "answer10"
  3485. buttonUp
  3486. buttonUp
  3487. answer10
  3488.  Question 10:
  3489.  Low glucose concentration results in a high level of cyclic AMP. Under these conditions the CAP-cAMP complex is formed. The binding of this complex to the CAP site increases transcription by interacting with the RNA polymerase or by forming a bend in the DNA.nteracting with the RNA polymerase or by forming a bend in the DNA.by forming a bend in the DNA.
  3490. answer9
  3491. "answer9"
  3492. buttonUp
  3493. buttonUp
  3494. answer9
  3495.  Question 9:
  3496.  The repressor blocks transcription by stopping the RNA polymerase from moving off the promoter. The repressor also increases the affinity of RNA polymerase for the promoter by 100 fold. The result of this is that when lactose enters the cell the RNA polymerase is ready to start transcription immediately, leading to very quick production of the proteins.   
  3497. answer8
  3498. "answer8"
  3499. buttonUp
  3500. buttonUp
  3501. answer8
  3502.  Question 8:
  3503.  If the cellular glucose concentration falls the cyclic AMP concentration rises. Glucose concentration has no effect on the lactose concentration or the allolactose concentration.   on or the allolactose concentration.   enters the cell the RNA polymerase is ready to start transcription immediately, leading to very quick production of the proteins.   
  3504. answer7
  3505. "answer7"
  3506. buttonUp
  3507. buttonUp
  3508. answer7
  3509.  Question 7:
  3510.  A high glucose concentration leads to a low rate of transcription. In the absence of cyclic AMP the CAP cannot bind to the CAP site so the promoter remains relatively inefficient. Thus only small amounts of permease made leading to low lactose uptake into the cell. is made so only a small amount of lactose enters the cell.  uction of the proteins.   
  3511. answer6
  3512. "answer6"
  3513. buttonUp
  3514. buttonUp
  3515. answer6
  3516.  Question 6:
  3517.  The catabolite activator protein can only bind to cyclic AMP. It is the complex between the two that can bind to the CAP site.   ecient. It also leads to the reduced entry of lactose because only a small amount of permease is made so only a small amount of lactose enters the cell.  ion immediately, leading to very quick production of the proteins.   
  3518. answer5
  3519. "answer5"
  3520. buttonUp
  3521. buttonUp
  3522. answer5
  3523.  Question 5:
  3524.  Allolactose binds to the repressor. This causes a conformational change in the repressor so that the repressor can no longer bind to the operator.  ds to the reduced entry of lactose because only a small amount of permease is made so only a small amount of lactose enters the cell.  ion immediately, leading to very quick production of the proteins.   
  3525. answer4
  3526. "answer4"
  3527. buttonUp
  3528. buttonUp
  3529. answer4
  3530.  Question 4:
  3531.  Lactose binds to permease and b-galactosidase. The permease transports the lactose into the cell and the b-galactosidase hydrolyses the lactose into glucose and galactose.  f lactose because only a small amount of permease is made so only a small amount of lactose enters the cell.  ion immediately, leading to very quick production of the proteins.   
  3532. answer3
  3533. "answer3"
  3534. buttonUp
  3535. buttonUp
  3536. answer3
  3537.  Question 3:
  3538.  The repressor binds to the operator to stop transcription. It also binds allolactose which causes a conformational change and lifts repression.      .   and galactose.  ry of lactose because only a small amount of permease is made so only a small amount of lactose enters the cell.  ion immediately, leading to very quick production of the proteins.   
  3539. answer2
  3540. "answer2"
  3541. buttonUp
  3542. buttonUp
  3543. answer2
  3544.  Question 2:
  3545.  RNA polymerase binds to the promoter in order to initiate transcription. It also binds to the CAP-cAMP complex, increasing the efficiency with which the enzyme can bind to the promoter.       nly a small amount of permease is made so only a small amount of lactose enters the cell.  ion immediately, leading to very quick production of the proteins.   
  3546. answer1
  3547. "answer1"
  3548. buttonUp
  3549. buttonUp
  3550. answer1
  3551.  Question 1:
  3552. The three genes that the Lac Operon controls are b-galactosidase, lactose permease and lactose transacetylase - i.e those that control the entry and metabolism of lactose.
  3553. l0D0i0
  3554. 28 of  30
  3555. 0tton
  3556. B"NextPage"
  3557. buttonUp
  3558. buttonUp
  3559. NextPage
  3560. ExitProgram
  3561. "Really quit?"\
  3562. f"Yes" 
  3563. SysSuspendMessages 
  3564. buttonUp
  3565. buttonUp
  3566. Really quit?
  3567. FirstPage
  3568. buttonUp
  3569. buttonUp
  3570. 1st Page
  3571. default
  3572. buttonUp
  3573. buttonUp
  3574. default
  3575. cap-camp
  3576. "cap-camp"
  3577. buttonUp
  3578. buttonUp
  3579. cap-camp
  3580. "cap"
  3581. buttonUp
  3582. buttonUp
  3583.         Transcription of the Lac Operon
  3584. Process of Transcription:
  3585.     a) The operator is free of repressor.
  3586.     b) RNA polymerase binds to the promoter to form a closed complex.
  3587.         
  3588.       A short sequence of  the DNA enclosed by the enzyme 'melts' into single strands             to form the open complex.
  3589.       Transcription  starts  but  if  the  sigma  subunit does  not   then dissociate  the             transcription process aborts releasing a small piece of RNA. This is known as             abortive initiation and is repeated until the sigma subunit dissociates.
  3590.     c) Elongation - RNA polymerase moves along the DNA strand synthesising RNA         until terminator reached.
  3591.     d) Termination.
  3592. ckPage
  3593. Previous
  3594. buttonUp
  3595. buttonUp
  3596. Previous
  3597. xtPage
  3598. buttonUp
  3599. buttonUp
  3600. 4 of  30
  3601. ExitProgram
  3602. "Really quit?"\
  3603. f"Yes" 
  3604. SysSuspendMessages 
  3605. buttonUp
  3606. buttonUp
  3607. Really quit?
  3608. FirstPage
  3609. buttonUp
  3610. buttonUp
  3611. 1st Page
  3612. backPage
  3613. Previous
  3614. default
  3615. buttonUp
  3616. buttonUp
  3617. Previous
  3618. default
  3619. NextPage
  3620. default
  3621. buttonUp
  3622. buttonUp
  3623. default
  3624. "quest7" 
  3625. "quest8" 
  3626. leavePage
  3627. leavePage
  3628. quest7
  3629. quest8
  3630. 7. High glucose concentration leads to :
  3631. Low rate of transcription
  3632. High concentration of cyclic AMP
  3633. Repressor dissociates from operator
  3634. RNA polymerase cannot bind to promoter
  3635. Reduced entry of lactose into cell
  3636. 8. If cellular glucose concentration falls :
  3637. Lactose concentration rises
  3638. Cyclic AMP concentration falls
  3639. Allolactose concentration changes
  3640. Cyclic AMP concentration rises
  3641. Lactose concentration falls 
  3642. quest7
  3643. quest8
  3644. NextPage
  3645. 4questscore7
  3646. 4questscore8
  3647. B"e1" 
  3648. B"f1" 
  3649. B"g1" 
  3650. B"h1" 
  3651. B"i1" 
  3652. B"j1" 
  3653. B"k1" 
  3654. B"l1" 
  3655. B"m1" 
  3656. B"n1" 
  3657. default
  3658. buttonUp
  3659. buttonUp
  3660. default
  3661. questscore8
  3662. questscore7
  3663. 21 of  30
  3664. "textgo"
  3665. leavePage
  3666. leavePage
  3667. textgo
  3668. RNApol
  3669. rna-s
  3670. Events when  lactose is absent::o
  3671. Animate
  3672. Animate
  3673. text1
  3674. "text1"
  3675. buttonUp
  3676. buttonUp
  3677. text1
  3678. No lactose is present so repressor binds to the operator.
  3679. text2
  3680. "text2"
  3681. buttonUp
  3682. buttonUp
  3683. text2
  3684. The repressor increases the affinity of the RNA polymerase for the promoter. The RNA polymerase binds more readily to the promoter. However, no transcription can take place as the repressor blocks the RNA polymerase.      
  3685. textgo
  3686. "textgo"
  3687. buttonUp
  3688. buttonUp
  3689. textgo
  3690. REPEAT OR MOVE ON TO THE NEXT PAGE
  3691. Repressor
  3692. RNA polymerase
  3693. Allolactose binding site
  3694. 7 of  30
  3695. Press the "Animate" button
  3696. ExitProgram
  3697. "Really quit?"\
  3698. f"Yes" 
  3699. SysSuspendMessages 
  3700. buttonUp
  3701. buttonUp
  3702. Really quit?
  3703. FirstPage
  3704. buttonUp
  3705. buttonUp
  3706. 1st Page
  3707. backPage
  3708. Previous
  3709. default
  3710. buttonUp
  3711. buttonUp
  3712. Previous
  3713. default
  3714. NextPage
  3715. default
  3716. buttonUp
  3717. buttonUp
  3718. default
  3719. camp2
  3720. cap-camp
  3721.               INTRODUCTION
  3722. The lac operon is found in the bacterium E.coli. The proteins coded for by this gene cluster are required for the uptake and utilisation of lactose. The genes are only switched on when the proteins are required, i.e. only when lactose is present.  This follows the rule of survival in bacteria that proteins are made when they are needed.
  3723. Lactose is a disaccharide with the structure [ b-galactose (1
  3724. 4) b-glucose ]. Lactose may be utilised both as an energy source and as a carbon source. In order to be utilised it must be taken up by the cell, hydrolysed to glucose and galactose and then enter the glycolysis sequence.
  3725. operon
  3726. --Script that opens a simple dialog box
  3727. " An operon 
  3728. a gene cluster where several genes are under the control 
  3729. a single promoter."
