home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ BCI NET 2 / BCI NET 2.iso / archives / demos / misc / prosite.lha / Prosite / data / PDOC00724 < prev    next >
Encoding:
Text File  |  1995-03-04  |  1.2 KB  |  33 lines
  1. ***********************************
  2. * Ribosomal protein L1e signature *
  3. ***********************************
  4.  
  5. A number of eukaryotic  and  archaebacterial ribosomal proteins can be grouped
  6. on the  basis of sequence similarities. One of these families consists [1,2,3,
  7. 4] of:
  8.  
  9.  - Drosophila L1.
  10.  - Human L4.
  11.  - Xenopus L1A and L1B.
  12.  - Yeast L2 (RP2).
  13.  - Schizosaccharomyces pombe L2.
  14.  - Halobacterium marismortui HmaL4 (HL6).
  15.  
  16. These proteins  have  246  (archebacteria)  to  425  (human) amino acids. As a
  17. signature pattern, we selected a highly conserved  region  in  the  N-terminal
  18. part of these proteins.
  19.  
  20. -Consensus pattern: A-G-x(2)-T-x-A-E-S-[FYWQ]-G-[ST]-G-R
  21. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  22. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  23. -Last update: June 1994 / First entry.
  24.  
  25. [ 1] Rafti F., Gargiulo G., Manzi A., Malva C., Graziani F.
  26.      Nucleic Acids Res. 17:456-456(1989).
  27. [ 2] Presutti C., Villa T., Bozzoni I.
  28.      Nucleic Acids Res. 21:3900-3900(1993).
  29. [ 3] Bagni C., Mariottini P., Annesi F., Amaldi F.
  30.      Biochim. Biophys. Acta 1216:475-478(1993).
  31. [ 3] Arndt E., Kroemer W., Hatakeyama T.
  32.      J. Biol. Chem. 265:3034-3039(1990).
  33.