home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ BCI NET 2 / BCI NET 2.iso / archives / demos / misc / prosite.lha / Prosite / data / PDOC00355 < prev    next >
Encoding:
Text File  |  1995-03-04  |  1.6 KB  |  38 lines

  1. ***************************************************
  2. * Small hydrophilic plant seed proteins signature *
  3. ***************************************************
  4.  
  5. The following small hydrophilic plant seed proteins are structurally related:
  6.  
  7.  - Radish late seed maturation protein p8B6 [1].
  8.  - Wheat Em protein [2].
  9.  - Cotton late embryogenesis abundant (LEA) protein D-19 [3].
  10.  - Carrot EMB-1 protein [4].
  11.  - Barley LEA proteins B19.1, B19.3 and B19.4 [5].
  12.  
  13. These proteins contains from 83 to 153 amino acid residues and may play a role
  14. in equipping  the  seed for survival, maintaining a minimal level of hydration
  15. in the dry organism and preventing the denaturation of cytoplasmic components.
  16. They may also play a role during imbibition  by  controlling water uptake.
  17.  
  18. As a signature pattern, we  selected the best conserved region in the sequence
  19. of these proteins,  it is a glycine-rich nonapeptide located in the N-terminal
  20. section.
  21.  
  22. -Consensus pattern: G-[EQ]-T-V-V-P-G-G-T
  23. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  24. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  25. -Last update: June 1994 / Pattern and text revised.
  26.  
  27. [ 1] Raynal M., Depigny D., Cooke R., Delseny M.
  28.      Plant Physiol. 91:829-836(1989).
  29. [ 2] Litts J.C., Colewell G.W., Chakerian R.L., Quatrano R.S.
  30.      Nucleic Acids Res. 15:3607-3618(1987).
  31. [ 3] Baker J., Steele C., Dure L. III
  32.      Plant Mol. Biol. 11:277-291(1988).
  33. [ 4] Ulrich T.U., Wurtele E.S., Nikolau B.J.
  34.      Nucleic Acids Res. 18:2826-2826(1990).
  35. [ 5] Espelund M., Saeboe-Larssen S., Hughes D.W., Galau G.A., Larsen F.,
  36.      Jakobsen K.S.
  37.      Plant J. 2:241-252(1992).
  38.