home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ The Datafile PD-CD 5 / DATAFILE_PDCD5.iso / rasmol / scipts / mhc / !MHC / MHC1_TXT < prev    next >
Text File  |  1995-12-13  |  3KB  |  88 lines
  1. This document has the following sections:
  2.  
  3. INSTALLATION OF RASWIN SCRIPT
  4. OPERATION OF SCRIPT
  5. SCRIPT SPEED/PACING/TIMING
  6.  
  7. - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 
  8. INSTALLATION OF RASWIN SCRIPT
  9.  
  10. Each script consists of a top level script plus many
  11. subscripts and some PDB files.  It is therefore
  12. advisable to install each script in a separate
  13. subdirectory. For example, assuming you have installed
  14. the RasWin program files in C:\RASWIN, the script MHC1
  15. could be installed in C:\RASWIN\MHC1.
  16.  
  17. To do this, copy the packed file MHC1ZIP.EXE into the
  18. desired subdirectory, and then run it as a DOS program
  19. at the DOS prompt (which will unpack it).
  20.  
  21. Now run Windows.  In Windows, with the RasWin icon
  22. selected, select File, Preferences, and change the
  23. Working Directory to the one containing the unpacked
  24. script files.  (If you want access to RasWin's built-in
  25. help, you must also copy RASWIN.HLP into the working
  26. directory.)
  27.  
  28. If you have several scripts, you may wish to create a
  29. separate RasWin icon for each.  This would enable you
  30. to change scripts smoothly during a lecture, without
  31. changing the working directory.  With the RasWin icon
  32. highlighted, select File, Copy.  Now use File,
  33. Properties to change the working directory to the one
  34. for the script, and the Description (which will appear
  35. under the icon) to the script name.  Thus you will end
  36. up with a script-name-labeled RasWin icon for each
  37. script.  If you wish, you can even configure the
  38. Properties to run the script automatically when the
  39. icon is double-clicked.  To do this, put '-script
  40. mhc1.top' after RASWIN.EXE in the Command Line slot of
  41. the Properties box.  [WARNING: there is a bug in RasWin
  42. beta 2.6 which hangs scripts started in this way at the
  43. first pause.  Therefore, scripts will have to be run
  44. manually, with a 'script mhc1.top' command in the
  45. command window, until this is fixed.]
  46.  
  47. OPERATION OF SCRIPT
  48.  
  49. MHC1.TOP is the top-level script. Start it by typing
  50. 'script mhc1.top' in the RasWin command line window,
  51. then pressing Enter.
  52.  
  53. This script is designed for NO MANUAL ROTATION during
  54. the script.  It pauses frequently, waiting for the
  55. lecturer (or student) to press the space bar to
  56. proceed.  The very last image in the script (after the
  57. RASMOL> prompt returns) benefits from manual
  58. rotation with the mouse.
  59.  
  60. When the VSV peptide first appears, the molecule will
  61. be too high (due to a bug in RasMol 2.6 beta). Center
  62. it manually (right mouse button for translation) before
  63. proceeding.
  64.  
  65. SCRIPT SPEED/PACING/TIMING
  66.  
  67. RasWin32 beta 2.6 (the 32 bit program) is several times
  68. faster than RasWin 2.6 (the 16 bit program).  To run
  69. RASWIN32 you may need a Windows accessory package which
  70. is provided free by MicroSoft.  For details see:
  71.  
  72. http://www.umass.edu/microbio/rasmol/getras.htm
  73.  
  74. Script execution speed is affected by the speed of your
  75. computer, the speed of your graphics card, the screen
  76. resolution, and the size of the RasWin graphics window. 
  77. Starting with a full-screen graphics window, you can
  78. speed up execution by reducing the resolution from
  79. 1024 x 768 to 800 x 600 to 640 x 480 pixels.  This is
  80. usually done with a SetRes (or related) icon in the
  81. Windows Control Panel.  Further increases in speed can
  82. be obtained by reducing the size of the graphics window
  83. (to less than full-screen).  Quick previewing of scripts
  84. can be done very quickly in a tiny graphics window.
  85.  
  86. -Eric Martz
  87. emartz@microbio.umass.edu
  88.