  3730. buttonDown
  3731. buttonDown
  3732.  An operon is a gene cluster where several genes are under the control of a single promoter.
  3733. backPage
  3734. Previous
  3735. buttonUp
  3736. buttonUp
  3737. Previous
  3738. NextPage
  3739. buttonUp
  3740. buttonUp
  3741. 1 of  30
  3742. ExitProgram
  3743. "Really quit?"\
  3744. f"Yes" 
  3745. SysSuspendMessages 
  3746. buttonUp
  3747. buttonUp
  3748. Really quit?
  3749. FirstPage
  3750. buttonUp
  3751. buttonUp
  3752. 1st Page
  3753. Previous
  3754. default
  3755. buttonUp
  3756. buttonUp
  3757. Previous
  3758. default
  3759. default
  3760. buttonUp
  3761. buttonUp
  3762. default
  3763. "textgo"
  3764. leavePage
  3765. leavePage
  3766. textgo
  3767. "F$P(
  3768. G\H*J
  3769. P0SpSXU
  3770. WzX^Y^
  3771. RNApol
  3772. rna-s
  3773. o    B    "
  3774. !"ab3"
  3775. buttonUp
  3776. buttonUp
  3777. !"ab2"
  3778. buttonUp
  3779. buttonUp
  3780. !"ab1"
  3781. buttonUp
  3782. buttonUp
  3783. Press the "Animate" button
  3784. buttonUp
  3785. buttonUp
  3786. !"pa"
  3787. buttonUp
  3788. buttonUp
  3789. buttonUp
  3790. buttonUp
  3791. buttonUp
  3792. buttonUp
  3793. buttonUp
  3794. buttonUp
  3795. buttonUp
  3796. buttonUp
  3797. buttonUp
  3798. buttonUp
  3799. buttonUp
  3800. buttonUp
  3801. buttonUp
  3802. buttonUp
  3803. buttonUp
  3804. buttonUp
  3805. buttonUp
  3806. buttonUp
  3807. buttonUp
  3808. buttonUp
  3809. buttonUp
  3810. buttonUp
  3811. buttonUp
  3812. buttonUp
  3813. buttonUp
  3814. buttonUp
  3815. text1
  3816. "text1"
  3817. buttonUp
  3818. buttonUp
  3819. text1
  3820. Cyclic AMP binds to the CAP to form the CAP-cAMP complex. This then binds to the CAP siteeeeore readily.
  3821. text1a
  3822. "text1a"
  3823. buttonUp
  3824. buttonUp
  3825. text1a
  3826. The RNA polymerase binds to the DNA and moves along the DNA until it reaches the promoter
  3827. text1b
  3828. "text1b"
  3829. buttonUp
  3830. buttonUp
  3831. text1b
  3832. When the RNA polymerase reaches the promoter the CAP-cAMP complex interacts with the RNA polymerase increasing the probability that the RNA polymerase will bind to the promoter. The repressor also increases this probability.
  3833. text2
  3834. "text2"
  3835. buttonUp
  3836. buttonUp
  3837. text2
  3838. Allolactose binds to the repressor causing a conformational change which results in the repressor leaving the operator.
  3839. text3
  3840. "text3"
  3841. buttonUp
  3842. buttonUp
  3843. text3
  3844. RNA polymerase free to carry out transcription.ormational change which results in the repressor leaving the operator.
  3845. text4
  3846. "text4"
  3847. buttonUp
  3848. buttonUp
  3849. text4
  3850. RNA polymerase binds then melts a section of DNA into single strands to form  the open complex.
  3851. text5
  3852. "text5"
  3853. buttonUp
  3854. buttonUp
  3855. text5
  3856. Abortive initiation occurs until the sigma unit dissociates and the core enzyme can move along the DNA.
  3857. text6
  3858. "text6"
  3859. buttonUp
  3860. buttonUp
  3861. text6
  3862. Elongation   binds to DNA, melts a section into single strands to form open complex.
  3863. text7
  3864. "text7"
  3865. buttonUp
  3866. buttonUp
  3867. text7
  3868. Termination
  3869. binds to DNA, melts a section into single strands to form open complex.
  3870. text8
  3871. "text8"
  3872. buttonUp
  3873. buttonUp
  3874. text8
  3875. Strand of mRNA formed
  3876. text9
  3877. "text9"
  3878. buttonUp
  3879. buttonUp
  3880. text9
  3881. Once the lactose concentration decreases, the repressor can once more bind to the operator. The CAP-cAMP complex will remain on the CAP site until the glucose concentration increases...
  3882. textgo
  3883. "textgo"
  3884. buttonUp
  3885. buttonUp
  3886. textgo
  3887. REPEAT OR MOVE ON TO THE NEXT PAGEEE
  3888. Allolactose
  3889. Cyclic AMP
  3890. ^B6B[B
  3891. Allolactose binding site
  3892. 14 of  30
  3893. ExitProgram
  3894. "Really quit?"\
  3895. f"Yes" 
  3896. SysSuspendMessages 
  3897. buttonUp
  3898. buttonUp
  3899. Really quit?
  3900. FirstPage
  3901. buttonUp
  3902. buttonUp
  3903. 1st Page
  3904. Button
  3905. d) Events when Lactose present & Glucose                  concentration loww
  3906. GXG}G
  3907. & Glucose concentration low
  3908. camp1
  3909. "camp1"
  3910. buttonUp
  3911. buttonUp
  3912. camp1
  3913. "cap"
  3914. buttonUp
  3915. buttonUp
  3916. camp2
  3917. "camp2"
  3918. buttonUp
  3919. buttonUp
  3920. camp2
  3921. cap-camp
  3922. trans
  3923.     3    VR
  3924. intrans
  3925. "trans"
  3926. buttonUp
  3927. buttonUp
  3928. trans
  3929.     3    *R
  3930. rightrans
  3931. leftrans
  3932. outrans
  3933. Animate2
  3934. Animate
  3935. rep1b
  3936. "al4"
  3937. buttonUp
  3938. buttonUp
  3939. "al1"
  3940. buttonUp
  3941. buttonUp
  3942. backPage
  3943. Previous
  3944. default
  3945. buttonUp
  3946. buttonUp
  3947. Previous
  3948. default
  3949. NextPage
  3950. default
  3951. buttonUp
  3952. buttonUp
  3953. default
  3954. horizPos:to
  3955. horizPos
  3956. stsCursor
  3957. ZhorizPos
  3958. "textgo"
  3959. "text0.5"
  3960. --Repressor protein (rep) moves 
  3961. )4953, -429
  3962. nthe 
  3963. 4923, -279
  3964. 4863, -69
  3965. 4803, 21
  3966. 4698, 141
  3967. 4548, 261
  3968. 4383, 351
  3969. 4203, 471
  3970. 4023, 576
  3971. 3858, 711
  3972. 3678, 831
  3973. 3438, 951
  3974. 3258, 1056
  3975. 3003, 1131
  3976. "text1"
  3977. --CAP 
  3978. screen
  3979. "cap" 
  3980. )-585, 2715
  3981. -540, 2685
  3982. -465, 2640
  3983. -375, 2565
  3984. -255, 2505
  3985. -150, 2445
  3986. -45, 2370
  3987. 90, 2265
  3988. 150, 2220
  3989. 225, 2160
  3990. 255, 2145
  3991. --2 molecules 
  3992. cAMP (camp1, camp2) 
  3993. binding sites 
  3994. , are hidden 
  3995. be replaced 
  3996. Ycomplex 
  3997. g) which 
  3998. )-75, 3159
  3999. 15, 3084
  4000. 135, 2949
  4001. 195, 2904
  4002. 225, 2874
  4003. 285, 2829
  4004. 345, 2769
  4005. 390, 2709
  4006. 420, 2664
  4007. 420, 2589
  4008. )-75, 3459
  4009. -15, 3429
  4010. 45, 3369
  4011. 105, 3309
  4012. 180, 3249
  4013. 240, 3144
  4014. 285, 3099
  4015. 345, 3009
  4016. 405, 2979
  4017. 450, 2919
  4018. 510, 2889
  4019. 555, 2844
  4020. 600, 2814
  4021. 630, 2754
  4022. 645, 2709
  4023. 645, 2679
  4024. 660, 2649
  4025. 660, 2589
  4026. )249, 2157
  4027. 354, 2127
  4028. 519, 2112
  4029. 654, 2097
  4030. 789, 2067
  4031. 909, 2052
  4032. 999, 2037
  4033. 1089, 2007
  4034. 1179, 1977
  4035. 1254, 1962
  4036. 1344, 1947
  4037. 1389, 1902
  4038. 1434, 1902
  4039. 1464, 1857
  4040. 1509, 1797
  4041. --RNA polymerase 
  4042. forth along 
  4043. steps 
  4044. 375, keeping
  4045. --verticle 
  4046. constant.
  4047. "RNApol" 
