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Text File  |  1995-03-04  |  1.9 KB  |  40 lines
  1. **********************************************
  2. * Interferon alpha and beta family signature *
  3. **********************************************
  4.  
  5. Interferons [1] are  proteins  which  produce antiviral  and antiproliferative
  6. responses in cells.  On the basis of their sequence interferons are classified
  7. into four  groups:  alpha,  alpha-II  (or  omega), beta, and gamma. Except for
  8. gamma-interferon, the sequence of all the others are related.
  9.  
  10. Trophoblast protein-1  (TP-1)  [2]    is  a  protein  implicated  in  maternal
  11. recognition of pregnancy.   It directly or indirectly prolongs the lifespan of
  12. the corpus luteum and prevents  a return to ovarian cyclicity.  It may also be
  13. implicated in immunoprotection of the conceptus.    TP-1 is closely related to
  14. alpha-II interferons.
  15.  
  16. A disulfide bond  is  one  of  the  best  conserved structural features of the
  17. proteins belonging to this family.  It is  found  in  all alpha, alpha-II, and
  18. beta interferons  (with the exception of mouse beta-interferon),  and probably
  19. also in TP-1.  The signature pattern  for this family of proteins includes one
  20. of the cysteines involved in this disulfide bond.
  21.  
  22. -Consensus pattern: [FY](2)-x-[GNR]-[LIVM]-x(2)-[FY]-L-x(7)-[CY]-A-W
  23. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  24. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  25.  
  26. -Note: except for mouse interferon-beta, all  proteins from this family have a
  27.  cysteine in position 10 of the pattern.
  28.  
  29. -Expert(s) to contact by email: Rubinstein M.
  30.                                 lvrub@wiccmail.weizmann.ac.il
  31.  
  32. -Last update: June 1994 / Pattern and text revised.
  33.  
  34. [ 1] Interferons and other regulated cytokines.
  35.      (In) de Maeyer E., de Maeyer-Guignard J., Eds., Wiley and Sons,
  36.      New-York, (1988).
  37. [ 2] Imakawa K., Hansen T.R., Malathy P.-V., Antony R.V., Polites H.G.,
  38.      Marotti K.R., Roberts R.M.
  39.      Mol. Endocrinol. 3:127-139(1989).
  40.