home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ BCI NET 2 / BCI NET 2.iso / archives / demos / misc / prosite.lha / Prosite / data / PDOC00243 < prev    next >
Encoding:
Text File  |  1995-03-04  |  2.2 KB  |  57 lines
  1. *******************************
  2. * Endothelin family signature *
  3. *******************************
  4.  
  5. Endothelins (ET's) are a family  of  potent mammalian vasoconstrictor peptides
  6. [1,2,3]. Sarafotoxins (SRTX) and bibrotoxin (BTX) are  cardiotoxins  from  the
  7. venom of snakes of the Atractaspis family, structurally and functionally [4,5]
  8. similar to  endothelin.  The  peptides  currently  known  to  belonging to the
  9. ET/SRTX family are:
  10.  
  11.  - Endothelin 1 (ET-1).
  12.  - Endothelin 2 (ET-2) which  is  also known in mouse as Vasoactive Intestinal
  13.    Contractor (VIC).
  14.  - Endothelin 3 (ET-3).
  15.  - Sarafoxtoxins SRTX-A, -B, -C and -D from Atractaspis engaddensis.
  16.  - Bibrotoxin (BTX) from Atractaspis bibroni.
  17.  
  18. As shown in the  following schematic  representation, these peptides which are
  19. 21 residues long contain two intramolecular disulfide bonds.
  20.  
  21.                         +-------------+
  22.                         |             |
  23.                         CxCxxxxxxxCxxxCxxxxxx
  24.                           |       |
  25.                           +-------+
  26.  
  27. 'C': conserved cysteine involved in a disulfide bond.
  28.  
  29. As a  signature  pattern  for  this  family  of  proteins,  we  have taken the
  30. conserved residues in the disulfide loops region.
  31.  
  32. -Consensus pattern: C-x-C-x(4)-D-x(2)-C-x(2)-[FY]-C
  33.                     [The four C's are involved in disulfide bonds]
  34. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  35. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  36.  
  37. -Note: In addition to endothelin, the precursors of ETs contain an endothelin-
  38.  like domain which is also detected by this pattern.
  39. -Note: the precursor of sarafotoxins is  a  large  protein  that  contains  12
  40.  copies of various isoforms of the toxin [6].
  41.  
  42. -Last update: June 1994 / Text revised.
  43.  
  44. [ 1] Yanagisawa M., Masaki T.
  45.      Trends Pharmacol. Sci. 10:374-378(1989).
  46. [ 2] Simonson M.S., Dunn M.J.
  47.      FASEB J. 4:2989-3000(1990).
  48. [ 3] Rubanyi G.M., Parker Bothelho L.H.
  49.      FASEB J. 5:2713-2720(1991).
  50. [ 4] Kloog Y., Sokolovsky M.
  51.      Trends Pharmacol. Sci. 10:212-214(1989).
  52. [ 5] Sokolovsky M.
  53.      Trends Biochem. Sci. 16:261-264(1991).
  54. [ 6] Ducancel F., Gabrielssen V., Dupont C., Lajeunesse E., Bdolah A.,
  55.      Kochva E., Boulain J.C.C.
  56.      J. Biol. Chem. 268:3052-3055(1993).
  57.