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Text File  |  1995-03-04  |  2.0 KB  |  46 lines
  1. ******************************************
  2. * Glycosyl hydrolases family 8 signature *
  3. ******************************************
  4.  
  5. The microbial degradation  of cellulose and  xylans requires  several types of
  6. enzymes such as endoglucanases (EC 3.2.1.4),  cellobiohydrolases (EC 3.2.1.91)
  7. (exoglucanases), or xylanases (EC 3.2.1.8) [1,2].  Fungi and bacteria produces
  8. a spectrum of cellulolytic  enzymes (cellulases)  and  xylanases which, on the
  9. basis of sequence similarities,  can be classified into families. One of these
  10. families is known as the cellulase family D [3] or as  the glycosyl hydrolases
  11. family 8 [4].   The enzymes which are currently known to belong to this family
  12. are listed below.
  13.  
  14.  - Bacillus strain KSM-330 acidic endonuclease K (Endo-K).
  15.  - Cellulomonas uda endoglucanase.
  16.  - Clostridium thermocellum endoglucanases A (celA).
  17.  - Erwinia chrysanthemi minor endoglucanase y (celY).
  18.  - Bacillus circulans beta-glucanase (EC 3.2.1.73).
  19.  
  20. The most conserved region in  these enzymes is  a stretch of about 20 residues
  21. that contains two conserved aspartate and a tryptophan.  Tryptophan  has  been
  22. shown [5], in Endo-K, to be important for the catalytic activity. We have used
  23. this region as a signature pattern.
  24.  
  25. -Consensus pattern: A-[ST]-D-[AG]-D-x(2)-I-A-x-[SA]-[LIVM](2)-x-A-x(3)-W
  26. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  27. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  28.  
  29. -Expert(s) to contact by email: Beguin P.
  30.                                 phycel@pasteur.bitnet
  31.                                 Henrissat B.
  32.                                 bernie@cermav.grenet.fr
  33.  
  34. -Last update: October 1993 / First entry.
  35.  
  36. [ 1] Beguin P.
  37.      Annu. Rev. Microbiol. 44:219-248(1990).
  38. [ 2] Gilkes N.R., Henrissat B., Kilburn D.G., Miller R.C. Jr., Warren R.A.J.
  39.      Microbiol. Rev. 55:303-315(1991).
  40. [ 3] Henrissat B., Claeyssens M., Tomme P., Lemesle L., Mornon J.P.
  41.      Gene 81:83-95(1991).
  42. [ 4] Henrissat B.
  43.      Biochem. J. 280:309-316(1991).
  44. [ 5] Ozaki K., Ito S.
  45.      J. Gen. Microbiol. 137:41-48(1991).
  46.