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Text File  |  1995-03-04  |  1.4 KB  |  30 lines
  1. *************************************
  2. * Thymidine phosphorylase signature *
  3. *************************************
  4.  
  5. Thymidine phosphorylase (EC 2.4.2.4) catalyzes  the  reversible phosphorolysis
  6. of thymidine, deoxyuridine and  their  analogues to their respective bases and
  7. 2-deoxyribose 1-phosphate. This enzyme regulates the availability of thymidine
  8. and is therefore essential to nucleic acid metabolism.
  9.  
  10. In Escherichia coli (gene deoA)  the  enzyme  is a dimer of identical subunits
  11. of about 48 Kd [1]; in Human it  has first been identified as platelet-derived
  12. endothelial  cell  growth  factor (PD-ECGF)  before  being  recognized  [2] as
  13. thymidine phosphorylase.
  14.  
  15. The similarity between the sequences of the bacterial and the mammalian enzyme
  16. is very high. As a signature pattern we selected a perfectly conserved stretch
  17. of 24 residues located in the N-terminal part of these proteins.
  18.  
  19. -Consensus pattern: P-M-I-S-G-R-G-L-G-H-T-G-G-T-L-D-K-L-E-S-I-P-G-F
  20. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  21. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  22. -Last update: June 1992 / First entry.
  23.  
  24. [ 1] Walter M.R., Cook W.J., Cole L.B., Short S.A., Koszalka G.W.,
  25.      Krenitsky T.A., Ealick S.E.
  26.      J. Biol. Chem. 265:14016-14022(1990).
  27. [ 2] Furukawa T., Yoshimura A., Sumizawa T., Haraguchi M., Akiyama S.-I.,
  28.      Fukui K., Yamada Y.
  29.      Nature 356:668-668(1992).
  30.