  4048. )8430, 165
  4049. 8295, 255
  4050. 8130, 345
  4051. 7890, 495
  4052. 7785, 540
  4053. 7665, 585
  4054. 7500, 645
  4055. 7380, 690
  4056. 7170, 795
  4057. 7005, 915
  4058. 6840, 1035
  4059. 6630, 1230
  4060. 6510, 1320
  4061. 6450, 1350
  4062. 6360, 1440
  4063. 6360 
  4064. 3735 
  4065. H-375
  4066. , 1440
  4067. 3735 
  4068. 6735 
  4069. , 1440
  4070. enters 
  4071. DNA, jumps over CAP!
  4072. suggestions 
  4073. problem would be appreciated)
  4074. promoter 
  4075. 6735, 1365
  4076. 6855, 1320
  4077. 7035, 1305
  4078. 7095, 1245
  4079. 7245, 1155
  4080. 7365, 1125
  4081. 7470, 1095
  4082. 7545, 975
  4083. 7740, 855
  4084. 7845, 840
  4085. 7995, 810
  4086. 8055, 795
  4087. 8160, 780
  4088. 8370, 765
  4089. "text2"
  4090. )-1095, 1410
  4091. -975, 1410
  4092. -765, 1410
  4093. -555, 1410
  4094. -375, 1410
  4095. -240, 1410
  4096. -120, 1410
  4097. -15, 1410
  4098. 105, 1410
  4099. 240, 1410
  4100. 315, 1305
  4101. 465, 1155
  4102. 570, 1095
  4103. 615, 1005
  4104. 660, 885
  4105. 885, 780
  4106. 990, 720
  4107. 1110, 720
  4108. 1260, 765
  4109. 1365, 780
  4110. 1545, 870
  4111. 1695, 900
  4112. 1860, 975
  4113. 2175, 1095
  4114. 2265, 1305
  4115. 2265, 1455
  4116. "text3"
  4117. --CAP-
  4118. fields 
  4119. "rep"
  4120. default
  4121. buttonUp
  4122. buttonUp
  4123. textgo
  4124. text0.5
  4125. text1
  4126. camp1
  4127. camp1
  4128. camp2
  4129. camp2
  4130. camp1
  4131. camp2
  4132. cap-camp
  4133. cap-camp
  4134. text1.5
  4135. RNApol
  4136. RNApol
  4137. RNApol
  4138. RNApol
  4139. RNApol
  4140. RNApol
  4141. text2
  4142. RNApol
  4143. RNApol
  4144. text3
  4145. cap-camp
  4146. RNApol
  4147. text0.5
  4148. text1
  4149. text1.5
  4150. text2
  4151. text3
  4152. textgo
  4153. default
  4154. horizPos:by
  4155. horizPos:to
  4156. horizPos
  4157. NextPage
  4158. default
  4159. buttonUp
  4160. buttonUp
  4161. default
  4162. ds to the DNA and moves along the DNA un{Z
  4163. The RNA polymerase binds to the DNA and moves along the DNA until it reaches the promoter
  4164. )h-z/
  4165. B0CtC
  4166. GzHHJ
  4167. "textgo"
  4168. leavePage
  4169. leavePage
  4170. textgo
  4171. ?>?j?
  4172. ?V@~@
  4173. E$FjJ
  4174. RNApol
  4175. rna-s
  4176. !"ab3"
  4177. buttonUp
  4178. buttonUp
  4179. !"ab2"
  4180. buttonUp
  4181. buttonUp
  4182. !"ab1"
  4183. buttonUp
  4184. buttonUp
  4185. Animate2
  4186. Animate
  4187. ?>?j?
  4188. ?V@~@
  4189. E$FjJ
  4190. buttonUp
  4191. buttonUp
  4192. Previous
  4193. buttonUp
  4194. buttonUp
  4195. Press the "Animate" button
  4196. buttonUp
  4197. buttonUp
  4198. !"pa"
  4199. buttonUp
  4200. buttonUp
  4201. buttonUp
  4202. buttonUp
  4203. buttonUp
  4204. buttonUp
  4205. buttonUp
  4206. buttonUp
  4207. buttonUp
  4208. buttonUp
  4209. buttonUp
  4210. buttonUp
  4211. buttonUp
  4212. buttonUp
  4213. buttonUp
  4214. buttonUp
  4215. buttonUp
  4216. buttonUp
  4217. buttonUp
  4218. buttonUp
  4219. buttonUp
  4220. buttonUp
  4221. buttonUp
  4222. buttonUp
  4223. buttonUp
  4224. buttonUp
  4225. buttonUp
  4226. buttonUp
  4227. text1
  4228. "text1"
  4229. buttonUp
  4230. buttonUp
  4231. text1
  4232. Repressor increases affinity of RNA polymerase for promoter so the enzyme binds to the DNA more readily.
  4233. text2
  4234. "text2"
  4235. buttonUp
  4236. buttonUp
  4237. text2
  4238. Allolactose binds to the repressor causing a conformational change which results in the repressor leaving the operator.
  4239. text3
  4240. "text3"
  4241. buttonUp
  4242. buttonUp
  4243. text3
  4244. RNA polymerase free to carry out transcription.nformational change which results in the repressor leaving the operator.
  4245. text4
  4246. "text4"
  4247. buttonUp
  4248. buttonUp
  4249. text4
  4250. RNA polymerase binds, then melts a section of DNA into single strands to form  the open complex.
  4251. text5
  4252. "text5"
  4253. buttonUp
  4254. buttonUp
  4255. text5
  4256. Abortive initiation occurs until the sigma unit dissociates and the core enzyme can move along the DNA.
  4257. text6
  4258. "text6"
  4259. buttonUp
  4260. buttonUp
  4261. text6
  4262. Elongation e binds to DNA, melts a section into single strands to form open complex.
  4263. text7
  4264. "text7"
  4265. buttonUp
  4266. buttonUp
  4267. text7
  4268. Termination
  4269. binds to DNA, melts a section into single strands to form open complex.
  4270. text8
  4271. "text8"
  4272. buttonUp
  4273. buttonUp
  4274. text8
  4275. Strand of mRNA formed
  4276. text9
  4277. "text9"
  4278. buttonUp
  4279. buttonUp
  4280. text9
  4281. When the lactose concentration decreases the allolactose dissociates from the repressor so the repressor can once more bind to the operator....
  4282. Allolactose
  4283. Repressor
  4284. RNA polymerase
  4285. Allolactose binding site
  4286. "al1"
  4287. buttonUp
  4288. buttonUp
  4289. "al2"
  4290. buttonUp
  4291. buttonUp
  4292. "al3"
  4293. buttonUp
  4294. buttonUp
  4295. "al4"
  4296. buttonUp
  4297. buttonUp
  4298. textgo
  4299. "textgo"
  4300. buttonUp
  4301. buttonUp
  4302. textgo
  4303. REPEAT OR MOVE ON TO THE NEXT PAGE
  4304. Events when lactose is present:
  4305. trans
  4306. intrans
  4307. "trans"
  4308. buttonUp
  4309. buttonUp
  4310. trans
  4311.     3    >L
  4312.     3    jL
  4313. rightrans
  4314. leftrans
  4315. outrans
  4316. 9 of  30
  4317. ExitProgram
  4318. "Really quit?"\
  4319. f"Yes" 
  4320. SysSuspendMessages 
  4321. buttonUp
  4322. buttonUp
  4323. Really quit?
  4324. FirstPage
  4325. buttonUp
  4326. buttonUp
  4327. 1st Page
  4328. Pimate2
  4329. .Pimate
  4330. backPage
  4331. NextPage
  4332. ?>?j?
  4333. ?V@~@
  4334. E$FjJ
  4335. MFOLPLP=Q
  4336. rep1b
  4337. Previous
  4338. default
  4339. buttonUp
  4340. buttonUp
  4341. Previous
  4342. default
  4343. default
  4344. buttonUp
  4345. buttonUp
  4346. default
  4347. barchart
  4348. -- y1 
  4349. the height 
  4350. bar (glucose), y2 
  4351. cAMP)
  4352. -- speed 
  4353. how much 
  4354. Gbars increase 
  4355. decrease 
  4356. -- On entering 
  4357. 8are returned 
  4358. their 
  4359. positions
  4360. 4y1, y2
  4361. "barchart" 
  4362. 2670, 3210, 3360, 4080
  4363. 3735, 3210, 4425, 4080
  4364. enterPage
  4365. enterPage
  4366. barchart
  4367. barchart
  4368. speed
  4369. #P$4%
  4370. Glucose
  4371. Cyclic AMP
  4372.     ^    `    p
  4373. Cyclic AMP (cAMP) is a secondary messenger molecule in many cells. The level of cyclic AMP is controlled by the amount of glucose present in a cell. When the glucose concentration is high, the cyclic AMP concentration is low. As the glucose concentration decreases the cyclic AMP concentration increases. Cyclic AMP is therefore known as the 'starvation signal'.
  4374.     % 1_
  4375. "Adenosine-3',5'-cyclic monophosphate (cAMP) 
  4376. formed 
  4377. Hthe action 
  4378. adenylate cyclase. The 5' 
  4379. )3' hydroxy 
  4380. 9ribose are linked together 
  4381. d a ring."
  4382. buttonUp
  4383. buttonUp
  4384. Adenosine-3',5'-cyclic monophosphate (cAMP) is formed from AMP by the action of adenylate cyclase. The 5' phosphate group and the 3' hydroxy group of the ribose are linked together to form a ring.
  4385. Glucose 
  4386. Concentration 
  4387. (mM)%)
  4388. --See 
  4389. --y1 
  4390. )their maximum height 
  4391. 2 = 2280
  4392. --If 
  4393. 2 has a value > 2280 
  4394. C bar 
  4395. bellow 
  4396. Ncan be increased.)
  4397. --When 
  4398. Bpressed 
  4399. ?(y2/cAMP) decreased 
  4400. H180 
  4401. --minimum 
  4402. (4080) 
  4403. which 
  4404. will 
  4405. no further, 
  4406. (y1/glucose) increases 
  4407. reached 
  4408. -- remains 2280
  4409. 4y1, y2, speed
  4410. y1 > 2280
  4411. y1 < 2280
  4412. y2 < 4080
  4413. y2> 4080
  4414. buttonUp
  4415. buttonUp
  4416. speed
  4417. "Really quit?"\
  4418. f"Yes" 
  4419. SysSuspendMessages 
  4420. buttonUp
  4421. buttonUp
  4422. Really quit?
  4423. Increase
  4424. [Glucose]   
  4425. -- See 
  4426. increase glucose 
  4427. --When 
  4428. Bpressed height 
  4429. bar (y1/
  4430. ,) decreased 
  4431. H180 
  4432. --minimum value (4080) 
  4433. which 
  4434. will 
  4435. no further, 
  4436. [2/cAMP) increases 
  4437. Zmaximum 
  4438. reached 
  4439. remains
  4440. --2280
  4441. 4y1, y2, speed
  4442. y1 < 4080
  4443. y1 > 4080
  4444. y2 > 2280
  4445. y2 < 2280
  4446. buttonUp
  4447. buttonUp
  4448. speed
  4449. "Really quit?"\
  4450. f"Yes" 
  4451. SysSuspendMessages 
  4452. buttonUp
  4453. buttonUp
  4454. Really quit?
  4455. Decrease
  4456. [Glucose]   
  4457. height
  4458. Cyclic AMP 
  4459. Concentration 
  4460. (x 10   M)
  4461. 11 of  30
  4462. ExitProgram
  4463. "Really quit?"\
  4464. f"Yes" 
  4465. SysSuspendMessages 
  4466. buttonUp
  4467. buttonUp
  4468. Really quit?
  4469. FirstPage
  4470. buttonUp
  4471. buttonUp
  4472. 1st Page
  4473. backPage
  4474. Previous
  4475. default
  4476. buttonUp
  4477. buttonUp
  4478. Previous
  4479. default
  4480. NextPage
  4481. default
  4482. buttonUp
  4483. buttonUp
  4484. default
  4485.     0    4    
  4486. B"NextPage"
  4487. 4questscore20
  4488. 4questscore19
  4489. 4questscore18
  4490. 4questscore17
  4491. 4questscore16
  4492. 4questscore15
  4493. 4questscore14
  4494. 4questscore13
  4495. 4questscore12
  4496. 4questscore11
  4497. 4questscore10
  4498. 4questscore9
  4499. 4questscore8
  4500. 4questscore7
  4501. 4questscore6
  4502. 4questscore5
  4503. 4questscore4
  4504. 4questscore3
  4505. 4count
  4506. -- If the 
  4507. a question 
  4508. < 5, i.e 
  4509. got something wrong, 
  4510. -- answer 
  4511. that 
  4512. shown.
