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Text File  |  1995-03-04  |  1.5 KB  |  30 lines
  1. ***********************************************
  2. * Seminal vesicle protein I repeats signature *
  3. ***********************************************
  4.  
  5. Seminal vesicle  protein  I (SVP-1)  [1]  is one  of  the four major secretory
  6. proteins secreted by guinea-pig seminal vesicle epithelium.   It is a clotting
  7. protein that serves as the substrate in the  formation of the copulatory plug.
  8. Covalent  clotting of this  protein  is catalyzed  by a  transglutaminase  and
  9. involves   the formation of  gamma-glutamyl-epsilon-lysine crosslinks.   SVP-1
  10. sequence contains eight  repeats of a  twenty four amino acid  residue domain.
  11. There are seven  invariant  residues  in these  repeats,  three  of  them (two
  12. lysines  and  one glutamine)  probably  participate  in  the cross-links.  The
  13. pattern we have  developed comprises  positions  1 to  19 of  the  domain  and
  14. includes the three cross-linking residues.
  15.  
  16. This pattern  is  also  present  twice [2] in  the  N-terminal  region  of the
  17. precursor of human skin elafin, an inhibitor of elastase.
  18.  
  19. -Consensus pattern: [IVM]-x-G-Q-D-x-V-K-x(5)-[KN]-G-x(3)-[STLV]
  20.                     [Q and K are involved in covalent cross-links]
  21. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  22. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  23. -Last update: October 1993 / Pattern and text revised.
  24.  
  25. [ 1] Moore J.T., Hagstrom J., McCormick D.J., Harvey S., Madden B.,
  26.      Holicky E., Stanford D.R., Wieben E.D.
  27.      Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 84:6712-6714(1987).
  28. [ 2] Bairoch A.
  29.      Unpublished observations (1993).
  30.