home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ BCI NET 2 / BCI NET 2.iso / archives / demos / misc / prosite.lha / Prosite / data / PDOC00768 < prev    next >
Encoding:
Text File  |  1995-03-04  |  1.6 KB  |  38 lines

  1. *******************************************************
  2. * Translationally controlled tumor protein signatures *
  3. *******************************************************
  4.  
  5. The mammalian  translationally  controlled  tumor  protein (TCTP) is a protein
  6. which has  been  found to be  preferentially synthesized in cells of the early
  7. growth phase some type of tumors [1,2],  but which is also expressed in normal
  8. cells.  The physiological  function  of  TCTP  is  still  not  known.  It is a
  9. hydrophilic protein  of  172  amino acid residues. Close homologs of TCTP have
  10. been found in plants [3,4,5] and in yeast [6].
  11.  
  12. As signature patterns for TCTP, we selected two of the best conserved regions.
  13.  
  14. -Consensus pattern: I-G-[GA]-N-[PAG]-S-A-E-G-[PAG]-x(0,1)-[DE]-x-[DE]-x(2)-
  15.                     [DE]
  16. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  17. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  18.  
  19. -Consensus pattern: F-F-x-G-E-x-M-x(2)-D-[GA]-x-[LIVM]
  20. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  21. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  22.  
  23. -Last update: June 1994 / First entry.
  24.  
  25. [ 1] Boehm H., Beendorf R., Gaestel M., Gross B., Nuernberg P., Kraft R.,
  26.      Otto A., Bielka H.
  27.      Biochem. Int. 19:277-286(1989).
  28. [ 2] Makrides S., Chitpatima S.T., Bandyopadhyay R., Brawerman G.
  29.      Nucleic Acids Res. 16:2350-2350(1988).
  30. [ 3] Pay A., Heberle-Bors E., Hirt H.
  31.      Plant Mol. Biol. 19:501-503(1992).
  32. [ 4] Mache R., Quigley F., Thomas F., Yu D.Y.
  33.      EMBL/GenBank: Z18387.
  34. [ 5] Nishi R., Uchimiya H., Kato A.
  35.      EMBL/GenBank: D12626.
  36. [ 6] Rasmussen S.W.
  37.      Yeast In press(1994).
  38.