  4513. "answer1"     
  4514. "answer2"     
  4515. "answer3"     
  4516. "answer4"     
  4517. "answer5"     
  4518. "answer6"     
  4519. "answer7"     
  4520. "answer8"     
  4521. "answer9"     
  4522. "answer10"     
  4523. "answer11"     
  4524. "answer12"     
  4525. "answer13"     
  4526. "answer14"     
  4527. "answer15"     
  4528. "answer16"     
  4529. "answer17"     
  4530. "answer18"     
  4531. "answer19"     
  4532. "answer20"     
  4533. "answer14a"
  4534. enterPage
  4535. leavePage
  4536. enterPage
  4537. NextPage
  4538. answer1
  4539. answer1
  4540. answer2
  4541. answer2
  4542. answer3
  4543. answer3
  4544. answer4
  4545. answer4
  4546. answer5
  4547. answer5
  4548. answer6
  4549. answer6
  4550. answer7
  4551. answer7
  4552. answer8
  4553. answer8
  4554. answer9
  4555. answer9
  4556. answer10
  4557. answer10
  4558. answer11
  4559. answer11
  4560. answer12
  4561. answer12
  4562. answer13
  4563. answer13
  4564. answer14
  4565. answer14
  4566. answer15
  4567. answer15
  4568. answer16
  4569. answer16
  4570. answer17
  4571. answer17
  4572. answer18
  4573. answer18
  4574. answer19
  4575. answer19
  4576. answer20
  4577. answer20
  4578. NextPage
  4579. count
  4580. questscore1
  4581. questscore2
  4582. questscore3
  4583. questscore4
  4584. questscore5
  4585. questscore6
  4586. questscore7
  4587. questscore8
  4588. questscore9
  4589. questscore10
  4590. questscore11
  4591. questscore12
  4592. questscore13
  4593. questscore14
  4594. questscore15
  4595. questscore16
  4596. questscore17
  4597. questscore18
  4598. questscore19
  4599. questscore20
  4600. leavePage
  4601. answer1
  4602. answer2
  4603. answer3
  4604. answer4
  4605. answer5
  4606. answer6
  4607. answer7
  4608. answer8
  4609. answer9
  4610. answer10
  4611. answer11
  4612. answer12
  4613. answer13
  4614. answer14
  4615. answer14a
  4616. answer15
  4617. answer16
  4618. answer17
  4619. answer18
  4620. answer19
  4621. answer20
  4622. count
  4623. questscore1
  4624. questscore2
  4625. questscore3
  4626. questscore4
  4627. questscore5
  4628. questscore6
  4629. questscore7
  4630. questscore8
  4631. questscore9
  4632. questscore10
  4633. questscore11
  4634. questscore12
  4635. questscore13
  4636. questscore14
  4637. questscore15
  4638. questscore16
  4639. questscore17
  4640. questscore18
  4641. questscore19
  4642. questscore20
  4643. "textgo"
  4644. leavePage
  4645. leavePage
  4646. textgo
  4647. "F$P(
  4648. G\H*J
  4649. P0SpSXU
  4650. WzX^Y
  4651. RNApol
  4652. rna-s
  4653. o    B    "
  4654. !"ab3"
  4655. buttonUp
  4656. buttonUp
  4657. !"ab2"
  4658. buttonUp
  4659. buttonUp
  4660. !"ab1"
  4661. buttonUp
  4662. buttonUp
  4663. Press the "Animate" button
  4664. buttonUp
  4665. buttonUp
  4666. !"pa"
  4667. buttonUp
  4668. buttonUp
  4669. buttonUp
  4670. buttonUp
  4671. buttonUp
  4672. buttonUp
  4673. buttonUp
  4674. buttonUp
  4675. buttonUp
  4676. buttonUp
  4677. buttonUp
  4678. buttonUp
  4679. buttonUp
  4680. buttonUp
  4681. buttonUp
  4682. buttonUp
  4683. buttonUp
  4684. buttonUp
  4685. buttonUp
  4686. buttonUp
  4687. buttonUp
  4688. buttonUp
  4689. buttonUp
  4690. buttonUp
  4691. buttonUp
  4692. buttonUp
  4693. buttonUp
  4694. buttonUp
  4695. text1
  4696. "text1"
  4697. buttonUp
  4698. buttonUp
  4699. text1
  4700. Cyclic AMP binds to the CAP to form the CAP-cAMP complex. This then binds to the CAP siteeeeore readily.
  4701. text1a
  4702. "text1a"
  4703. buttonUp
  4704. buttonUp
  4705. text1a
  4706. The RNA polymerase binds to the DNA and moves along the DNA until it reaches the promoter
  4707. text1b
  4708. "text1b"
  4709. buttonUp
  4710. buttonUp
  4711. text1b
  4712. When the RNA polymerase reaches the promoter the CAP-cAMP complex interacts with the RNA polymerase increasing the probability that the RNA polymerase will bind to the promoter. The repressor also increases this probability.
  4713. text2
  4714. "text2"
  4715. buttonUp
  4716. buttonUp
  4717. text2
  4718. Allolactose binds to the repressor causing a conformational change which results in the repressor leaving the operator.
  4719. text3
  4720. "text3"
  4721. buttonUp
  4722. buttonUp
  4723. text3
  4724. RNA polymerase free to carry out transcription.ormational change which results in the repressor leaving the operator.
  4725. text4
  4726. "text4"
  4727. buttonUp
  4728. buttonUp
  4729. text4
  4730. RNA polymerase binds then melts a section of DNA into single strands to form  the open complex.
  4731. text5
  4732. "text5"
  4733. buttonUp
  4734. buttonUp
  4735. text5
  4736. Abortive initiation occurs until the sigma unit dissociates and the core enzyme can move along the DNA.
  4737. text6
  4738. "text6"
  4739. buttonUp
  4740. buttonUp
  4741. text6
  4742. Elongation   binds to DNA, melts a section into single strands to form open complex.
  4743. text7
  4744. "text7"
  4745. buttonUp
  4746. buttonUp
  4747. text7
  4748. Termination
  4749. binds to DNA, melts a section into single strands to form open complex.
  4750. text8
  4751. "text8"
  4752. buttonUp
  4753. buttonUp
  4754. text8
  4755. Strand of mRNA formed
  4756. text9
  4757. "text9"
  4758. buttonUp
  4759. buttonUp
  4760. text9
  4761. Once the lactose concentration decreases, the repressor can once more bind to the operator. The CAP-cAMP complex will remain on the CAP site until the glucose concentration increases...
  4762. textgo
  4763. "textgo"
  4764. buttonUp
  4765. buttonUp
  4766. textgo
  4767. REPEAT OR MOVE ON TO THE NEXT PAGEEE
  4768. Allolactose
  4769. Cyclic AMP
  4770. ^B6B[B
  4771. Allolactose binding site
  4772. 14 of  30
  4773. ExitProgram
  4774. "Really quit?"\
  4775. f"Yes" 
