home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ BCI NET 2 / BCI NET 2.iso / archives / demos / misc / prosite.lha / Prosite / data / PDOC00422 < prev    next >
Encoding:
Text File  |  1995-03-04  |  1.3 KB  |  29 lines
  1. ******************************
  2. * Citrate synthase signature *
  3. ******************************
  4.  
  5. Citrate synthase (EC 4.1.3.7) (CS) is the tricarboxylic acid cycle enzyme that
  6. catalyzes the  synthesis of citrate  from  oxaloacetate  and acetyl-CoA  in an
  7. aldol condensation.  CS can directly form  a carbon-carbon bond in the absence
  8. of metal ion cofactors.
  9.  
  10. In prokaryotes, citrate synthase is  composed of six  identical  subunits.  In
  11. eukaryotes, there are two isozymes of citrate synthase: one is found    in the
  12. mitochondrial matrix,       the  second     is cytoplasmic. Both          seem
  13. to be dimers of identical chains.
  14.  
  15. There are a number of  regions of sequence  similarity between prokaryotic and
  16. eukaryotic citrate  synthases.  One of the best conserved contains a histidine
  17. which is  one  of  three  residues  shown  [1] to be involved in the catalytic
  18. mechanism of  the  vertebrate  mitochondrial  enzyme. We used this region as a
  19. signature pattern.
  20.  
  21. -Consensus pattern: G-[FY]-[GA]-H-x-V-x(1,2)-[RK]-x(2)-D-[PS]-R
  22.                     [H is an active site residue]
  23. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  24. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  25. -Last update: June 1994 / Pattern and text revised.
  26.  
  27. [ 1] Karpusas M., Branchaud B., Remington S.J.
  28.      Biochemistry 29:2213-2219(1990).
  29.