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Text File  |  1995-03-04  |  1.6 KB  |  35 lines
  1. *************************************
  2. * LBP / BPI / CETP family signature *
  3. *************************************
  4.  
  5. A family of serum  glycoproteins that binds to lipids has  recently [1,2] been
  6. recognized. This family groups together:
  7.  
  8.  - Lipopolysaccharide-binding protein (LBP).  LBP binds to the lipid A  moiety
  9.    of bacterial lipopolysaccharides (LPS), a glycolipid present  in  the outer
  10.    membrane of  all  gram-negative bacteria.  The  LBP/LPS  complex  seems  to
  11.    interact with the CD14 receptor and may be responsible for the secretion of
  12.    alpha-TNF.
  13.  - Bactericidal permeability-increasing protein (BPI). Like LBP, BPI binds LPS
  14.    and has a cytotoxic activity on gram-negative bacteria.
  15.  - Cholesteryl ester transfer protein (CETP). CETP is involved in the transfer
  16.    of insoluble cholesteryl esters in reverse cholesterol transport.
  17.  
  18. These proteins are structurally related  and  share  many  regions of sequence
  19. similarities.  As a signature pattern  we  have selected one of these regions,
  20. which is located in  the N-terminal  section of these proteins; a region which
  21. could be involved in the binding to the lipids [2].
  22.  
  23. -Consensus pattern: G-[LIVM](2)-x-R-I-[ST]-x(3)-L-x(5)-[EQ]-x(4)-[LIVM]-Q-
  24.                     x(8)-P
  25. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  26. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  27. -Last update: May 1991 / Text revised.
  28.  
  29. [ 1] Schumann R.R., Leong S.R., Flaggs G.W., Gray P.W., Wright S.D.,
  30.      Mathison J.C., Tobias P.S., Ulevitch R.J.
  31.      Science 249:1429-1431(1990).
  32. [ 2] Gray P.W., Flaggs G., Leong S.R., Gumina R.J., Weiss J., Ooi C.E.,
  33.      Elsbach P.
  34.      J. Biol. Chem. 264:9505-9509(1989).
  35.