  4776. SysSuspendMessages 
  4777. buttonUp
  4778. buttonUp
  4779. Really quit?
  4780. FirstPage
  4781. buttonUp
  4782. buttonUp
  4783. 1st Page
  4784. Button
  4785. d) Events when Lactose present & Glucose                  concentration loww
  4786. GXG}G
  4787. & Glucose concentration low
  4788. camp1
  4789. "camp1"
  4790. buttonUp
  4791. buttonUp
  4792. camp1
  4793. "cap"
  4794. buttonUp
  4795. buttonUp
  4796. camp2
  4797. "camp2"
  4798. buttonUp
  4799. buttonUp
  4800. camp2
  4801. cap-camp
  4802. trans
  4803.     3    VR
  4804. intrans
  4805. "trans"
  4806. buttonUp
  4807. buttonUp
  4808. trans
  4809.     3    *R
  4810. rightrans
  4811. leftrans
  4812. outrans
  4813. Animate2
  4814. Animate
  4815. rep1b
  4816. "al4"
  4817. buttonUp
  4818. buttonUp
  4819. "al1"
  4820. buttonUp
  4821. buttonUp
  4822. backPage
  4823. Previous
  4824. default
  4825. buttonUp
  4826. buttonUp
  4827. Previous
  4828. default
  4829. NextPage
  4830. default
  4831. buttonUp
  4832. buttonUp
  4833. default
  4834. DZtton
  4835. "RNApol"
  4836. buttonUp
  4837. buttonUp
  4838. RNApol
  4839. "F$P(
  4840. G\H*J
  4841. P0SpSXU
  4842. WzX^Y
  4843. GZH(J
  4844. P.SnSVU
  4845. UxX\Y^
  4846. "al1"
  4847. buttonUp
  4848. buttonUp
  4849. "al4"
  4850. buttonUp
  4851. buttonUp
  4852. backPage
  4853. Previous
  4854. default
  4855. buttonUp
  4856. buttonUp
  4857. Previous
  4858. default
  4859. NextPage
  4860. default
  4861. buttonUp
  4862. buttonUp
  4863. default
  4864. "D$N(
  4865. GZH(J
  4866. P.SnSVU
  4867. WxX\Y^
  4868. Ztton
  4869. "RNApol"
  4870. buttonUp
  4871. buttonUp
  4872. RNApol
  4873. X"k"o"
  4874. "textgo"
  4875. "cap-camp"
  4876. "text1"
  4877. --CAP moves 
  4878. screen
  4879. --2 molecules 
  4880. cyclic AMP (camp1,camp2) appear 
  4881. binding sites
  4882. 1 are hidden 
  4883. be replaced 
  4884. -cAMP complex (
  4885. ), which 
  4886. )-630, 2880
  4887. -495, 2790
  4888. -285, 2640
  4889. -105, 2520
  4890. 90, 2370
  4891. 270, 2280
  4892. 405, 2190
  4893. )-90, 3525
  4894. 15, 3465
  4895. 120, 3360
  4896. 195, 3270
  4897. 255, 3150
  4898. 345, 3000
  4899. 405, 2895
  4900. 480, 2805
  4901. 570, 2625
  4902. )-75, 3390
  4903. 60, 3315
  4904. 180, 3210
  4905. 330, 3090
  4906. 465, 2955
  4907. 630, 2835
  4908. 765, 2760
  4909. 810, 2625
  4910. "cap"
  4911. )400, 2180
  4912. 505, 2165
  4913. 625, 2135
  4914. 805, 2090
  4915. 940, 2075
  4916. 1075, 2045
  4917. 1240, 2000
  4918. 1375, 1955
  4919. 1495, 1895
  4920. 1525, 1805
  4921. "text1a"
  4922. --RNA polymerase enters 
  4923. "RNApol" 
  4924. )8430, 165
  4925. 8295, 255
  4926. 8130, 345
  4927. 7890, 495
  4928. 7785, 540
  4929. 7665, 585
  4930. 7500, 645
  4931. 7380, 690
  4932. 7170, 795
  4933. 7005, 915
  4934. 6840, 1035
  4935. 6630, 1230
  4936. 6510, 1320
  4937. 6450, 1350
  4938. 6360, 1440
  4939. down 
  4940. Hsteps 
  4941. horizPos 
  4942. 6360 
  4943. 3735 
  4944. H-375
  4945. ", 1440
  4946. 3735 
  4947. 6735 
  4948. L, 1440
  4949. leaves 
  4950. exits 
  4951. 6885, 1320
  4952. 7095, 1200
  4953. 7320, 1110
  4954. 7470, 1050
  4955. 7680, 945
  4956. 7890, 825
  4957. 8085, 720
  4958. 8325, 585
  4959. "text1b"
  4960. promoter
  4961. )-975, 510
  4962. -855, 525
  4963. -660, 630
  4964. -450, 645
  4965. -180, 705
  4966. 60, 705
  4967. 345, 765
  4968. 705, 810
  4969. 1140, 930
  4970. 1470, 1020
  4971. 2220, 1455
  4972. "text2"
  4973. --Allolactose 
  4974. repressor
  4975. )4326, 510
  4976. 3966, -90
  4977. 3861, 60
  4978. 3771, 195
  4979. 3651, 315
  4980. 3531, 495
  4981. 3411, 705
  4982. 3276, 885
  4983. 3186, 1005
  4984. 3156, 1275
  4985. )4941, -90
  4986. 4941, -90
  4987. "al4" 
  4988. 4911, 45
  4989. 4836, 255
  4990. 4746, 435
  4991. 4626, 600
  4992. 4476, 780
  4993. 4311, 945
  4994. 4131, 1095
  4995. 3936, 1275
  4996. 3516, 1485
  4997.  + 2 allolactose 
  4998. Hrep2.
  4999. --Rep2 
  5000. square 
  5001.  consisting 
  5002. rep1b 
  5003. "al1"
  5004. )2985, 1050
  5005.     off DNA
  5006. --2 remaining 
  5007.     (al6,al7) 
  5008. 3045, 1050
  5009. 3135, 990
  5010. 3225, 960
  5011. )4611, -84
  5012. 4551, 126
  5013. 4431, 276
  5014. 4311, 441
  5015. 4086, 711
  5016. 3741, 1071
  5017. )5286, -69
  5018. 5031, 141
  5019. 4716, 441
  5020. 4371, 606
  5021. 4116, 801
  5022. 3396, 1296
  5023. grouped 
  5024. fal6 
  5025. form rep3
  5026. Group
  5027. --Rep3 
  5028. 3330, 840
  5029. 3420, 780
  5030. 3525, 705
  5031. 3645, 615
  5032. 3690, 570
  5033. 3795, 465
  5034. 3900, 300
  5035. 3960, 240
  5036. 3975, 180
  5037. "text3"
  5038. "text4"
  5039. --Open 
  5040. appears (
  5041. Hmajic)
  5042. trans 
  5043. )2655, 1615
  5044. "leftrans" 
  5045. 240, 75.125, 100
  5046. 240, 75.125, 100
  5047. "rightrans" 
  5048. 0, 75.3125, 0
  5049. 0, 75.6875, 0
  5050. "text5"
  5051. --Abortive initiation strands (ab1-ab3) shown
  5052. )2630, 2060
  5053. 2415, 2195
  5054. 2220, 2330
  5055. 2025, 2450
  5056. 1965, 2525
  5057. !"ab2" 
  5058. )2630, 2060
  5059. 2615, 2210
  5060. 2540, 2375
  5061. 2375, 2570
  5062. )2630, 2060
  5063. !"ab3"
  5064. 2490, 2250
  5065. 2415, 2370
  5066. ungrouped - gives sigma unit (
  5067. core enzyme
  5068. rna-s)
  5069. --Sigma 
  5070. Ungroup
  5071. 2190, 1665
  5072. 2190, 1530
  5073. 2100, 1395
  5074. 1965, 1275
  5075. 1770, 1125
  5076. 1590, 1005
  5077. 1410, 915
  5078. 1125, 780
  5079. 900, 720
  5080. 600, 630
  5081. 360, 540
  5082. 150, 465
  5083. -15, 375
  5084. -150, 285
  5085. -285, 195
  5086. 630, 480
  5087. !"pa"
  5088. "text6"
  5089. --Elongation begins (see scripts 
  5090. events (a) 
  5091. !"pa"
  5092. 2940, 1455
  5093. 0, 75.3125, 0
  5094. 0, 75.3125, 0
  5095. 120, 75.125, 100
  5096. 120, 75.125, 100
  5097. 3015, 1615
  5098. !"ab1"
  5099. 3330, 1455
  5100. 120, 75.125, 100
  5101. 120, 75.125, 100
  5102. 60, 87.625, 100
  5103. 60, 87.625, 100
  5104. 3390, 1615
  5105. "pc" 
  5106. 3720, 1455
  5107. 60, 87.625, 100
  5108. 60, 87.625, 100
  5109. 0, 87.625, 100
  5110. 0, 87.625, 100
  5111. 3765, 1615
  5112. "pd" 
  5113. 4095, 1455
  5114. 0, 87.625, 100
  5115. 0, 87.625, 100
  5116. 0, 87.625, 100
  5117. 0, 87.625, 100
  5118. 4140, 1615
  5119. "pe" 
  5120. 4455, 1455
  5121. 0, 87.625, 100
  5122. 0, 87.625, 100
  5123. 0, 87.625, 100
  5124. 0, 87.625, 100
  5125. 4515, 1615
  5126. "pf" 
  5127. 4830, 1455
  5128. 0, 87.625, 100
  5129. 0, 87.625, 100
  5130. 60, 87.625, 100
  5131. 60, 87.625,100
  5132. 4905, 1615
  5133. "pg" 
  5134. 5205, 1455
  5135. 60, 87.625, 100
  5136. 60, 87.625, 100
  5137. 180, 87.625, 100 
  5138. 180, 87.625, 100
  5139. 5310, 1615
  5140. "ph" 
  5141. 5595, 1455
  5142. 180, 87.625, 100 
  5143. 180, 87.625, 100
  5144. 180, 87.625, 100 
  5145. 180, 87.625, 100
  5146. 5670, 1615
  5147. 5970, 1455
  5148. 180, 87.625, 100 
  5149. 180, 87.625, 100
  5150. 60, 87.625, 100 
  5151. 60, 87.625, 100
  5152. 6045, 1615
  5153. "pj" 
  5154. 6345, 1455
  5155. 60, 87.625, 100 
  5156. 60, 87.625, 100
  5157. 0, 75.125, 100 
  5158. 0, 75.125, 100
  5159. 6435, 1615
  5160. "pk" 
  5161. 6735, 1455
  5162. 0, 75.125, 100 
  5163. 0, 75.125, 100
  5164. 0, 75.125, 100 
  5165. 0, 75.125, 100
