home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ The Datafile PD-CD 5 / DATAFILE_PDCD5.iso / rasmol / scipts / bilayer / !Bilayer / Z-PC4_SCR < prev   
Text File  |  1996-03-28  |  15KB  |  579 lines

  1. #!rasmol -script
  2. # File: Z-PC4.SCR
  3. # Creator: RasMol Version 2.6
  4.  
  5. background [0,0,0]
  6. zap
  7. load pdb "SLC-W.PDB"
  8. set ambient 60
  9. set specular off
  10.  
  11. reset
  12. slab off
  13. rotate z 1
  14. rotate y -89
  15. rotate x 88
  16. zoom 200
  17.  
  18. set bonds off
  19. set axes off
  20. set boundingbox off
  21. set unitcell off
  22. set bondmode and
  23. dots off
  24.  
  25.  
  26. # Avoid Colour Problems!
  27. select all
  28. colour bonds none
  29. colour backbone none
  30. colour hbonds none
  31. colour ssbonds none
  32. colour ribbons none
  33. colour white
  34.  
  35. # Atoms
  36. select (atomno>=2081) and (atomno<=2096)
  37. colour atoms [200,200,140]
  38. select (atomno>=2097) and (atomno<=2132)
  39. colour atoms cpk
  40. select (atomno>=2133) and (atomno<=2148)
  41. colour atoms [200,200,140]
  42. select (atomno>=2149) and (atomno<=2184)
  43. colour atoms cpk
  44. select (atomno>=2185) and (atomno<=2200)
  45. colour atoms [200,200,140]
  46. select (atomno>=2201) and (atomno<=2236)
  47. colour atoms cpk
  48. select (atomno>=2237) and (atomno<=2252)
  49. colour atoms [200,200,140]
  50. select (atomno>=2253) and (atomno<=2288)
  51. colour atoms cpk
  52. select (atomno>=2289) and (atomno<=2304)
  53. colour atoms [200,200,140]
  54. select (atomno>=2305) and (atomno<=2340)
  55. colour atoms cpk
  56. select (atomno>=2341) and (atomno<=2356)
  57. colour atoms [200,200,140]
  58. select (atomno>=2357) and (atomno<=2392)
  59. colour atoms cpk
  60. select (atomno>=2393) and (atomno<=2408)
  61. colour atoms [200,200,140]
  62. select (atomno>=2409) and (atomno<=2444)
  63. colour atoms cpk
  64. select (atomno>=2445) and (atomno<=2460)
  65. colour atoms [200,200,140]
  66. select (atomno>=2461) and (atomno<=2496)
  67. colour atoms cpk
  68. select (atomno>=2497) and (atomno<=2512)
  69. colour atoms [200,200,140]
  70. select (atomno>=2513) and (atomno<=2548)
  71. colour atoms cpk
  72. select (atomno>=2549) and (atomno<=2564)
  73. colour atoms [200,200,140]
  74. select (atomno>=2565) and (atomno<=2600)
  75. colour atoms cpk
  76. select (atomno>=2601) and (atomno<=2616)
  77. colour atoms [200,200,140]
  78. select (atomno>=2617) and (atomno<=2652)
  79. colour atoms cpk
  80. select (atomno>=2653) and (atomno<=2668)
  81. colour atoms [200,200,140]
  82. select (atomno>=2669) and (atomno<=2704)
  83. colour atoms cpk
  84. select (atomno>=2705) and (atomno<=2720)
  85. colour atoms [200,200,140]
  86. select (atomno>=2721) and (atomno<=2756)
  87. colour atoms cpk
  88. select (atomno>=2757) and (atomno<=2772)
  89. colour atoms [200,200,140]
  90. select (atomno>=2773) and (atomno<=2808)
  91. colour atoms cpk
  92. select (atomno>=2809) and (atomno<=2824)
  93. colour atoms [200,200,140]
  94. select (atomno>=2825) and (atomno<=2860)
  95. colour atoms cpk
  96. select (atomno>=2861) and (atomno<=2876)
  97. colour atoms [200,200,140]
  98. select (atomno>=2877) and (atomno<=2912)
  99. colour atoms cpk
  100. select (atomno>=2913) and (atomno<=2928)
  101. colour atoms [200,200,140]
  102. select (atomno>=2929) and (atomno<=2964)
