home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ BCI NET 2 / BCI NET 2.iso / archives / demos / misc / prosite.lha / Prosite / data / PDOC00605 < prev    next >
Encoding:
Text File  |  1995-03-04  |  2.6 KB  |  53 lines
  1. **********************************************************************
  2. * Guanine-nucleotide dissociation stimulators CDC24 family signature *
  3. **********************************************************************
  4.  
  5. Ras proteins are membrane-associated molecular switches that  bind GTP and GDP
  6. and  slowly  hydrolyze  GTP to GDP [1].  The  balance  between  the  GTP bound
  7. (active) and GDP bound (inactive) states  is regulated  by the opposite action
  8. of proteins activating the GTPase activity and that of  proteins which promote
  9. the loss of bound GDP and the uptake of fresh GTP [2,3].  The latter  proteins
  10. are known  as  guanine-nucleotide dissociation stimulators (GDSs)  (or also as
  11. guanine-nucleotide releasing (or exchange) factors (GRFs)).  Proteins that act
  12. as GDS can be classified  into at least two families, on the basis of sequence
  13. similarities.  One of  these families is currently known to group the proteins
  14. listed below   (references   are   only    provided  for  recently  determined
  15. sequences):
  16.  
  17.  - CDC24 from yeast. CDC24 is a GDS that acts on the ras-like protein CDC42.
  18.  - Dbl (or mcf-2) oncogene from mammals.  Dbl is a GDS for a  ras-like protein
  19.    known as G25K or CDC42Hs.
  20.  - p140-RAS GRF (cdc25Mm) from mammals. This protein, a GDS for ras, possesses
  21.    both a domain belonging to the CDC24 family  and one belonging to the CDC25
  22.    family.
  23.  - Bcr oncogene from mammals. Bcr can form a chimera  with the abl protein and
  24.    then cause chronic myelogenous leukemia (CML). The target of bcr is not yet
  25.    known.
  26.  - Oncogene vav from mammals. The target of this protein is not yet known.
  27.  - Oncogene ect2 from mouse [4]. The target of this protein is not yet known.
  28.  
  29. The size of  these  proteins range from 736 residues (CDC42)  to 1271 residues
  30. (bcr). The sequence  similarity shared  by  all these proteins is limited to a
  31. region of  about  180  amino  acids,  generally located in their N-terminal or
  32. central section.  As  a signature pattern, we selected the most conserved part
  33. of this domain.
  34.  
  35. -Consensus pattern: L-x(2)-[LIVMFYW]-L-x(2)-P-[LIVM]-x(2)-[LIVM]-x-[KRS]-x(2)-
  36.                     L-x-[LIVM]-x-[DE]-[LIVM]-x(3)-[ST]
  37. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  38. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  39.  
  40. -Expert(s) to contact by email: Boguski M.S.
  41.                                 boguski@ncbi.nlm.nih.gov
  42.  
  43. -Last update: June 1994 / Text revised.
  44.  
  45. [ 1] Bourne H.R., Sanders D.A., McCormick F.
  46.      Nature 349:117-127(1991).
  47. [ 2] Boguski M.S., McCormick F.
  48.      Nature 366:643-654(1993).
  49. [ 3] Downward J.
  50.      Curr. Biol. 2:329-331(1992).
  51. [ 4] Miki T., Smith C.L., Long J.E., Eva A., Fleming T.P.
  52.      Nature 362:462-465(1993).
  53.