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Text File  |  1995-03-04  |  1.4 KB  |  33 lines
  1. *******************************************************
  2. * 3'5'-cyclic nucleotide phosphodiesterases signature *
  3. *******************************************************
  4.  
  5. 3'5'-cyclic nucleotide phosphodiesterases (EC 3.1.4.17) (PDEases) catalyze the
  6. hydrolysis of cAMP  or cGMP to the  corresponding nucleoside 5' monophosphates
  7. [1]. There are at least five different forms of PDEases [2]:
  8.  
  9.  - Type 1, calmodulin/calcium-dependent PDEases.
  10.  - Type 2, cGMP-stimulated PDEases.
  11.  - Type 3, cGMP-inhibited PDEases.
  12.  - Type 4, cAMP-specific PDEases.
  13.  - Type 5, cGMP-specific PDEases.
  14.  
  15. All of these forms seem to  share a conserved domain of about 270 residues. We
  16. have derived a signature  pattern  from a stretch of 12 residues that contains
  17. two conserved histidines.
  18.  
  19. -Consensus pattern: H-D-[LIVMFY]-x-H-x-[AG]-x(2)-N-x-[LIVMFY]
  20. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  21. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  22.  
  23. -Note: slime mold extracellular PDEase  and  yeast  low-affinity  PDEase (gene
  24.  PDE1) do not show any similarity with the above enzymes and belong to another
  25.  class of PDEases (see the relevant section).
  26.  
  27. -Last update: December 1991 / Text revised.
  28.  
  29. [ 1] Charbonneau H., Beier N., Walsh K.A., Beavo J.A.
  30.      Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 83:9308-9312(1986).
  31. [ 2] Beavo J.A., Reifsnyder D.H.
  32.      Trends Pharmacol. Sci. 11:150-155(1990).
  33.