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Encoding:
Text File  |  1991-09-16  |  1.5 KB  |  32 lines
  1. DNA       * EXTENSION FOR DNA FILES
  2. EIW       * EXTENSION FOR PROTEIN FILES
  3. Own1      * NAME FOR FIRST CHANGEBLE COMPARISON TABLE
  4. Own2      * NAME FOR SECOND CHANGEBLE COMPARISON TABLE
  5. Own3      * NAME FOR THIRD CHANGEBLE COMPARISON TABLE
  6. 21        * DEFAULT WINDOW SIZE FOR DNA
  7. 14        * DEFAULT SCORE FOR DNA
  8. 8         * DEFAULT WINDOW SIZE FOR PROTEIN
  9. 5         * DEFAULT SCORE FOR PROTEIN
  10. 8         * DEFAULT WINDOW SIZE FOR PROTEIN - JIMENEZ
  11. 7         * DEFAULT SCORE FOR PROTEIN -JIMENEZ
  12. 8         * DEFAULT WINDOW SIZE FOR PROTEIN - DAYHOFF
  13. 10        * DEFAULT SCORE FOR PROTEIN -DAYHOFF
  14. 8         * DEFAULT WINDOW SIZE FOR PROTEIN - OWN1
  15. 10        * DEFAULT SCORE FOR PROTEIN -OWN2
  16. 8         * DEFAULT WINDOW SIZE FOR PROTEIN - OWN2
  17. 7         * DEFAULT SCORE FOR PROTEIN -OWN2
  18. 8         * DEFAULT WINDOW SIZE FOR PROTEIN - OWN3
  19. 5         * DEFAULT SCORE FOR PROTEIN -OWN3
  20. This scoretable is identical to         * LINE 1 COMMENTS OWN1
  21. that of Dayhoff.                        * LINE 2
  22.                                         * LINE 3
  23.                                         * LINE 4
  24. This scoretable is a cross between      * LINE 1 COMMENTS OWN2
  25. that of Dayhoff and that of Jimenez.    * LINE 2
  26.                                         * LINE 3
  27.                                         * LINE 4
  28. This scoretable just gives the          * LINE 1 COMMENTS OWN3
  29. normal picture.                         * LINE 2
  30.                                         * LINE 3
  31.                                         * LINE 4
  32.