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Text File  |  1995-03-04  |  1.7 KB  |  37 lines
  1. **********************************
  2. * Chorismate synthase signatures *
  3. **********************************
  4.  
  5. Chorismate synthase (EC 4.6.1.4) catalyzes  the last of the seven steps in the
  6. shikimate pathway  which  is  used  in  prokaryotes, fungi, and plants for the
  7. biosynthesis of aromatic amino acids.  Chorismate  synthase catalyzes the 1,4-
  8. trans  elimination  of  the  phosphate  group  from  5-enolpyruvylshikimate-3-
  9. phosphate (EPSP) to form chorismate which can then be used in the biosynthesis
  10. of phenylalanine, tyrosine, or tryptophan.  Chorismate  synthase  requires the
  11. presence of a reduced flavin mononucleotide (FMNH2 or FADH2) for its activity.
  12.  
  13. Chorismate synthase from various sources shows [1,2] a high degree of sequence
  14. conservation; it is a protein of about 360 to 400 amino acid residues. We have
  15. developed  three  signature patterns  from  conserved  regions  rich  in basic
  16. residues (mostly arginines).  The  first pattern  is located in the N-terminal
  17. section, the second one is central, and the third one is C-terminal.
  18.  
  19. -Consensus pattern: [DE]-[LIVM]-Q-x(2)-L-x-R(3)-P-G-x-S-[KR]
  20. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  21. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  22.  
  23. -Consensus pattern: G(3)-R-[SA](3)-R-E-T
  24. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  25. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  26.  
  27. -Consensus pattern: G-R-H-D-P-x-V-x(2)-R-A-[LIVM]-P
  28. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  29. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  30.  
  31. -Last update: December 1992 / First entry.
  32.  
  33. [ 1] Schaller A., Schmid J., Leibinger U., Amrhein N.
  34.      J. Biol. Chem. 266:21434-21438(1991).
  35. [ 2] Jones D.G.L., Reusser U., Braus G.H.
  36.      Mol. Microbiol. 5:2143-2152(1991).
  37.