home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ BCI NET 2 / BCI NET 2.iso / archives / demos / misc / prosite.lha / Prosite / data / PDOC00487 < prev    next >
Encoding:
Text File  |  1995-03-04  |  1.5 KB  |  34 lines
  1. *****************************
  2. * Stathmin family signature *
  3. *****************************
  4.  
  5. Stathmin [1] (from the Greek 'stathmos' which means relay),  is an  ubiquitous
  6. intracellular protein, present in a variety  of phosphorylated forms and which
  7. serves  as a relay for diverse second  messenger pathways.  Its expression and
  8. phosphorylation  are  regulated  throughout  development  and in  response  to
  9. extracellular  signals  regulating  cell  proliferation,  differentiation  and
  10. function.
  11.  
  12. Stathmin  is  a  highly   conserved  protein  of  149  amino  acid   residues.
  13. Structurally, it  consists  of  an  N-terminal  domain  of  about  45 residues
  14. followed by  a  78  residue alpha-helical domain consisting of a heptad repeat
  15. coiled coil structure and a C-terminal domain of 25 residues.
  16.  
  17. Rat protein SCG10 is a  neuron-specific,  membrane-associated   protein   that
  18. accumulates in the growth cones of developing neurons. It is highly similar in
  19. its sequence  to  stathmin,  but  differs in that it contains an additional N-
  20. terminal hydrophobic  segment of 32 residues which is probably responsible for
  21. its interaction with membranes.
  22.  
  23. As a signature  for  stathmin and SCG10,  we selected  a  perfectly  conserved
  24. decapeptide  which ends  with  the  first  three  residues of  the coiled coil
  25. domain.
  26.  
  27. -Consensus pattern: P-K-K-K-D-L-S-L-E-E
  28. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  29. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  30. -Last update: June 1992 / Text revised.
  31.  
  32. [ 1] Sobel A.
  33.      Trends Biochem. Sci. 16:301-305(1991).
  34.