home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ BCI NET 2 / BCI NET 2.iso / archives / demos / misc / prosite.lha / Prosite / data / PDOC00500 < prev    next >
Encoding:
Text File  |  1995-03-04  |  1.5 KB  |  41 lines
  1. ***********************************
  2. * Ribosomal protein S6e signature *
  3. ***********************************
  4.  
  5. A number of eukaryotic  and  archaebacterial ribosomal proteins can be grouped
  6. on the basis of sequence similarities. One of these families consists of:
  7.  
  8.  - Mammalian S6 [1].
  9.  - Drosophila S6 [2].
  10.  - Plant S6 [3].
  11.  - Yeast S10 (YS4).
  12.  - Halobacterium marismortui HS13 [4].
  13.  
  14. S6 is  the major substrate of protein kinases in eukaryotic ribosomes [5];  it
  15. may have  an  important  role  in  controlling  cell growth  and proliferation
  16. through the selective translation of particular classes of mRNA.
  17.  
  18. These proteins  have  135  to  249  amino  acids.  As  a signature pattern, we
  19. selected a conserved  stretch  of 12 residues  in the N-terminal part of these
  20. proteins.
  21.  
  22. -Consensus pattern: [LIVM]-[STAM]-G-G-x-D-x(2)-G-x-P-M
  23. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  24. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  25.  
  26. -Expert(s) to contact by email: Thomas G.
  27.                                 gthomas@fmi.ch
  28.  
  29. -Last update: June 1994 / Text revised.
  30.  
  31. [ 1] Franco R., Rosenfeld M.G.
  32.      J. Biol. Chem. 265:4321-4325(1990).
  33. [ 2] Watson K.L., Konrad K.D., Woods D.F., Bryant P.J.
  34.      Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 89:11302-11306(1992).
  35. [ 3] Hansen G., Estruch J.J., Spena A.
  36.      Nucleic Acids Res. 20:5230-5230(1992).
  37. [ 4] Kimura M., Arndt E., Hatakeyama T., Hatakeyama T., Kimura J.
  38.      Can. J. Microbiol. 35:195-199(1989).
  39. [ 5] Bandi H.R., Ferrari S., Krieg J., Meyer H.E., Thomas G.
  40.      J. Biol. Chem. 268:4530-4533(1993).
  41.