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Text File  |  1994-10-01  |  2KB  |  36 lines

  1.        Document 0080
  2.  DOCN  M94A0080
  3.  TI    Capillary electrophoresis: detection of hybridization between synthetic
  4.        oligonucleotides and HIV-1 genomic DNA amplified by polymerase-chain
  5.        reaction.
  6.  DT    9412
  7.  AU    Bianchi N; Mischiati C; Feriotto G; Fiorentino D; Di Biase S; Apicella
  8.        N; Gambari R; Biochemistry Institute, Ferrara University, Italy.
  9.  SO    J Virol Methods. 1994 May;47(3):321-9. Unique Identifier : AIDSLINE
  10.        MED/94351052
  11.  AB    The polymerase chain reaction (PCR) is one of the most efficient
  12.        techniques for measuring the viral load of HIV-infected samples.
  13.        Determination of the specificity of PCR products is usually based on
  14.        Southern blotting and hybridization of the amplified DNA to radioactive
  15.        oligonucleotide probes specific for sequences comprised between the PCR
  16.        primers. The recent introduction of capillary electrophoresis (CE) for
  17.        identification of HIV-1 and HTLV-I PCR products appears interesting in
  18.        light of its reproducibility, sensitivity and because it is fast and
  19.        suitable for detection of DNA/DNA and DNA/RNA hybrids. We demonstrate
  20.        that specific hybridization of a HIV-1 oligonucleotide probe to
  21.        single-stranded DNA obtained by unbalanced PCR is detectable by
  22.        capillary electrophoresis. This enabled us the application of a
  23.        one-step, non-radioactive protocol to demonstrate the specificity of
  24.        amplification of HIV-1 genomic sequences by PCR. This procedure is
  25.        simple, reproducible and is suggested as an integral part of automated
  26.        diagnostic systems based on the use of laboratory work stations for DNA
  27.        isolation, preparation of PCR reactions and analysis of PCR products.
  28.  DE    Base Sequence  DNA, Viral/*CHEMISTRY/ISOLATION & PURIF
  29.        Electrophoresis/*METHODS  Genome, Viral  HIV-1/*GENETICS  Molecular
  30.        Sequence Data  Nucleic Acid Hybridization  Oligonucleotides/*CHEMISTRY
  31.        Polymerase Chain Reaction  Support, Non-U.S. Gov't  JOURNAL ARTICLE
  32.  
  33.        SOURCE: National Library of Medicine.  NOTICE: This material may be
  34.        protected by Copyright Law (Title 17, U.S.Code).
  35.  
  36.