home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ BCI NET 2 / BCI NET 2.iso / archives / demos / misc / prosite.lha / Prosite / data / PDOC00384 < prev    next >
Encoding:
Text File  |  1995-03-04  |  1.2 KB  |  34 lines
  1. **********************************
  2. * Ribosomal protein L2 signature *
  3. **********************************
  4.  
  5. Ribosomal protein L2  is one of the proteins from the large ribosomal subunit.
  6. In Escherichia  coli,  L2  is  known  to  bind  to  the  23S  rRNA and to have
  7. peptidyltransferase activity.  It  belongs  to a family  of ribosomal proteins
  8. which, on the basis of sequence similarities [1,2], groups:
  9.  
  10.  - Eubacterial L2.
  11.  - Archaebacterial L2.
  12.  - Algal and plant chloroplast L2.
  13.  - Cyanelle L2.
  14.  - Plant L2.
  15.  - Slime mold L2.
  16.  - Marchantia polymorpha mitochondrial L2.
  17.  - Paramecium tetraurelia mitochondrial L2.
  18.  - Fission yeast K5, K37 and KD4.
  19.  - Yeast YL6.
  20.  - Mammalian L8.
  21.  
  22. As a  signature  pattern, we selected the best conserved region located in the
  23. C-terminal section of these proteins.
  24.  
  25. -Consensus pattern: P-x(2)-R-G-[STAIV](2)-x-N-[AP]-x-[DE]
  26. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  27. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  28. -Last update: June 1994 / Pattern and text revised.
  29.  
  30. [ 1] Marty I., Meyer Y.
  31.      Nucleic Acids Res. 20:1517-1522(1992).
  32. [ 2] Otaka E., Hashimoto T., Mizuta K., Suzuki K.
  33.      Protein Seq. Data Anal. 5:301-313(1993).
  34.