home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ BCI NET 2 / BCI NET 2.iso / archives / demos / misc / prosite.lha / Prosite / data / PDOC00437 < prev    next >
Encoding:
Text File  |  1995-03-04  |  1.6 KB  |  34 lines
  1. ********************************************************
  2. * Pathogenesis-related proteins BetvI family signature *
  3. ********************************************************
  4.  
  5. A number of plant proteins, which  all seem to be involved in pathogen defense
  6. response, are structurally related [1,2,3]. These proteins are:
  7.  
  8.  - Asparagus wound-induced protein AoPR1.
  9.  - Kidney bean pathogenesis-related proteins 1 and 2.
  10.  - Parsley pathogenesis-related proteins PR1-1 and PR1-3.
  11.  - Pea disease resistance response proteins pI49 and pI176.
  12.  - Potato pathogenesis-related proteins STH-2 and STH-21.
  13.  - Soybean stress-induced protein SAM22.
  14.  - Bet  v  I,  the major pollen allergen from white birch. Bet v I is the main
  15.    cause of type I allergic reactions in Europe, North America and USSR.
  16.  
  17. These proteins  are  thought  to be intracellularly located. They contain from
  18. 155 to  160  amino  acid  residues.  As  a  signature  pattern,  we selected a
  19. conserved region located in the third quarter of these proteins.
  20.  
  21. -Consensus pattern: G-x(2)-[LIVMF]-x(4)-E-x(2)-[STN]-x(8,9)-[ND]-G-G-[CS]-
  22.                     x(2)-K-x(4)-[FY]
  23. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  24. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  25. -Last update: June 1994 / Pattern and text revised.
  26.  
  27. [ 1] Breiteneder H., Pettenburger K., Bito A., Valenta R., Kraft D.,
  28.      Rumpold H., Scheiner O., Breitenbach M.
  29.      EMBO J. 8:1935-1938(1989).
  30. [ 2] Crowell D., John M.E., Russell D., Amasino R.M.
  31.      Plant Mol. Biol. 18:459-466(1992).
  32. [ 3] Warner S.A.J., Scott R., Draper J.
  33.      Plant Mol. Biol. 19:555-561(1992).
  34.