  5166. 6825, 1615
  5167. "pl" 
  5168. 7095, 1455
  5169. 0, 75.125, 100 
  5170. 0, 75.125, 100
  5171. 60, 87.625, 100 
  5172. 60, 87.625, 100
  5173. 7170, 1615
  5174. "pm" 
  5175. "text7"
  5176. 7455, 1455
  5177. 60, 87.625, 100
  5178. 60, 87.625, 100
  5179. 60, 87.625, 100 
  5180. 60, 87.625, 100
  5181. 7545, 1615
  5182. "pn" 
  5183. "po" 
  5184. --Core 
  5185.  moved 
  5186. together
  5187. 990, 120
  5188. "text8"
  5189. "text9"
  5190. , al5-al8
  5191. "al7"
  5192. 4026, 516
  5193. 3891, 441
  5194. 3846, 336
  5195. 3786, 231
  5196. 3786, 111
  5197. 3786, 36
  5198. 3786, -54
  5199. "al6"
  5200. 4596, 261
  5201. 4716, 201
  5202. 4776, 111
  5203. 4791, 51
  5204. 4791, -9
  5205. 4791, -69
  5206. away 
  5207. Hrep (ordinary 
  5208. --Rep 
  5209. "al5" 
  5210. 4086, 291
  5211. "al8"
  5212. "rep4"
  5213. )3945, 186
  5214. where 
  5215. 4011, 276
  5216. 3891, 216
  5217. 3786, 156
  5218. 3681, 96
  5219. 3606, 51
  5220. 3591, -54
  5221. 3591, -84
  5222. 3795, 231
  5223. 3705, 336
  5224. 3600, 456
  5225. 3435, 576
  5226. 3315, 666
  5227. 3225, 801
  5228. 3150, 936
  5229. 3075, 1056
  5230. 3030, 1116
  5231. 3000, 1161
  5232. 3681, 1395
  5233. 3831, 1275
  5234. 3936, 1065
  5235. 3981, 885
  5236. 3996, 660
  5237. 3996, 420
  5238. 4011, 210
  5239. 4011, 75
  5240. 4011, -75
  5241. --Rep1b 
  5242. reform 
  5243. )3390, 315
  5244. 3561, 426
  5245. 3891, 651
  5246. fields 
  5247. default 
  5248. buttonUp
  5249. AbuttonUp
  5250. textgo
  5251. cap-camp
  5252. text1
  5253. camp1
  5254. camp1
  5255. camp2
  5256. camp2
  5257. camp1
  5258. camp2
  5259. cap-camp
  5260. cap-camp
  5261. text1a
  5262. RNApol
  5263. RNApol
  5264. RNApol
  5265. RNApol
  5266. RNApol
  5267. RNApol
  5268. text1b
  5269. RNApol
  5270. RNApol
  5271. text2
  5272. Group
  5273. text3
  5274. text4
  5275. leftrans
  5276. leftrans
  5277. rightrans
  5278. rightrans
  5279. text5
  5280. RNApol
  5281. WUngroup
  5282. text6
  5283. rna-s
  5284. leftrans
  5285. leftrans
  5286. rightrans
  5287. rightrans
  5288. trans
  5289. rna-s
  5290. leftrans
  5291. leftrans
  5292. rightrans
  5293. rightrans
  5294. trans
  5295. rna-s
  5296. leftrans
  5297. leftrans
  5298. rightrans
  5299. rightrans
  5300. trans
  5301. rna-s
  5302. leftrans
  5303. leftrans
  5304. rightrans
  5305. rightrans
  5306. trans
  5307. rna-s
  5308. leftrans
  5309. leftrans
  5310. rightrans
  5311. rightrans
  5312. trans
  5313. rna-s
  5314. leftrans
  5315. leftrans
  5316. rightrans
  5317. rightrans
  5318. trans
  5319. rna-s
  5320. leftrans
  5321. leftrans
  5322. rightrans
  5323. rightrans
  5324. trans
  5325. rna-s
  5326. leftrans
  5327. leftrans
  5328. rightrans
  5329. rightrans
  5330. trans
  5331. rna-s
  5332. leftrans
  5333. leftrans
  5334. rightrans
  5335. rightrans
  5336. trans
  5337. rna-s
  5338. leftrans
  5339. leftrans
  5340. rightrans
  5341. rightrans
  5342. trans
  5343. rna-s
  5344. leftrans
  5345. leftrans
  5346. rightrans
  5347. rightrans
  5348. trans
  5349. rna-s
  5350. leftrans
  5351. leftrans
  5352. rightrans
  5353. rightrans
  5354. trans
  5355. text7
  5356. rna-s
  5357. leftrans
  5358. leftrans
  5359. rightrans
  5360. rightrans
  5361. trans
  5362. trans
  5363. rna-s
  5364. Group
  5365. RNApol
  5366. RNApol
  5367. sendToBack
  5368. RNApol
  5369. text8
  5370. text9
  5371. WUngroup
  5372. WUngroup
  5373. rep1b
  5374. Group
  5375. WUngroup
  5376. rep1b
  5377. rep1b
  5378. Group
  5379. text1
  5380. text1a
  5381. text1b
  5382. text2
  5383. text3
  5384. text4
  5385. text5
  5386. text6
  5387. text7
  5388. text8
  5389. text9
  5390. textgo
  5391. default
  5392. trans
  5393. horizPos:by
  5394. horizPos:to
  5395. horizPos
  5396. )-75, 3390
  5397. 60, 3315
  5398. 180, 3210
  5399. 330, 3090
  5400. 465, 2955
  5401. 630, 2835
  5402. 765, 2760
  5403. 810, 2625
  5404. "cap"
  5405. )400, 2180
  5406. 505, 2165
  5407. 625, 2135
  5408. 805, 2090
  5409. 940, 2075
  5410. 1075, 2045
  5411. 1240, 2000
  5412. 1375, 1955
  5413. 1495, 1895
  5414. 1525, 1805
  5415. "text1a"
  5416. --RNA polymerase enters 
  5417. "RNApol" 
  5418. )8430, 165
  5419. 8295, 255
  5420. 8130, 345
  5421. 7890, 495
  5422. 7785, 540
  5423. 7665, 585
  5424. 7500, 645
  5425. 7380, 690
  5426. 7170, 795
  5427. 7005, 915
  5428. 6840, 1035
  5429. 6630, 1230
  5430. 6510, 1320
  5431. 6450, 1350
  5432. 6360, 1440
  5433. down 
  5434. Hsteps 
  5435. horizPos 
  5436. 6360 
  5437. 3735 
  5438. H-375
  5439. ", 1440
  5440. 3735 
  5441. 6735 
  5442. L, 1440
  5443. leaves 
  5444. exits 
  5445. 6885, 1320
  5446. 7095, 1200
  5447. 7320, 1110
  5448. 7470, 1050
  5449. 7680, 945
  5450. 7890, 825
  5451. 8085, 720
  5452. 8325, 585
  5453. "text1b"
  5454. promoter
  5455. )-975, 510
  5456. -855, 525
  5457. -660, 630
  5458. -450, 645
  5459. -180, 705
  5460. 60, 705
  5461. 345, 765
  5462. 705, 810
  5463. 1140, 930
  5464. 1470, 1020
  5465. 2220, 1455
  5466. "text2"
  5467. --Allolactose 
  5468. repressor
  5469. )4326, 510
  5470. 3966, -90
  5471. 3861, 60
  5472. 3771, 195
  5473. 3651, 315
  5474. 3531, 495
  5475. 3411, 705
  5476. 3276, 885
  5477. 3186, 1005
  5478. 3156, 1275
  5479. )4941, -90
  5480. 4941, -90
  5481. "al4" 
  5482. 4911, 45
  5483. 4836, 255
  5484. 4746, 435
  5485. 4626, 600
  5486. 4476, 780
  5487. 4311, 945
  5488. 4131, 1095
  5489. 3936, 1275
  5490. 3516, 1485
  5491.  + 2 allolactose 
  5492. Hrep2.
  5493. --Rep2 
  5494. square 
  5495.  consisting 
  5496. rep1b 
  5497. "al1"
  5498. )2985, 1050
  5499.     off DNA
  5500. --2 remaining 
  5501.     (al6,al7) 
  5502. 3045, 1050
  5503. 3135, 990
  5504. 3225, 960
  5505. )4611, -84
  5506. 4551, 126
  5507. 4431, 276
  5508. 4311, 441
  5509. 4086, 711
  5510. 3741, 1071
  5511. )5286, -69
  5512. 5031, 141
  5513. 4716, 441
  5514. 4371, 606
  5515. 4116, 801
  5516. 3396, 1296
  5517. grouped 
  5518. fal6 
  5519. form rep3
  5520. Group
  5521. --Rep3 
  5522. 3330, 840
  5523. 3420, 780
  5524. 3525, 705
  5525. 3645, 615
  5526. 3690, 570
  5527. 3795, 465
  5528. 3900, 300
  5529. 3960, 240
  5530. 3975, 180
  5531. "text3"
  5532. "text4"
  5533. --Open 
  5534. appears (
  5535. Hmajic)
  5536. trans 
  5537. )2655, 1615
  5538. "leftrans" 
  5539. 240, 75.125, 100
  5540. 240, 75.125, 100
  5541. "rightrans" 
  5542. 0, 75.3125, 0
  5543. 0, 75.6875, 0
  5544. "text5"
  5545. --Abortive initiation strands (ab1-ab3) shown
  5546. )2630, 2060
  5547. 2415, 2195
  5548. 2220, 2330
  5549. 2025, 2450
  5550. 1965, 2525
  5551. !"ab2" 
  5552. )2630, 2060
  5553. 2615, 2210
  5554. 2540, 2375
  5555. 2375, 2570
  5556. )2630, 2060
  5557. !"ab3"
  5558. 2490, 2250
  5559. 2415, 2370
  5560. ungrouped - gives sigma unit (
  5561. core enzyme
  5562. rna-s)
  5563. --Sigma 
  5564. Ungroup
  5565. 2190, 1665
  5566. 2190, 1530
  5567. 2100, 1395
  5568. 1965, 1275
  5569. 1770, 1125
  5570. 1590, 1005
  5571. 1410, 915
  5572. 1125, 780
  5573. 900, 720
  5574. 600, 630
  5575. 360, 540
  5576. 150, 465
  5577. -15, 375
  5578. -150, 285
  5579. -285, 195
  5580. 630, 480
  5581. !"pa"
  5582. "text6"
  5583. --Elongation begins (see scripts 
  5584. events (a) 
