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Text File  |  1995-03-04  |  1.4 KB  |  29 lines
  1. **************************************
  2. * Class I metallothioneins signature *
  3. **************************************
  4.  
  5. Metallothioneins (MT) [1,2] are small proteins which bind heavy metals such as
  6. zinc, copper, cadmium, nickel, etc., through  clusters of thiolate bonds. MT's
  7. occur throughout the animal kingdom and are also found in higher plants, fungi
  8. and some prokaryotes.  On the basis of structural relationships MT's have been
  9. subdivided into three classes. Class I includes mammalian MT's as well as MT's
  10. from other phyla, but with clearly related primary structure.  Class II groups
  11. together MT's from various species such as  sea urchin,  yeast,  cyanobacteria
  12. which display none or only very distant correspondence to class I MT's.  Class
  13. III MT's are atypical polypeptides containing gamma-glutamylcysteinyl units.
  14.  
  15. Class I MT's are proteins of 57 to 64 amino acid residues, about  20  of these
  16. residues are cysteines. As a signature pattern we chose a region that spans 15
  17. residues and which contains six of the metal-binding cysteines, this region is
  18. located in the N-terminal section of class-I MT's.
  19.  
  20. -Consensus pattern: C-x(3)-C-x-C-x(2)-C-x-C-x(2)-C
  21. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  22. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  23. -Last update: April 1990 / Pattern and text revised.
  24.  
  25. [ 1] Hamer D.H.
  26.      Annu. Rev. Biochem. 55:913-951(1986).
  27. [ 2] Kagi J.H.R., Schaffer A.
  28.      Biochemistry 27:8509-8515(1988).
  29.