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Text File  |  1995-03-04  |  1.3 KB  |  29 lines
  1. ****************************************************
  2. * F-actin capping protein alpha subunit signatures *
  3. ****************************************************
  4.  
  5. The F-actin capping protein binds in  a calcium-independent manner to the fast
  6. growing ends of  actin filaments (barbed end) thereby blocking the exchange of
  7. subunits at these ends.   Unlike  gelsolin  and  severin this protein does not
  8. sever actin filaments.  The  F-actin capping protein is a heterodimer composed
  9. of two unrelated subunits: alpha and beta.
  10.  
  11. The alpha subunit is a protein of about 268 to 286  amino  acid residues whose
  12. sequence is well conserved in eukaryotic species [1].   As  signature patterns
  13. we  selected  two highly  conserved regions in the C-terminal section  of  the
  14. alpha subunit.
  15.  
  16. -Consensus pattern: V-H-[FY](2)-E-D-G-N-V
  17. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  18. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  19.  
  20. -Consensus pattern: F-K-A-L-R-R-x-L-P
  21. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  22. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  23.  
  24. -Last update: December 1992 / First entry.
  25.  
  26. [ 1] Cooper J.A., Caldwell J.E., Gattermeir D.J., Torres M.A., Amatruda J.F.,
  27.      Casella J.F.
  28.      Cell Motil. Cytoskeleton 18:204-214(1991).
  29.