  5585. !"pa"
  5586. 2940, 1455
  5587. 0, 75.3125, 0
  5588. 0, 75.3125, 0
  5589. 120, 75.125, 100
  5590. 120, 75.125, 100
  5591. 3015, 1615
  5592. !"ab1"
  5593. 3330, 1455
  5594. 120, 75.125, 100
  5595. 120, 75.125, 100
  5596. 60, 87.625, 100
  5597. 60, 87.625, 100
  5598. 3390, 1615
  5599. "pc" 
  5600. 3720, 1455
  5601. 60, 87.625, 100
  5602. 60, 87.625, 100
  5603. 0, 87.625, 100
  5604. 0, 87.625, 100
  5605. 3765, 1615
  5606. "pd" 
  5607. 4095, 1455
  5608. 0, 87.625, 100
  5609. 0, 87.625, 100
  5610. 0, 87.625, 100
  5611. 0, 87.625, 100
  5612. 4140, 1615
  5613. "pe" 
  5614. 4455, 1455
  5615. 0, 87.625, 100
  5616. 0, 87.625, 100
  5617. 0, 87.625, 100
  5618. 0, 87.625, 100
  5619. 4515, 1615
  5620. "pf" 
  5621. 4830, 1455
  5622. 0, 87.625, 100
  5623. 0, 87.625, 100
  5624. 60, 87.625, 100
  5625. 60, 87.625,100
  5626. 4905, 1615
  5627. "pg" 
  5628. 5205, 1455
  5629. 60, 87.625, 100
  5630. 60, 87.625, 100
  5631. 180, 87.625, 100 
  5632. 180, 87.625, 100
  5633. 5310, 1615
  5634. "ph" 
  5635. 5595, 1455
  5636. 180, 87.625, 100 
  5637. 180, 87.625, 100
  5638. 180, 87.625, 100 
  5639. 180, 87.625, 100
  5640. 5670, 1615
  5641. 5970, 1455
  5642. 180, 87.625, 100 
  5643. 180, 87.625, 100
  5644. 60, 87.625, 100 
  5645. 60, 87.625, 100
  5646. 6045, 1615
  5647. "pj" 
  5648. 6345, 1455
  5649. 60, 87.625, 100 
  5650. 60, 87.625, 100
  5651. 0, 75.125, 100 
  5652. 0, 75.125, 100
  5653. 6435, 1615
  5654. "pk" 
  5655. 6735, 1455
  5656. 0, 75.125, 100 
  5657. 0, 75.125, 100
  5658. 0, 75.125, 100 
  5659. 0, 75.125, 100
  5660. 6825, 1615
  5661. "pl" 
  5662. 7095, 1455
  5663. 0, 75.125, 100 
  5664. 0, 75.125, 100
  5665. 60, 87.625, 100 
  5666. 60, 87.625, 100
  5667. 7170, 1615
  5668. "pm" 
  5669. "text7"
  5670. 7455, 1455
  5671. 60, 87.625, 100
  5672. 60, 87.625, 100
  5673. 60, 87.625, 100 
  5674. 60, 87.625, 100
  5675. 7545, 1615
  5676. "pn" 
  5677. "po" 
  5678. 990, 120
  5679. "text8"
  5680. "text9"
  5681. "al7"
  5682. 4026, 516
  5683. 3891, 441
  5684. 3846, 336
  5685. 3786, 231
  5686. 3786, 111
  5687. 3786, 36
  5688. 3786, -54
  5689. "al6"
  5690. 4596, 261
  5691. 4716, 201
  5692. 4776, 111
  5693. 4791, 51
  5694. 4791, -9
  5695. 4791, -69
  5696. "al5" 
  5697. 4086, 291
  5698. "al8"
  5699. "rep4"
  5700. )3945, 186
  5701. 4011, 276
  5702. 3891, 216
  5703. 3786, 156
  5704. 3681, 96
  5705. 3606, 51
  5706. 3591, -54
  5707. 3591, -84
  5708. 3795, 231
  5709. 3705, 336
  5710. 3600, 456
  5711. 3435, 576
  5712. 3315, 666
  5713. 3225, 801
  5714. 3150, 936
  5715. 3075, 1056
  5716. 3030, 1116
  5717. 3000, 1161
  5718. 3681, 1395
  5719. 3831, 1275
  5720. 3936, 1065
  5721. 3981, 885
  5722. 3996, 660
  5723. 3996, 420
  5724. 4011, 210
  5725. 4011, 75
  5726. 4011, -75
  5727. )3390, 315
  5728. 3561, 426
  5729. 3891, 651
  5730. default 
  5731. buttonUp
  5732. I?buttonUp
  5733. textgo
  5734. cap-camp
  5735. text1
  5736. camp1
  5737. camp1
  5738. camp2
  5739. camp2
  5740. camp1
  5741. camp2
  5742. cap-camp
  5743. cap-camp
  5744. text1a
  5745. RNApol
  5746. RNApol
  5747. RNApol
  5748. RNApol
  5749. RNApol
  5750. RNApol
  5751. text1b
  5752. RNApol
  5753. RNApol
  5754. text2
  5755. Group
  5756. text3
  5757. text4
  5758. leftrans
  5759. leftrans
  5760. rightrans
  5761. rightrans
  5762. text5
  5763. RNApol
  5764. WUngroup
  5765. text6
  5766. rna-s
  5767. leftrans
  5768. leftrans
  5769. rightrans
  5770. rightrans
  5771. trans
  5772. rna-s
  5773. leftrans
  5774. leftrans
  5775. rightrans
  5776. rightrans
  5777. trans
  5778. rna-s
  5779. leftrans
  5780. leftrans
  5781. rightrans
  5782. rightrans
  5783. trans
  5784. rna-s
  5785. leftrans
  5786. leftrans
  5787. rightrans
  5788. rightrans
  5789. trans
  5790. rna-s
  5791. leftrans
  5792. leftrans
  5793. rightrans
  5794. rightrans
  5795. trans
  5796. rna-s
  5797. leftrans
  5798. leftrans
  5799. rightrans
  5800. rightrans
  5801. trans
  5802. rna-s
  5803. leftrans
  5804. leftrans
  5805. rightrans
  5806. rightrans
  5807. trans
  5808. rna-s
  5809. leftrans
  5810. leftrans
  5811. rightrans
  5812. rightrans
  5813. trans
  5814. rna-s
  5815. leftrans
  5816. leftrans
  5817. rightrans
  5818. rightrans
  5819. trans
  5820. rna-s
  5821. leftrans
  5822. leftrans
  5823. rightrans
  5824. rightrans
  5825. trans
  5826. rna-s
  5827. leftrans
  5828. leftrans
  5829. rightrans
  5830. rightrans
  5831. trans
  5832. rna-s
  5833. leftrans
  5834. leftrans
  5835. rightrans
  5836. rightrans
  5837. trans
  5838. text7
  5839. rna-s
  5840. leftrans
  5841. leftrans
  5842. rightrans
  5843. rightrans
  5844. trans
  5845. trans
  5846. rna-s
  5847. Group
  5848. RNApol
  5849. RNApol
  5850. sendToBack
  5851. RNApol
  5852. text8
  5853. text9
  5854. WUngroup
  5855. WUngroup
  5856. rep1b
  5857. Group
  5858. WUngroup
  5859. rep1b
  5860. rep1b
  5861. Group
  5862. text1
  5863. text1a
  5864. text1b
  5865. text2
  5866. text3
  5867. text4
  5868. text5
  5869. text6
  5870. text7
  5871. text8
  5872. text9
  5873. textgo
  5874. default
  5875. trans
  5876. horizPos:by
  5877. horizPos:to
  5878. horizPos
  5879. "textgo"
  5880. "cap-camp"
  5881. "text1"
  5882. --CAP moves 
  5883. screen
  5884. --2 molecules 
  5885. cyclic AMP (camp1,camp2) appear 
  5886. binding sites
  5887. 1 are hidden 
  5888. be replaced 
  5889. -cAMP complex (
  5890. ), which 
  5891. )-630, 2880
  5892. -495, 2790
  5893. -285, 2640
  5894. -105, 2520
  5895. 90, 2370
  5896. 270, 2280
  5897. 405, 2190
  5898. )-90, 3525
  5899. 15, 3465
  5900. 120, 3360
  5901. 195, 3270
  5902. 255, 3150
  5903. 345, 3000
  5904. 405, 2895
  5905. 480, 2805
  5906. 570, 2625
  5907. )-75, 3390
  5908. 60, 3315
  5909. 180, 3210
  5910. 330, 3090
  5911. 465, 2955
  5912. 630, 2835
  5913. 765, 2760
  5914. 810, 2625
  5915. "cap"
  5916. )400, 2180
  5917. 505, 2165
  5918. 625, 2135
  5919. 805, 2090
  5920. 940, 2075
  5921. 1075, 2045
  5922. 1240, 2000
  5923. 1375, 1955
  5924. 1495, 1895
  5925. 1525, 1805
  5926. "text1a"
  5927. --RNA polymerase enters 
  5928. "RNApol" 
  5929. )8430, 165
  5930. 8295, 255
  5931. 8130, 345
  5932. 7890, 495
  5933. 7785, 540
  5934. 7665, 585
  5935. 7500, 645
  5936. 7380, 690
  5937. 7170, 795
  5938. 7005, 915
  5939. 6840, 1035
  5940. 6630, 1230
  5941. 6510, 1320
  5942. 6450, 1350
  5943. 6360, 1440
  5944. down 
  5945. Hsteps 
  5946. horizPos 
  5947. 6360 
  5948. 3735 
  5949. H-375
  5950. ", 1440
  5951. 3735 
  5952. 6735 
  5953. L, 1440
  5954. leaves 
  5955. exits 
  5956. 6885, 1320
  5957. 7095, 1200
  5958. 7320, 1110
  5959. 7470, 1050
  5960. 7680, 945
  5961. 7890, 825
  5962. 8085, 720
  5963. 8325, 585
  5964. "text1b"
  5965. promoter
  5966. )-975, 510
  5967. -855, 525
  5968. -660, 630
  5969. -450, 645
  5970. -180, 705
  5971. 60, 705
  5972. 345, 765
  5973. 705, 810
  5974. 1140, 930
  5975. 1470, 1020
  5976. 2220, 1455
  5977. "text2"
  5978. --Allolactose 
  5979. repressor
  5980. )4326, 510
  5981. 3966, -90
  5982. 3861, 60
  5983. 3771, 195
  5984. 3651, 315
  5985. 3531, 495
  5986. 3411, 705
  5987. 3276, 885
  5988. 3186, 1005
  5989. 3156, 1275
  5990. )4941, -90
  5991. 4941, -90
  5992. "al4" 
