home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ BCI NET 2 / BCI NET 2.iso / archives / demos / misc / prosite.lha / Prosite / data / PDOC00558 < prev    next >
Encoding:
Text File  |  1995-03-04  |  1.3 KB  |  29 lines
  1. ********************************************************
  2. * Bacterial Ribonuclease P protein component signature *
  3. ********************************************************
  4.  
  5. Ribonuclease P (EC 3.1.26.5) (RNase P) [1,2,3] is a site specific endonuclease
  6. that generates  mature tRNAs by  cleaving-off  the  leader sequences  at their
  7. 5'ends. In bacteria RNase P is known to be composed of two components: a large
  8. (about 400 base pairs) RNA (gene rnpB) and  a small  protein (119 to 133 amino
  9. acids) (gene rnpA).  The RNA moiety of RNase P carries the catalytic activity;
  10. the function of the protein component  is not yet clear although it may act as
  11. an electrostatic screen  allowing  the  highly  negatively charged RNA enzyme-
  12. substrate complex to fold into the catalytic conformation.
  13.  
  14. The sequence of rnpA is not highly conserved, however there is, in the central
  15. part of  the  protein,  a conserved  region.  We  have  used  this region as a
  16. signature pattern.
  17.  
  18. -Consensus pattern: A-x(2)-R-N-x-[LIVM]-K-R-x(2)-R
  19. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  20. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  21. -Last update: June 1992 / First entry.
  22.  
  23. [ 1] Pace N.R., Smith D.
  24.      J. Biol. Chem. 265:3587-3590(1990).
  25. [ 2] Altman S.
  26.      J. Biol. Chem. 265:20053-20056(1990).
  27. [ 3] Brown J.W., Pace N.R.
  28.      Nucleic Acids Res. 20:1451-1456(1992).
  29.