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Text File  |  1995-03-04  |  3.5 KB  |  65 lines
  1. **************************************
  2. * Phosphopantetheine attachment site *
  3. **************************************
  4.  
  5. Phosphopantetheine (or pantetheine 4' phosphate) is  the  prosthetic  group of
  6. acyl carrier proteins (ACP) in some  multienzyme complexes  where it serves as
  7. a 'swinging  arm'  for  the  attachment of activated fatty acid and amino-acid
  8. groups [1].  Phosphopantetheine  is  attached  to  a  serine  residue in these
  9. proteins [2].  ACP  proteins  or   domains  have  been found in various enzyme
  10. systems which  are  listed  below  (references  are only provided for recently
  11. determined sequences).
  12.  
  13.  - Fatty acid synthetase (FAS),  which catalyzes  the formation  of long-chain
  14.    fatty acids    from  acetyl-CoA, malonyl-CoA and NADPH. Bacterial and plant
  15.    chloroplast FAS are composed of eight separate subunits which correspond to
  16.    the  different  enzymatic  activities;  ACP  is  one of these polypeptides.
  17.    Fungal FAS consists of two multifunctional proteins, FAS1 and FAS2; the ACP
  18.    domain is  located  in  the  N-terminal  section  of  FAS2.  Vertebrate FAS
  19.    consists of a single  multifunctional  enzyme;  the ACP  domain  is located
  20.    between the beta-ketoacyl reductase  domain and the C-terminal thioesterase
  21.    domain [3].
  22.  - Polyketide antibiotics  synthase enzyme systems.  Polyketides are secondary
  23.    metabolites produced from simple fatty acids, by microorganisms and plants.
  24.    ACP is one of the polypeptidic  components  involved in the biosynthesis of
  25.    the Streptomyces polyketide antibiotics granatacin [4] and tetracenomycin C
  26.    [5].
  27.  - The multifunctional 6-methysalicylic acid synthase (MSAS) from  Penicillium
  28.    patulum [6].  This is a multifunctional enzyme involved in the biosynthesis
  29.    of a polyketide antibiotic and  which  contains an  ACP  domain  in  the C-
  30.    terminal extremity.
  31.  - The multifunctional mycocerosic acid synthase from Mycobacterium bovis [7].
  32.  - Fungal mitochondrial ACP [8], which  is  part of the respiratory chain NADH
  33.    dehydrogenase (complex I).
  34.  - Rhizobium nodulation protein nodF,  which  probably  acts  as an ACP in the
  35.    synthesis of the nodulation Nod factor fatty acyl chain.
  36.  
  37. The sequence around the phosphopantetheine attachment site is conserved in all
  38. these proteins and can be used as a signature pattern.
  39.  
  40. -Consensus pattern: [LIVY]-G-[LIVMFYAG]-[DK]-S-[LIVMT]-x(3)-[DET]-x(4)-[LIVMF]
  41.                     [S is the pantetheine attachment site]
  42. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL,  except
  43.  for Anabaena variabilis ACP which has Gln in position 2 of the pattern.
  44. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: phage lambda recombination  protein
  45.  bet and Listeria monocytogenes internalin A.
  46. -Last update: June 1994 / Pattern and text revised.
  47.  
  48. [ 1] Concise Encyclopedia Biochemistry, Second Edition, Walter de Gruyter,
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  65.