home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ DP Tool Club 17 / CD_ASCQ_17_101194.iso / vrac / med9408d.zip / M9480700.TXT < prev    next >
Text File  |  1994-08-27  |  3KB  |  46 lines
  1.        Document 0700
  2.  DOCN  M9480700
  3.  TI    Structural basis of asymmetry in the human immunodeficiency virus type 1
  4.        reverse transcriptase heterodimer.
  5.  DT    9410
  6.  AU    Wang J; Smerdon SJ; Jager J; Kohlstaedt LA; Rice PA; Friedman JM; Steitz
  7.        TA; Department of Molecular Biophysics and Biochemistry, Howard; Hughes
  8.        Medical Institute, Yale University New Haven, CT; 06520-8114.
  9.  SO    Proc Natl Acad Sci U S A. 1994 Jul 19;91(15):7242-6. Unique Identifier :
  10.        AIDSLINE MED/94316671
  11.  AB    The reverse transcriptase from human immunodeficiency virus type 1 is a
  12.        heterodimer consisting of one 66-kDa and one 51-kDa subunit. The p66
  13.        subunit contains both a polymerase and an RNase H domain; proteolytic
  14.        cleavage of p66 removes the RNase H domain to yield the p51 subunit.
  15.        Although the polymerase domain of p66 folds into an open, extended
  16.        structure containing a large active-site cleft, that of p51 is closed
  17.        and compact. The connection subdomain, which lies between the polymerase
  18.        and RNase H active sites in p66, plays a central role in the formation
  19.        of the reverse transcriptase heterodimer. Extensive and very different
  20.        intra- and intersubunit contacts are made by the connection subdomains
  21.        of each of the subunits. Together, contacts between the two connection
  22.        domains constitute approximately one-third of the total contacts between
  23.        subunits of the heterodimer. Conversion of an open p66 polymerase domain
  24.        structure to a closed p51-like structure results in a reduction in
  25.        solvent-accessible surface area by 1600 A2 and the burying of an
  26.        extensive hydrophobic surface. Thus, the monomeric forms of both p66 and
  27.        p51 are proposed to have the same closed structure as seen in the p51
  28.        subunit of the heterodimer. The free energy required to convert p66 from
  29.        a closed p51-like structure to the observed open p66 polymerase domain
  30.        structure is generated by the burying of a large, predominantly
  31.        hydrophobic surface area upon formation of the heterodimer. It is likely
  32.        that the only kind of dimer that can form is an asymmetric one like that
  33.        seen in the heterodimer structure, since one dimer interaction surface
  34.        exists only in p51 and the other only in p66. We suggest that both p51
  35.        and p66 form asymmetric homodimers that are assembled from one subunit
  36.        that has assumed the open conformation and one that has the closed
  37.        structure.
  38.  DE    Antibodies, Viral/CHEMISTRY  DNA/CHEMISTRY  HIV-1/*ENZYMOLOGY  Models,
  39.        Molecular  Protein Conformation  Protein Folding  Pyridines/PHARMACOLOGY
  40.        Reverse Transcriptase/ANTAGONISTS & INHIB/*CHEMISTRY/METABOLISM
  41.        Support, U.S. Gov't, P.H.S.  JOURNAL ARTICLE
  42.  
  43.        SOURCE: National Library of Medicine.  NOTICE: This material may be
  44.        protected by Copyright Law (Title 17, U.S.Code).
  45.  
  46.