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Text File  |  1995-03-04  |  1.2 KB  |  24 lines

  1. ***************************************************
  2. * Porphobilinogen deaminase cofactor-binding site *
  3. ***************************************************
  4.  
  5. Porphobilinogen deaminase (EC 4.3.1.8), or hydroxymethylbilane synthase, is an
  6. enzyme involved in the biosynthesis of porphyrins and related macrocycles.  It
  7. catalyzes the assembly of  four  porphobilinogen (PBG) units in a head to tail
  8. fashion to form hydroxymethylbilane.
  9.  
  10. The enzyme covalently  binds  a  dipyrromethane  cofactor  to  which  the  PBG
  11. subunits are added in a stepwise fashion. In the Escherichia coli enzyme (gene
  12. hemC), this  cofactor  has  been shown [1] to be bound by the sulfur atom of a
  13. cysteine. The  region  around  this  cysteine  is conserved in porphobilinogen
  14. deaminases from various prokaryotic and eukaryotic sources.
  15.  
  16. -Consensus pattern: E-R-x-[LIVMF]-x(3)-[LIVM]-x-G-[GSA]-C-x-V-P-[LIVM]-[GSA]
  17.                     [C is the cofactor attachment site]
  18. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  19. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  20. -Last update: June 1994 / Pattern and text revised.
  21.  
  22. [ 1] Miller A.D., Hart G.J., Packman L.C., Battersby A.R.
  23.      Biochem. J. 254:915-918(1988).
  24.