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Text File  |  1995-03-04  |  1.4 KB  |  27 lines
  1. ******************************************
  2. * Nuclear transition protein 1 signature *
  3. ******************************************
  4.  
  5. In mammals, the second  stage  of  spermatogenesis  is  characterized  by  the
  6. conversion of  nucleosomal  chromatin   to  the  compact,  nonnucleosomal  and
  7. transcriptionally inactive form found in the sperm nucleus.  This condensation
  8. is  associated  with  a  double-protein  transition.   The  first   transition
  9. corresponds to the  replacement  of  histones  by  several  spermatid-specific
  10. proteins (also called transition proteins) which  are  themselves  replaced by
  11. protamines during the second transition.
  12.  
  13. Nuclear transition protein 1  (TP1) [1] is  one  of  these  spermatid-specific
  14. proteins.  TP1 is a basic protein of 54 amino-acid residues  whose sequence is
  15. well conserved in mammalian species.   As  a signature  pattern, we selected a
  16. heptapeptide located in positions 28 to 34.   This  heptapeptide contains five
  17. basic residues (Arg or Lys) as well as a  tyrosine that could be essential for
  18. the destabilization of chromatin by intercalating between the bases of DNA.
  19.  
  20. -Consensus pattern: S-K-R-K-Y-R-K
  21. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  22. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  23. -Last update: December 1991 / First entry.
  24.  
  25. [ 1] Chirat F., Martinage A., Briand G., Kouach M., van Dorsselaer A., Loir M.
  26.      Eur. J. Biochem. 198:13-20(1991).
  27.