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Text File  |  1995-03-04  |  1.5 KB  |  35 lines
  1. ***************************************************
  2. * 6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase signatures *
  3. ***************************************************
  4.  
  5. 6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  (EC 4.6.1.10) (PTPS) [1]  catalyzes  the
  6. second step  in  the  biosynthesis  of  tetrahydrobiopterin  (BH4);  a complex
  7. rearrangement of    7,8-dihydroneopterin    triphosphate    into    6-pyruvoyl
  8. tetrahydropterin.
  9.  
  10. PTPS is  a  small  protein  of  about 145 residues.  It forms a homooligomeric
  11. complex composed of two  trimers  assembled  in  a head-to-head fashion.  PTPS
  12. binds a  magnesium  atom  which is liganded by three histidine residues. Three
  13. residues have  been  implicated  in  the  catalytic  mechanism: a cysteine, an
  14. histidine and a glutamate.
  15.  
  16. We have  developed  two  signature  patterns  for  PTPS.  The  first signature
  17. contains the active site cysteine and two of the three magnesium ligands.  The
  18. second signature contains the active site histidine.
  19.  
  20. -Consensus pattern: C-N-N-P-N-G-H-G-H
  21.                     [C is an active site residue]
  22.                     [The two H's are magnesium ligands]
  23. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  24. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  25.  
  26. -Consensus pattern: D-H-K-N-L-D-x-D
  27.                     [H is an active site residue]
  28. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  29. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  30.  
  31. -Last update: June 1994 / First entry.
  32.  
  33. [ 1] Nar H., Huber R., Heizmann C.W., Thoeny B., Buergisser D.
  34.      EMBO J. 13:1255-1262(1994).
  35.