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Text File  |  1995-03-04  |  1.1 KB  |  26 lines

  1. ******************************
  2. * Isocitrate lyase signature *
  3. ******************************
  4.  
  5. Isocitrate lyase (EC 4.1.3.1) [1,2] is an enzyme that catalyzes the conversion
  6. of isocitrate  to  succinate and glyoxylate.   This  is the  first step in the
  7. glyoxylate bypass, an alternative to the tricarboxylic acid cycle in bacteria,
  8. fungi and plants.
  9.  
  10. A cysteine,  a  histidine  and  a glutamate or aspartate have been found to be
  11. important for  the  enzyme's  catalytic activity. Only one cysteine residue is
  12. conserved between the sequences of the fungal, plant and bacterial enzymes; it
  13. is located in the middle of a perfectly conserved hexapeptide that can be used
  14. as a signature pattern for this type of enzyme.
  15.  
  16. -Consensus pattern: K-K-C-G-H-M
  17.                     [C is a putative active site residue]
  18. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  19. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  20. -Last update: May 1991 / Text revised.
  21.  
  22. [ 1] Beeching J.R.
  23.      Protein Seq. Data Anal. 2:463-466(1989).
  24. [ 2] Atomi H., Ueda M., Hikida M., Hishida T., Teranishi Y., Tanaka A.
  25.      J. Biochem. 107:262-266(1990).
  26.