  5993. 4911, 45
  5994. 4836, 255
  5995. 4746, 435
  5996. 4626, 600
  5997. 4476, 780
  5998. 4311, 945
  5999. 4131, 1095
  6000. 3936, 1275
  6001. 3516, 1485
  6002.  + 2 allolactose 
  6003. Hrep2.
  6004. --Rep2 
  6005. square 
  6006.  consisting 
  6007. rep1b 
  6008. "al1"
  6009. )2985, 1050
  6010.     off DNA
  6011. --2 remaining 
  6012.     (al6,al7) 
  6013. 3045, 1050
  6014. 3135, 990
  6015. 3225, 960
  6016. )4611, -84
  6017. 4551, 126
  6018. 4431, 276
  6019. 4311, 441
  6020. 4086, 711
  6021. 3741, 1071
  6022. )5286, -69
  6023. 5031, 141
  6024. 4716, 441
  6025. 4371, 606
  6026. 4116, 801
  6027. 3396, 1296
  6028. grouped 
  6029. fal6 
  6030. form rep3
  6031. Group
  6032. --Rep3 
  6033. 3330, 840
  6034. 3420, 780
  6035. 3525, 705
  6036. 3645, 615
  6037. 3690, 570
  6038. 3795, 465
  6039. 3900, 300
  6040. 3960, 240
  6041. 3975, 180
  6042. "text3"
  6043. "text4"
  6044. --Open 
  6045. appears (
  6046. Hmajic)
  6047. trans 
  6048. )2655, 1615
  6049. "leftrans" 
  6050. 240, 75.125, 100
  6051. 240, 75.125, 100
  6052. "rightrans" 
  6053. 0, 75.3125, 0
  6054. 0, 75.6875, 0
  6055. "text5"
  6056. --Abortive initiation strands (ab1-ab3) shown
  6057. )2630, 2060
  6058. 2415, 2195
  6059. 2220, 2330
  6060. 2025, 2450
  6061. 1965, 2525
  6062. !"ab2" 
  6063. )2630, 2060
  6064. 2615, 2210
  6065. 2540, 2375
  6066. 2375, 2570
  6067. )2630, 2060
  6068. !"ab3"
  6069. 2490, 2250
  6070. 2415, 2370
  6071. ungrouped - gives sigma unit (
  6072. core enzyme
  6073. rna-s)
  6074. --Sigma 
  6075. Ungroup
  6076. 2190, 1665
  6077. 2190, 1530
  6078. 2100, 1395
  6079. 1965, 1275
  6080. 1770, 1125
  6081. 1590, 1005
  6082. 1410, 915
  6083. 1125, 780
  6084. 900, 720
  6085. 600, 630
  6086. 360, 540
  6087. 150, 465
  6088. -15, 375
  6089. -150, 285
  6090. -285, 195
  6091. 630, 480
  6092. !"pa"
  6093. "text6"
  6094. --Elongation begins (see scripts 
  6095. events (a) 
  6096. !"pa"
  6097. 2940, 1455
  6098. 0, 75.3125, 0
  6099. 0, 75.3125, 0
  6100. 120, 75.125, 100
  6101. 120, 75.125, 100
  6102. 3015, 1615
  6103. !"ab1"
  6104. 3330, 1455
  6105. 120, 75.125, 100
  6106. 120, 75.125, 100
  6107. 60, 87.625, 100
  6108. 60, 87.625, 100
  6109. 3390, 1615
  6110. "pc" 
  6111. 3720, 1455
  6112. 60, 87.625, 100
  6113. 60, 87.625, 100
  6114. 0, 87.625, 100
  6115. 0, 87.625, 100
  6116. 3765, 1615
  6117. "pd" 
  6118. 4095, 1455
  6119. 0, 87.625, 100
  6120. 0, 87.625, 100
  6121. 0, 87.625, 100
  6122. 0, 87.625, 100
  6123. 4140, 1615
  6124. "pe" 
  6125. 4455, 1455
  6126. 0, 87.625, 100
  6127. 0, 87.625, 100
  6128. 0, 87.625, 100
  6129. 0, 87.625, 100
  6130. 4515, 1615
  6131. "pf" 
  6132. 4830, 1455
  6133. 0, 87.625, 100
  6134. 0, 87.625, 100
  6135. 60, 87.625, 100
  6136. 60, 87.625,100
  6137. 4905, 1615
  6138. "pg" 
  6139. 5205, 1455
  6140. 60, 87.625, 100
  6141. 60, 87.625, 100
  6142. 180, 87.625, 100 
  6143. 180, 87.625, 100
  6144. 5310, 1615
  6145. "ph" 
  6146. 5595, 1455
  6147. 180, 87.625, 100 
  6148. 180, 87.625, 100
  6149. 180, 87.625, 100 
  6150. 180, 87.625, 100
  6151. 5670, 1615
  6152. 5970, 1455
  6153. 180, 87.625, 100 
  6154. 180, 87.625, 100
  6155. 60, 87.625, 100 
  6156. 60, 87.625, 100
  6157. 6045, 1615
  6158. "pj" 
  6159. 6345, 1455
  6160. 60, 87.625, 100 
  6161. 60, 87.625, 100
  6162. 0, 75.125, 100 
  6163. 0, 75.125, 100
  6164. 6435, 1615
  6165. "pk" 
  6166. 6735, 1455
  6167. 0, 75.125, 100 
  6168. 0, 75.125, 100
  6169. 0, 75.125, 100 
  6170. 0, 75.125, 100
  6171. 6825, 1615
  6172. "pl" 
  6173. 7095, 1455
  6174. 0, 75.125, 100 
  6175. 0, 75.125, 100
  6176. 60, 87.625, 100 
  6177. 60, 87.625, 100
  6178. 7170, 1615
  6179. "pm" 
  6180. "text7"
  6181. 7455, 1455
  6182. 60, 87.625, 100
  6183. 60, 87.625, 100
  6184. 60, 87.625, 100 
  6185. 60, 87.625, 100
  6186. 7545, 1615
  6187. "pn" 
  6188. "po" 
  6189. --Core 
  6190.  moved 
  6191. together
  6192. 990, 120
  6193. "text8"
  6194. "text9"
  6195. , al5-al8
  6196. "al7"
  6197. 4026, 516
  6198. 3891, 441
  6199. 3846, 336
  6200. 3786, 231
  6201. 3786, 111
  6202. 3786, 36
  6203. 3786, -54
  6204. "al6"
  6205. 4596, 261
  6206. 4716, 201
  6207. 4776, 111
  6208. 4791, 51
  6209. 4791, -9
  6210. 4791, -69
  6211. "al5" 
  6212. 4086, 291
  6213. "al8"
  6214. "rep4"
  6215. )3945, 186
  6216. 4011, 276
  6217. 3891, 216
  6218. 3786, 156
  6219. 3681, 96
  6220. 3606, 51
  6221. 3591, -54
  6222. 3591, -84
  6223. 3795, 231
  6224. 3705, 336
  6225. 3600, 456
  6226. 3435, 576
  6227. 3315, 666
  6228. 3225, 801
  6229. 3150, 936
  6230. 3075, 1056
  6231. 3030, 1116
  6232. 3000, 1161
  6233. 3681, 1395
  6234. 3831, 1275
  6235. 3936, 1065
  6236. 3981, 885
  6237. 3996, 660
  6238. 3996, 420
  6239. 4011, 210
  6240. 4011, 75
  6241. 4011, -75
  6242. )3390, 315
  6243. 3561, 426
  6244. 3891, 651
  6245. default 
  6246. buttonUp
  6247. 2@buttonUp
  6248. textgo
  6249. cap-camp
  6250. text1
  6251. camp1
  6252. camp1
  6253. camp2
  6254. camp2
  6255. camp1
  6256. camp2
  6257. cap-camp
  6258. cap-camp
  6259. text1a
  6260. RNApol
  6261. RNApol
  6262. RNApol
  6263. RNApol
  6264. RNApol
  6265. RNApol
  6266. text1b
  6267. RNApol
  6268. RNApol
  6269. text2
  6270. Group
  6271. text3
  6272. text4
  6273. leftrans
  6274. leftrans
  6275. rightrans
  6276. rightrans
  6277. text5
  6278. RNApol
  6279. WUngroup
  6280. text6
  6281. rna-s
  6282. leftrans
  6283. leftrans
  6284. rightrans
  6285. rightrans
  6286. trans
  6287. rna-s
  6288. leftrans
  6289. leftrans
  6290. rightrans
  6291. rightrans
  6292. trans
  6293. rna-s
  6294. leftrans
  6295. leftrans
  6296. rightrans
  6297. rightrans
  6298. trans
  6299. rna-s
  6300. leftrans
  6301. leftrans
  6302. rightrans
  6303. rightrans
  6304. trans
  6305. rna-s
  6306. leftrans
  6307. leftrans
  6308. rightrans
  6309. rightrans
  6310. trans
  6311. rna-s
  6312. leftrans
  6313. leftrans
  6314. rightrans
  6315. rightrans
  6316. trans
  6317. rna-s
  6318. leftrans
  6319. leftrans
  6320. rightrans
  6321. rightrans
  6322. trans
  6323. rna-s
  6324. leftrans
  6325. leftrans
  6326. rightrans
  6327. rightrans
  6328. trans
  6329. rna-s
  6330. leftrans
  6331. leftrans
  6332. rightrans
  6333. rightrans
  6334. trans
  6335. rna-s
  6336. leftrans
  6337. leftrans
  6338. rightrans
  6339. rightrans
  6340. trans
  6341. rna-s
  6342. leftrans
  6343. leftrans
  6344. rightrans
  6345. rightrans
  6346. trans
  6347. rna-s
  6348. leftrans
  6349. leftrans
  6350. rightrans
  6351. rightrans
  6352. trans
  6353. text7
  6354. rna-s
  6355. leftrans
  6356. leftrans
  6357. rightrans
  6358. rightrans
  6359. trans
  6360. trans
  6361. rna-s
  6362. Group
  6363. RNApol
  6364. RNApol
  6365. sendToBack
  6366. RNApol
  6367. text8
  6368. text9
  6369. WUngroup
  6370. WUngroup
  6371. rep1b
  6372. Group
  6373. WUngroup
  6374. rep1b
  6375. rep1b
  6376. Group
  6377. text1
  6378. text1a
  6379. text1b
  6380. text2
  6381. text3
  6382. text4
  6383. text5
  6384. text6
  6385. text7
  6386. text8
  6387. text9
  6388. textgo
  6389. default
  6390. trans
  6391. horizPos:by
  6392. horizPos:to
  6393. horizPos
  6394.