home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ BCI NET 2 / BCI NET 2.iso / archives / demos / misc / prosite.lha / Prosite / data / PDOC00255 < prev    next >
Encoding:
Text File  |  1995-03-04  |  2.7 KB  |  57 lines
  1. ***************************************************************************
  2. * Soybean trypsin inhibitor (Kunitz) protease inhibitors family signature *
  3. ***************************************************************************
  4.  
  5. The soybean trypsin  inhibitor (Kunitz)  family  [1]  is one  of  the numerous
  6. families of serine proteinase inhibitors.  This family  is  currently known to
  7. group the following proteins:
  8.  
  9.  - Trypsin inhibitors A, B, C, KTI1, and KTI2 from soybean.
  10.  - Trypsin inhibitor DE3 from coral beans (Erythrina sp.).
  11.  - Trypsin inhibitor DE5 from sandal bead tree.
  12.  - Trypsin inhibitors 1A (WTI-1A), 1B (WTI-1B), and 2 (WTI-2) from goa bean.
  13.  - Trypsin inhibitor from Acacia confusa.
  14.  - Trypsin inhibitor from silk tree.
  15.  - Chymotrypsin inhibitor 3 (WCI-3) from goa bean.
  16.  - Cathepsin D  inhibitors  PDI  and  NDI from  potato [2], which inhibit both
  17.    cathepsin D (aspartic protease) and trypsin.
  18.  - Alpha-amylase/subtilisin inhibitors from barley and wheat.
  19.  - Albumin-1 (WBA-1) from goa bean seeds [3].
  20.  - Miraculin from Richadella dulcifica [4], a sweet taste protein.
  21.  - Sporamin from sweet potato [5], the major tuberous root protein.
  22.  - Potato tuber protein P340 [6].
  23.  - Wound responsive protein gwin3 from poplar tree [7].
  24.  - 21 kd seed protein from cocoa [8].
  25.  
  26. All these proteins contain from 170 to 200 amino acid residues  and one or two
  27. intrachain disulfide  bonds.  The  best  conserved region is found in their N-
  28. terminal section and is used as a signature pattern.
  29.  
  30. -Consensus pattern: [LIVM]-x-D-x-[EDNTY]-[DG]-[RKHDENQ]-x-[LIVM]-x(5)-Y-x-
  31.                     [LIVM]
  32. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL,  except
  33.  for potato tuber protein P340.
  34. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: 8  RuBisCO   small  chains   and  a
  35.  chloroplast hypothetical protein from Oenothera bertiana.
  36. -Last update: October 1993 / Text revised.
  37.  
  38. [ 1] Laskowski M., Kato I.
  39.      Annu. Rev. Biochem. 49:593-626(1980).
  40. [ 2] Ritonja A., Krizaj I., Mesko P., Kopitar M., Lucovnik P., Strukelj B.,
  41.      Pungercar J., Buttle D.J., Barret A.J., Turk V.
  42.      FEBS Lett. 267:13-15(1990).
  43. [ 3] Kortt A.A., Strike P.M., de Jersey J.
  44.      Eur. J. Biochem. 181:403-408(1989).
  45. [ 4] Theerasilp S., Hitotsuya H., Nakajo S., Nakaja K., Nakamura Y.,
  46.      Kurihara Y.
  47.      J. Biol. Chem. 264:6655-6659(1989).
  48. [ 5] Hattori T., Yoshida N., Nakamura K.
  49.      Plant Mol. Biol. 13:563-572(1989).
  50. [ 6] Stiekema W.J., Heidekamp F., Dirkse W.G., van Beckum J., de Haan P.,
  51.      Ten Bosch C., Louwerse J.D.
  52.      Plant Mol. Biol. 11:255-269(1988).
  53. [ 7] Bradshaw H.D., Hollick J.B., Parsons T.J., Clarke H.R.G., Gordon M.P.
  54.      Plant Mol. Biol. 14:51-59(1989).
  55. [ 8] Tai H., McHenry L., Fritz P.J., Furtek D.B.
  56.      Plant Mol. Biol. 16:913-915(1991).
  57.