home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ BCI NET 2 / BCI NET 2.iso / archives / demos / misc / prosite.lha / Prosite / data / PDOC00163 < prev    next >
Encoding:
Text File  |  1995-03-04  |  1.4 KB  |  32 lines
  1. *********************************************
  2. * Ubiquitin-conjugating enzymes active site *
  3. *********************************************
  4.  
  5. Ubiquitin-conjugating  enzymes  (EC 6.3.2.19)   (UBC  or  E2 enzymes)  [1,2,3]
  6. catalyze the covalent attachment of ubiquitin to target proteins. An activated
  7. ubiquitin moiety is transferred from an ubiquitin-activating enzyme (E1) to E2
  8. which later ligates ubiquitin  directly  to substrate proteins with or without
  9. the assistance of 'N-end' recognizing proteins (E3).
  10.  
  11. In most species there are  many forms  of UBC  (at least 9 in yeast) which are
  12. implicated in diverse cellular functions.
  13.  
  14. A cysteine residue is  required for ubiquitin-thiolester formation. There is a
  15. single conserved  cysteine in UBC's and  the  region  around  that  residue is
  16. conserved in the sequence of known UBC isozymes.   We have used that region as
  17. a signature pattern.
  18.  
  19. -Consensus pattern: [FYWL]-H-[PC]-N-[LIV]-x(3,4)-G-x-[LIV]-C-[LIV]-x-[LIV]
  20.                     [C is the active site residue]
  21. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL,  except
  22.  for yeast UBC6 (DOA2).
  23. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  24. -Last update: June 1994 / Text revised.
  25.  
  26. [ 1] Jentsch S., Seufert W., Sommer T., Reins H.-A.
  27.      Trends Biochem. Sci. 15:195-198(1990).
  28. [ 2] Jentsch S., Seufert W., Hauser H.-P.
  29.      Biochim. Biophys. Acta 1089:127-139(1991).
  30. [ 3] Hershko A.
  31.      Trends Biochem. Sci. 16:265-268(1991).
  32.