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Text File  |  1995-03-04  |  1.4 KB  |  31 lines
  1. **********************************************
  2. * Oxysterol-binding protein family signature *
  3. **********************************************
  4.  
  5. A number of eukaryotic proteins that seem to be involved with sterol synthesis
  6. and/or its regulation have been found [1] to be evolutionary related:
  7.  
  8.  - Mammalian  oxysterol-binding  protein (OSBP); a protein of about 800 amino-
  9.    acid residues that binds a variety of oxysterols; oxygenated derivatives of
  10.    cholesterol. OSBP seems to play a complex role in the  regulation of sterol
  11.    metabolism.
  12.  - Yeast proteins HES1 and KES1; highly related protein  of  434 residues that
  13.    seem to play a role in ergosterol synthesis.
  14.  - Yeast  OSH1,  a protein of 859 residues that also play a role in ergosterol
  15.    synthesis.
  16.  - Yeast hypothetical protein YKR003w (448 residues).
  17.  
  18. All these proteins contain a moderately conserved domain of about 250 residues
  19. which is  located  in  the  C-terminal half of OBSP or OSH1 and in the central
  20. section of  the  other  proteins. As a signature pattern, we selected the best
  21. conserved part  of  this  domain, a region that contains a perfectly conserved
  22. pentapeptide.
  23.  
  24. -Consensus pattern: E-Q-x-S-H-H-P-P-x-[STAC]-A
  25. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  26. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  27. -Last update: June 1994 / First entry.
  28.  
  29. [ 1] Jiang B., Brown J.L., Sheraton J., Fortin N., Bussey H.
  30.      Yeast 10:341-353(1994).
  31.