  103. colour atoms cpk
  104. select (atomno>=2965) and (atomno<=2980)
  105. colour atoms [200,200,140]
  106. select (atomno>=2981) and (atomno<=3016)
  107. colour atoms cpk
  108. select (atomno>=3017) and (atomno<=3032)
  109. colour atoms [200,200,140]
  110. select (atomno>=3033) and (atomno<=3068)
  111. colour atoms cpk
  112. select (atomno>=3069) and (atomno<=3084)
  113. colour atoms [200,200,140]
  114. select (atomno>=3085) and (atomno<=3120)
  115. colour atoms cpk
  116. select (atomno>=2081) and (atomno<=2538)
  117. spacefill off
  118. select atomno=2539
  119. spacefill 470
  120. select (atomno>=2540) and (atomno<=2545)
  121. spacefill off
  122. select atomno=2546
  123. spacefill 375
  124. select (atomno>=2547) and (atomno<=2590)
  125. spacefill off
  126. select atomno=2591
  127. spacefill 470
  128. select (atomno>=2592) and (atomno<=2597)
  129. spacefill off
  130. select atomno=2598
  131. spacefill 375
  132. select (atomno>=2599) and (atomno<=2642)
  133. spacefill off
  134. select atomno=2643
  135. spacefill 470
  136. select (atomno>=2644) and (atomno<=2649)
  137. spacefill off
  138. select atomno=2650
  139. spacefill 375
  140. select (atomno>=2651) and (atomno<=2694)
  141. spacefill off
  142. select atomno=2695
  143. spacefill 470
  144. select (atomno>=2696) and (atomno<=2701)
  145. spacefill off
  146. select atomno=2702
  147. spacefill 375
  148. select (atomno>=2703) and (atomno<=3120)
  149. spacefill off
  150. set shadow off
  151.  
  152. # Bonds
  153. select all
  154. wireframe off
  155. select (atomno=2704) or (atomno==2695)
  156. wireframe 50
  157. select (atomno=2703) or (atomno==2695)
  158. wireframe 50
  159. select (atomno=2702) or (atomno==2701)
  160. wireframe 50
  161. select (atomno=2702) or (atomno==2699)
  162. wireframe 50
  163. select (atomno=2702) or (atomno==2698)
  164. wireframe 50
  165. select (atomno=2702) or (atomno==2700)
  166. wireframe 50
  167. select (atomno=2698) or (atomno==2697)
  168. wireframe 50
  169. select (atomno=2697) or (atomno==2696)
  170. wireframe 50
  171. select (atomno=2696) or (atomno==2695)
  172. wireframe 50
  173. select (atomno=2695) or (atomno==2675)
  174. wireframe 50
  175. select (atomno=2694) or (atomno==2693)
  176. wireframe 50
  177. select (atomno=2694) or (atomno==2686)
  178. wireframe 50
  179. select (atomno=2693) or (atomno==2692)
  180. wireframe 50
  181. select (atomno=2692) or (atomno==2691)
  182. wireframe 50
  183. select (atomno=2691) or (atomno==2690)
  184. wireframe 50
  185. select (atomno=2690) or (atomno==2689)
  186. wireframe 50
  187. select (atomno=2689) or (atomno==2688)
  188. wireframe 50
  189. select (atomno=2688) or (atomno==2687)
  190. wireframe 50
  191. select (atomno=2686) or (atomno==2685)
  192. wireframe 50
  193. select (atomno=2685) or (atomno==2678)
  194. wireframe 50
  195. select (atomno=2684) or (atomno==2676)
  196. wireframe 50
  197. select (atomno=2684) or (atomno==2683)
  198. wireframe 50
  199. select (atomno=2683) or (atomno==2682)
  200. wireframe 50
  201. select (atomno=2682) or (atomno==2681)
  202. wireframe 50
  203. select (atomno=2681) or (atomno==2680)
  204. wireframe 50
  205. select (atomno=2680) or (atomno==2679)
  206. wireframe 50
  207. select (atomno=2679) or (atomno==2678)
  208. wireframe 50
  209. select (atomno=2677) or (atomno==2676)
