home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ The Pier Shareware 6 / The_Pier_Shareware_Number_6_(The_Pier_Exchange)_(1995).iso / 026 / med9408e.zip / M9480823.TXT < prev    next >
Text File  |  1994-09-05  |  3KB  |  44 lines
  1.        Document 0823
  2.  DOCN  M9480823
  3.  TI    Rapid identification of Pneumocystis carinii isolates by random
  4.        amplification polymorphic DNA fingerprinting.
  5.  DT    9410
  6.  AU    Chary-Reddy S; Graves DC; Univ. of Okla. Hlth. Sci. Ctr., Oklahoma City.
  7.  SO    Abstr Gen Meet Am Soc Microbiol. 1994;94:622 (abstract no. V-27). Unique
  8.        Identifier : AIDSLINE ASM94/94313122
  9.  AB    Pneumocystis carinii is an opportunistic pathogen that causes pneumonia
  10.        in immunocompromised hosts including humans. It is the leading cause of
  11.        morbidity and mortality in patients with AIDS. To understand more
  12.        clearly the transmission of this organism, it is important to develop
  13.        methods that can distinguish P. carinii isolates. We utilized a randomly
  14.        designed primer P14 (GCA CAC TCT C) and the random amplified polymorphic
  15.        DNA (RAPD) assay (Williams et al. 1990. Nucleic acids Res. 18: 6531) to
  16.        amplify genomic DNA segments of P. carinii obtained from rat, mouse,
  17.        horse, ferret and human. The amplified products were detected by gel
  18.        electrophoresis and Southern hybridization using a 32P labelled
  19.        repetitive DNA sequence from rat P. carinii. Genomic DNA from P. carinii
  20.        isolates of different species gave distinct RAPD profiles, suggesting
  21.        that these immunocompromised hosts were infected by genetically distinct
  22.        P. carinii strains. Genomic DNA of P. carinii obtained from two
  23.        different strains of rats (Sprague-Dawley from Sasco, Inc. and Wistar
  24.        from Hilltop laboratories) and Sprague-Dawley rats from different
  25.        vendors produced different band patterns. Furthermore, we were able to
  26.        demonstrate two different genetic variants of P. carinii in Wistar rats
  27.        suggesting a coinfection. In preliminary studies using DNA obtained from
  28.        two different human P. carinii isolates, identical RAPD profiles were
  29.        observed. Thus, it appears that the RAPD assay using primer P14 is an
  30.        attractive method for identifying specific strains of P. carinii and is
  31.        suitable for large scale epidemiological studies.
  32.  DE    Animal  AIDS-Related Opportunistic Infections/*DIAGNOSIS  Base Sequence
  33.        Blotting, Southern/METHODS  Comparative Study  DNA Primers  Ferrets
  34.        Gene Amplification/*METHODS  Horses  Human  Mice  Molecular Sequence
  35.        Data  Pneumocystis carinii/GENETICS/*ISOLATION & PURIF  Pneumocystis
  36.        carinii Infections/*DIAGNOSIS  Polymorphism (Genetics)  Random
  37.        Allocation  Rats  Rats, Sprague-Dawley  Rats, Wistar  Repetitive
  38.        Sequences, Nucleic Acid  Species Specificity  Variation (Genetics)
  39.        MEETING ABSTRACT
  40.  
  41.        SOURCE: National Library of Medicine.  NOTICE: This material may be
  42.        protected by Copyright Law (Title 17, U.S.Code).
  43.  
  44.