home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ The Pier Shareware 6 / The_Pier_Shareware_Number_6_(The_Pier_Exchange)_(1995).iso / 026 / med9408e.zip / M9480832.TXT < prev    next >
Text File  |  1994-09-05  |  3KB  |  41 lines
  1.        Document 0832
  2.  DOCN  M9480832
  3.  TI    Cloning and sequencing of the cDNA encoding Pneumocystis carinii inosine
  4.        monophosphate dehydrogenase (IMPDH).
  5.  DT    9410
  6.  AU    O'Gara MJ; Queener SF; Lee CH; Indiana University School of Medicine,
  7.        Indianapolis.
  8.  SO    Abstr Gen Meet Am Soc Microbiol. 1994;94:590 (abstract no. F-13). Unique
  9.        Identifier : AIDSLINE ASM94/94313113
  10.  AB    Pneumocystis carinii is an opportunistic pathogen that causes pneumonia
  11.        in immunocompromised hosts. Chemotherapy is available for treating P.
  12.        carinii pneumonia, but severe toxicity is a significant problem with the
  13.        compounds currently considered drugs of choice. IMP dehydrogenase
  14.        (IMPDH; EC 1.1.1.205) may be a good alternative target for
  15.        anti-Pneumocystis chemotherapy because IMPDH inhibitors have been used
  16.        successfully to treat leukemia. Our lab found the IMPDH inhibitor,
  17.        mycophenolic acid, to be effective in preventing the growth of P.
  18.        carinii in culture. In order to characterize P. carinii IMPDH and assay
  19.        potential inhibitors in vitro, we cloned part of the IMPDH gene.
  20.        Initially, we amplified a 1.3 kb fragment of P. carinii IMPDH from
  21.        genomic DNA using PCR and two degenerate oligonucleotides based on two
  22.        conserved sequences identified in IMPDH from six different species. The
  23.        DNA sequence of the 1.3 kb product indicated the presence of putative
  24.        introns having the characteristic 5'-GT and AG-3' signal. Using a
  25.        combination of RACE (rapid amplification of cDNA ends) and RT-PCR, we
  26.        isolated and cloned the entire cDNA of the P. carinii IMPDH. The
  27.        nucleotide and amino acid sequences (57-59% and 32-63%, respectively)
  28.        revealed significant homology with published sequences of IMPDH genes.
  29.        We are currently working to express P. carinii IMPDH which will be
  30.        assayed to confirm catalytic activity.
  31.  DE    Amino Acid Sequence  Base Sequence  Cloning, Molecular/*METHODS
  32.        Comparative Study  DNA, Complementary/*ANALYSIS  DNA,
  33.        Fungal/ANALYSIS/GENETICS  Gene Amplification  IMP
  34.        Dehydrogenase/*GENETICS  Pneumocystis carinii/*ENZYMOLOGY/*GENETICS
  35.        Polymerase Chain Reaction/METHODS  Sequence Homology, Amino Acid
  36.        Sequence Homology, Nucleic Acid  MEETING ABSTRACT
  37.  
  38.        SOURCE: National Library of Medicine.  NOTICE: This material may be
  39.        protected by Copyright Law (Title 17, U.S.Code).
  40.  
  41.