  210. wireframe 50
  211. select (atomno=2676) or (atomno==2674)
  212. wireframe 50
  213. select (atomno=2675) or (atomno==2673)
  214. wireframe 50
  215. select (atomno=2674) or (atomno==2672)
  216. wireframe 50
  217. select (atomno=2673) or (atomno==2672)
  218. wireframe 50
  219. select (atomno=2672) or (atomno==2671)
  220. wireframe 50
  221. select (atomno=2671) or (atomno==2669)
  222. wireframe 50
  223. select (atomno=2670) or (atomno==2668)
  224. wireframe 50
  225. select (atomno=2669) or (atomno==2668)
  226. wireframe 50
  227. select (atomno=2668) or (atomno==2665)
  228. wireframe 50
  229. select (atomno=2667) or (atomno==2666)
  230. wireframe 50
  231. select (atomno=2666) or (atomno==2658)
  232. wireframe 50
  233. select (atomno=2665) or (atomno==2664)
  234. wireframe 50
  235. select (atomno=2664) or (atomno==2663)
  236. wireframe 50
  237. select (atomno=2663) or (atomno==2662)
  238. wireframe 50
  239. select (atomno=2662) or (atomno==2661)
  240. wireframe 50
  241. select (atomno=2661) or (atomno==2660)
  242. wireframe 50
  243. select (atomno=2660) or (atomno==2659)
  244. wireframe 50
  245. select (atomno=2659) or (atomno==2656)
  246. wireframe 50
  247. select (atomno=2658) or (atomno==2653)
  248. wireframe 50
  249. select (atomno=2657) or (atomno==2654)
  250. wireframe 50
  251. select (atomno=2657) or (atomno==2655)
  252. wireframe 50
  253. select (atomno=2656) or (atomno==2655)
  254. wireframe 50
  255. select (atomno=2654) or (atomno==2653)
  256. wireframe 50
  257. select (atomno=2652) or (atomno==2643)
  258. wireframe 50
  259. select (atomno=2651) or (atomno==2643)
  260. wireframe 50
  261. select (atomno=2650) or (atomno==2647)
  262. wireframe 50
  263. select (atomno=2650) or (atomno==2646)
  264. wireframe 50
  265. select (atomno=2650) or (atomno==2648)
  266. wireframe 50
  267. select (atomno=2650) or (atomno==2649)
  268. wireframe 50
  269. select (atomno=2646) or (atomno==2645)
  270. wireframe 50
  271. select (atomno=2645) or (atomno==2644)
  272. wireframe 50
  273. select (atomno=2644) or (atomno==2643)
  274. wireframe 50
  275. select (atomno=2643) or (atomno==2623)
  276. wireframe 50
  277. select (atomno=2642) or (atomno==2634)
  278. wireframe 50
  279. select (atomno=2642) or (atomno==2641)
  280. wireframe 50
  281. select (atomno=2641) or (atomno==2640)
  282. wireframe 50
  283. select (atomno=2640) or (atomno==2639)
  284. wireframe 50
  285. select (atomno=2639) or (atomno==2638)
  286. wireframe 50
  287. select (atomno=2638) or (atomno==2637)
  288. wireframe 50
  289. select (atomno=2637) or (atomno==2636)
  290. wireframe 50
  291. select (atomno=2636) or (atomno==2635)
  292. wireframe 50
  293. select (atomno=2634) or (atomno==2633)
  294. wireframe 50
  295. select (atomno=2633) or (atomno==2626)
  296. wireframe 50
  297. select (atomno=2632) or (atomno==2624)
  298. wireframe 50
  299. select (atomno=2632) or (atomno==2631)
  300. wireframe 50
  301. select (atomno=2631) or (atomno==2630)
  302. wireframe 50
  303. select (atomno=2630) or (atomno==2629)
  304. wireframe 50
  305. select (atomno=2629) or (atomno==2628)
  306. wireframe 50
  307. select (atomno=2628) or (atomno==2627)
  308. wireframe 50
  309. select (atomno=2627) or (atomno==2626)
  310. wireframe 50
  311. select (atomno=2625) or (atomno==2624)
  312. wirefr