home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ BCI NET 2 / BCI NET 2.iso / archives / demos / misc / prosite.lha / Prosite / data / PDOC00483 < prev    next >
Encoding:
Text File  |  1995-03-04  |  1.4 KB  |  33 lines
  1. ********************************************
  2. * Eukaryotic mitochondrial porin signature *
  3. ********************************************
  4.  
  5. The major  protein  of the outer  mitochondrial  membrane  of  eukaryotes is a
  6. porin  that  forms a  voltage-dependent  anion-selective  channel (VDAC)  that
  7. behaves as a general diffusion pore for  small  hydrophilic molecules [1,2,3].
  8. The channel adopts an open conformation at low  or zero membrane potential and
  9. a closed conformation at potentials above 30-40 mV.
  10.  
  11. This protein contains about 280 amino acids and its sequence is well conserved
  12. from fungi to mammals.   As a signature pattern we selected a conserved region
  13. that spans positions 58 to 82.
  14.  
  15. -Consensus pattern: E-x-K-x(6)-G-L-x(2)-T-x(2)-W-x(3)-N-x-L-x-T
  16. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  17. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  18.  
  19. -Note: slime  mold mitochondria porin [4], while  functionally similar, is not
  20.  significantly related to this family of porins.
  21.  
  22. -Last update: October 1993 / Text revised.
  23.  
  24. [ 1] Manella C.A.
  25.      Trends Biochem. Sci. 17:315-320(1992).
  26. [ 2] Dihanich M.
  27.      Experientia 46:146-153(1990).
  28. [ 3] Forte M., Guy H.R., Mannella C.A.
  29.      J. Bioenerg. Biomembr. 19:341-350(1987).
  30. [ 4] Troll H., Malchow D., Muller-Taubenberger A., Humbel B., Lottspeich F.,
  31.      Ecke M., Gerisch G., Schmid A., Benz R.
  32.      J. Biol. Chem. 267:21072-21079(1992).
  33.