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Text File  |  1995-03-04  |  2.1 KB  |  38 lines
  1. ******************************************************************
  2. * Aminotransferases class-II pyridoxal-phosphate attachment site *
  3. ******************************************************************
  4.  
  5. Aminotransferases  share certain mechanistic features with   other  pyridoxal-
  6. phosphate dependent enzymes, such as  the  covalent  binding of the pyridoxal-
  7. phosphate group  to  a  lysine  residue.  On the basis of sequence similarity,
  8. these various  enzymes  can  be  grouped [1]  into subfamilies.  One of these,
  9. called class-II, currently consists of the following enzymes:
  10.  
  11.  - Glycine  acetyltransferase (EC 2.3.1.29), which  catalyzes the addition  of
  12.    acetyl-CoA to glycine to form 2-amino-3-oxobutanoate (gene kbl).
  13.  - 5-aminolevulinic acid  synthase (EC 2.3.1.37) (delta-ALA  synthase),  which
  14.    catalyzes the  first  step  in  heme  biosynthesis  via  the Shemin (or C4)
  15.    pathway, i.e.   the   addition  of  succinyl-CoA  to  glycine  to  form  5-
  16.    aminolevulinate.
  17.  - 8-amino-7-oxononanoate   synthase   (EC 2.3.1.47)    (7-KAP synthetase),  a
  18.    bacterial enzyme (gene bioF) which  catalyzes an  intermediate  step in the
  19.    biosynthesis of biotin:  the addition  of 6-carboxy-hexanoyl-CoA to alanine
  20.    to form 8-amino-7-oxononanoate.
  21.  - Histidinol-phosphate  aminotransferase (EC 2.6.1.9),  which  catalyzes  the
  22.    eighth step in histidine  biosynthetic  pathway:  the  transfer of an amino
  23.    group from 3-(imidazol-4-yl)-2-oxopropyl phosphate to glutamic acid to form
  24.    histidinol phosphate and 2-oxoglutarate.
  25.  
  26. The sequence around the pyridoxal-phosphate  attachment site  of this class of
  27. enzyme is sufficiently conserved to allow the creation of a specific pattern.
  28.  
  29. -Consensus pattern: T-[LIVMFYW]-[SAG]-K-[SAG]-[LIVMFYW]-[GA]-x(2)-[SAG]
  30.                     [K is the pyridoxal-P attachment site]
  31. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL,  except
  32.  for Lactococcus lactis histidinol-phosphate aminotransferase.
  33. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: 8.
  34. -Last update: October 1993 / Text revised.
  35.  
  36. [ 1] Bairoch A.
  37.      Unpublished observations (1991).
  38.