home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ BCI NET 2 / BCI NET 2.iso / archives / demos / misc / prosite.lha / Prosite / data / PDOC00212 < prev    next >
Encoding:
Text File  |  1995-03-04  |  3.5 KB  |  69 lines
  1. ***********************************************
  2. * Receptor tyrosine kinase class II signature *
  3. ***********************************************
  4.  
  5. A number of growth factors  stimulate mitogenesis by interacting with a family
  6. of   cell  surface receptors which   possess  an  intrinsic, ligand-sensitive,
  7. protein tyrosine kinase activity [1].   These  receptor tyrosine kinases (RTK)
  8. all share the same topology: an  extracellular ligand-binding domain, a single
  9. transmembrane  region and a cytoplasmic  kinase domain.   However  they can be
  10. classified into at least five groups.  The prototype for class II RTK's is the
  11. insulin receptor, a heterotetramer  of two alpha and two beta chains linked by
  12. disulfide  bonds.   The  alpha and beta  chains  are  cleavage  products  of a
  13. precursor molecule. The alpha chain contains the ligand binding site, the beta
  14. chain transverses  the  membrane  and  contains  the  tyrosine  protein kinase
  15. domain. The receptors currently known to belong to class II are:
  16.  
  17.  - The insulin receptor [2,3].
  18.  - The insulin growth factor I receptor from Human [4], and Drosophila [5].
  19.  - The insulin receptor-related receptor (IRR) [6],  which  is most probably a
  20.    receptor for a peptide belonging to the insulin family.
  21.  - The putative c-ros receptor [7].
  22.  - The Drosophila developmental protein sevenless [8], a putative receptor for
  23.    positional information required for the formation of  the  R7 photoreceptor
  24.    cells.
  25.  - The trk family of receptors [9,10], which are high  affinity  receptors for
  26.    nerve growth factor and related neurotrophic factors (BDNF and NT-3).
  27.  - The putative ltk receptor [11].
  28.  
  29. While only the insulin and the insulin growth factor I  receptors are known to
  30. exist in the tetrameric conformation specific to class II RTK's, all the above
  31. proteins share extensive homologies in their kinase domain,  especially around
  32. the putative  site  of  autophosphorylation.  Hence,  we developed a signature
  33. pattern for  this  class of RTK's, which includes the tyrosine residue, itself
  34. probably autophosphorylated.
  35.  
  36. -Consensus pattern: D-[LIV]-Y-x(3)-Y-Y-R
  37.                     [The second Y is the autophosphorylation site]
  38. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  39. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  40. -Last update: December 1992 / Text revised.
  41.  
  42. [ 1] Yarden Y., Ullrich A.
  43.      Annu. Rev. Biochem. 57:443-478(1988).
  44. [ 2] Ebina Y., Ellis L., Jarnagin K., Edery M., Graf L., Clauser E.,
  45.      Ou J.-H., Masiarz F., Kan Y.W., Goldfine I.D., Roth R.A., Rutter W.J.
  46.      Cell 40:747-758(1985).
  47. [ 3] Ullrich A., Bell J.R., Chen E.Y., Herrera R., Petruzzelli L.M.,
  48.      Dull T.J., Gray A., Coussens L., Liao Y.-C., Tsubokawa M., Mason A.,
  49.      Seeburg P.H., Grunfeld C., Rosen O.M., Ramachandran J.
  50.      Nature 313:756-761(1985).
  51. [ 4] Ullrich A., Gray A., Tam A.W., Yang-Feng T., Tsubokawa M., Collins C.,
  52.      Henzel W., Bon T.L., Kathuria S., Chen E., Jacobs S., Francke U.,
  53.      Ramachandran J., Fujita-Yamaguchi Y.
  54.      EMBO J. 5:2503-2512(1986).
  55. [ 5] Nishida Y., Hata M., Nishizuka Y., Rutter W.J., Ebina Y.
  56.      Biochem. Biophys. Res. Commun. 141:474-481(1986).
  57. [ 6] Shier P., Watt V.M.
  58.      J. Biol. Chem. 264:14605-14608(1989).
  59. [ 7] Matsushime H., Wang L.-H., Shibuya M.
  60.      Mol. Cell. Biol. 6:3000-3004(1986).
  61. [ 8] Hafen E., Basler K., Edstroem J.-E., Rubin G.M.
  62.      Science 236:55-63(1987).
  63. [ 9] Park M.
  64.      Curr. Biol. 1:248-250(1991).
  65. [10] Ragsdale C., Woodgett J.
  66.      Nature 350:660-661(1991).
  67. [11] Krolewski J.J., Dalla-Favera R.
  68.      EMBO J. 10:2911-2919(1991).
  69.