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Text File  |  1995-03-04  |  1.6 KB  |  37 lines
  1. ***********************************************
  2. * 'Homeobox' engrailed-type protein signature *
  3. ***********************************************
  4.  
  5. Most proteins  which contain a 'homeobox' domain  can  be classified [1,2], on
  6. the basis of their sequence characteristics, in three  subfamilies: engrailed,
  7. antennapedia and paired.   Proteins currently known to belong to the engrailed
  8. subfamily are:
  9.  
  10.  - Drosophila segmentation polarity protein engrailed (en) which specifies the
  11.    body segmentation  pattern  and  is  required  for  the  development of the
  12.    central nervous system.
  13.  - Drosophila invected protein (inv).
  14.  - Silk moth proteins engrailed and invected,  which  may  be  involved in the
  15.    compartmentalization of the silk gland.
  16.  - Honeybee E30 and E60.
  17.  - Grasshopper (Schistocerca americana) G-En.
  18.  - Mammalian and birds En-1 and En-2.
  19.  - Zebrafish  Eng-1, -2 and -3.
  20.  - Sea urchin (Tripneusteas gratilla) SU-HB-en.
  21.  - Leech (Helobdella triserialis) Ht-En.
  22.  
  23. Engrailed homeobox proteins are characterized  by  the presence of a conserved
  24. region of  some  20  amino-acid  residues  located  at  the  C-terminal of the
  25. 'homeobox' domain.  As  a signature pattern for this subfamily of proteins, we
  26. have used a stretch of eight perfectly conserved residues in this region.
  27.  
  28. -Consensus pattern: L-M-A-Q-G-L-Y-N
  29. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  30. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  31. -Last update: October 1993 / Text revised.
  32.  
  33. [ 1] Scott M.P., Tamkun J.W., Hartzell G.W. III
  34.      Biochim. Biophys. Acta 989:25-48(1989).
  35. [ 2] Gehring W.J.
  36.      Science 236:1245-1252(1987).
  37.