home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ Crawly Crypt Collection 1 / crawlyvol1.bin / apps / science / clustalv / matrices.h < prev    next >
Text File  |  1993-04-11  |  2KB  |  68 lines
  1.  
  2. char pam250mt[]={
  3. 12,
  4.  0, 2,
  5. -2, 1, 3,
  6. -3, 1, 0, 6,
  7. -2, 1, 1, 1, 2,
  8. -3, 1, 0,-1, 1, 5,
  9. -4, 1, 0,-1, 0, 0, 2,
  10. -5, 0, 0,-1, 0, 1, 2, 4,
  11. -5, 0, 0,-1, 0, 0, 1, 3, 4,
  12. -5,-1,-1, 0, 0,-1, 1, 2, 2, 4,
  13. -3,-1,-1, 0,-1,-2, 2, 1, 1, 3, 6,
  14. -4, 0,-1, 0,-2,-3, 0,-1,-1, 1, 2, 6,
  15. -5, 0, 0,-1,-1,-2, 1, 0, 0, 1, 0, 3, 5,
  16. -5,-2,-1,-2,-1,-3,-2,-3,-2,-1,-2, 0, 0, 6,
  17. -2,-1, 0,-2,-1,-3,-2,-2,-2,-2,-2,-2,-2, 2, 5,
  18. -6,-3,-2,-3,-2,-4,-3,-4,-3,-2,-2,-3,-3, 4, 2, 6,
  19. -2,-1, 0,-1, 0,-1,-2,-2,-2,-2,-2,-2,-2, 2, 4, 2, 4,
  20. -4,-3,-3,-5,-4,-5,-4,-6,-5,-5,-2,-4,-5, 0, 1, 2,-1, 9,
  21.  0,-3,-3,-5,-3,-5,-2,-4,-4,-4, 0,-4,-4,-2,-1,-1,-2, 7,10,
  22. -8,-2,-5,-6,-6,-7,-4,-7,-7,-5,-3, 2,-3,-4,-5,-2,-6, 0, 0,17 };
  23.  
  24. char idmat[]={
  25. 10,
  26.  0, 10,
  27.  0, 0, 10,
  28.  0, 0, 0, 10,
  29.  0, 0, 0, 0, 10,
  30.  0, 0, 0, 0, 1, 10,
  31.  0, 0, 0, 0, 0, 0, 10,
  32.  0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 10,
  33.  0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 10,
  34.  0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 10,
  35.  0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 10,
  36.  0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 10,
  37.  0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 10,
  38.  0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 10,
  39.  0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 10,
  40.  0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 10,
  41.  0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 10,
  42.  0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 10,
  43.  0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,10,
  44.  0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,10};
  45.  
  46.  
  47.  char pam100mt[]={
  48.  14,
  49.  -1, 6,
  50.  -5, 2,  7,
  51.  -6, 1, -1, 10,
  52.  -5, 2,  2,  1,  6,
  53.  -8, 1, -3, -3,  1,  8,
  54.  -8, 2,  0, -3, -1, -1, 7,
  55. -11,-1, -2, -4, -1, -1, 4,  8,
  56. -11,-2, -3, -3,  0, -2, 1,  5,  8,
  57. -11,-3, -3, -1, -2, -5,-1,  1,  4,  9,
  58.  -6,-4, -5, -2, -5, -7, 2, -1, -2,  4,11,
  59.  -6,-1, -4, -2, -5, -8,-3, -6, -5,  1, 1, 10,
  60. -11,-2, -1, -4, -4, -5, 1, -2, -2, -1,-3,  3,  8,
  61. -11,-4, -2, -6, -3, -8,-5, -8, -6, -2,-7, -2,  1, 13,
  62.  -5,-4, -1, -6, -3, -7,-4, -6, -5, -5,-7, -4, -4,  2,  9,
  63. -12,-7, -5, -5, -5, -8,-6, -9, -7, -3,-5, -7, -6,  4,  2, 9,
  64.  -4,-4, -1, -4,  0, -4,-5, -6, -5, -5,-6, -6, -6,  1,  5, 1,  8,
  65. -10,-5, -6, -9, -7, -8,-6,-11,-11,-10,-4, -7,-11, -2,  0, 0, -5,12,
  66.  -2,-6, -6,-11, -6,-11,-3, -9, -7, -9,-1,-10,-10, -8, -4,-5, -6, 6,13,
  67. -13,-4,-10,-11,-11,-13,-8,-13,-14,-11,-7,  1, -9,-11,-12,-7,-14,-2,-2,19 };
  68.